转录组学分析揭示雄性ApoE-/-小鼠主动脉粥样硬化中与巨噬细胞自噬溶酶体相关的关键基因

目的：动脉粥样硬化（AS）是心脑血管疾病最常见的原因。然而，动脉粥样硬化斑块进展的机制仍不清楚。本研究旨在探讨ApoE−/−雄性小鼠主动脉中与动脉粥样硬化发展相关的基因，这些基因可作为阻止斑块进展干预措施的新型生物标志物和治疗靶点。方法：将8周龄ApoE−/−小鼠喂食正常纯化实验室饲料或西方饮食（WD）6周或22周。利用高通量测序技术分析了四组暴露于不同饮食条件的小鼠主动脉的转录组。我们从基因表达综合（GEO）数据库检索并下载了人类动脉硬化疾病芯片数据集GSE100927，并选取29例颈动脉粥样硬化病变和12例正常颈动脉组织分别作为实验组和对照组，以进一步验证我们的数据集。此外，我们使用定量逆转录聚合酶链反应（QT-PCR）验证了动脉粥样硬化小鼠模型中核心基因的表达水平。结果：ApoE−/−雄性小鼠AS22W组与Sham22W组之间有265个差异表达基因（DEGs）。除了众所周知的炎症和免疫反应激活外，自噬-溶酶体系统也是影响动脉粥样硬化发展的重要因素。我们在蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络中鉴定了五个与自噬体密切相关的核心基因（Atp6ap2、Atp6v0b、Atp6v0d2、Atp6v1a和Atp6v1d）。Hub基因在GSE100927数据集的颈动脉粥样硬化组中高表达（P < 0.001）。QT-PCR显示，在ApoE−/−雄性小鼠动脉粥样硬化斑块发展过程中，Atp6v0d2的RNA水平显著增加。结论：通过生物信息学技术筛选并鉴定了五个通过自噬-溶酶体系统影响主动脉粥样硬化发展的核心基因，尤其是Atp6v0d2。