临床样本分析
比较URSA患者与正常对照蜕膜组织中焦亡相关蛋白和巨噬细胞亚群的差异。
收集URSA和正常早孕蜕膜组织,通过Western blot检测GSDMD、GSDMD-N、pro-caspase-1、mature caspase-1表达,流式细胞术分析巨噬细胞总数、存活/死亡比例及M1/M2比例。
Investigation into the role of the MITA-TRIM38 interaction in regulating pyroptosis and maintaining immune tolerance at the maternal-fetal interface.
包含临床样本(URSA与正常对照蜕膜组织)、体外细胞模型(THP-1极化巨噬细胞及293T细胞)、分子机制验证(Co-IP、泛素化分析、基因敲低)等多个独立证据层级。
URSA患者蜕膜组织和正常早孕蜕膜组织 THP-1细胞极化的M1和M2巨噬细胞 293T细胞(外源过表达)
URSA组与对照组蜕膜组织中MITA和焦亡相关蛋白表达差异 M1和M2巨噬细胞中MITA和TRIM38的K48泛素化水平 TRIM38和MITA敲低后M1/M2巨噬细胞的焦亡和极化变化 VX765抑制caspase-1对M1巨噬细胞焦亡和MITA表达的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较URSA患者与正常对照蜕膜组织中焦亡相关蛋白和巨噬细胞亚群的差异。
收集URSA和正常早孕蜕膜组织,通过Western blot检测GSDMD、GSDMD-N、pro-caspase-1、mature caspase-1表达,流式细胞术分析巨噬细胞总数、存活/死亡比例及M1/M2比例。
检测URSA与对照蜕膜组织中MITA、TRIM38的表达和K48泛素化水平,并验证两者相互作用。
通过IHC、IF、Western blot、qPCR检测MITA和TRIM38表达;通过免疫沉淀检测泛素化水平,Co-IP检测TRIM38与MITA的内源相互作用。
建立M1和M2巨噬细胞模型,验证焦亡相关蛋白表达和MITA的泛素化差异。
THP-1细胞经PMA诱导为M0,再用IFN-γ和LPS极化M1,IL-4和IL-13极化M2;检测上清液中焦亡蛋白表达,细胞内MITA和TRIM38表达及泛素化水平,Co-IP验证相互作用。
验证TRIM38的RING、B-box和SPRY结构域对与MITA相互作用及K48泛素化的影响。
在293T细胞中共转染Flag-TRIM38(野生型及缺失突变体)与HA-MITA、His-K48,通过Co-IP检测相互作用和泛素化。
探讨抑制焦亡对MITA表达、K48泛素化及M1向M2转化的影响。
在M1极化过程中加入caspase-1抑制剂VX765,检测焦亡细胞形态、GSDMD-N、caspase-1表达,MITA和cGAS表达,MITA的K48泛素化,以及M1/M2标志物变化。
验证TRIM38和MITA在巨噬细胞焦亡和极化中的功能。
用慢病毒敲低THP-1细胞中的TRIM38和/或MITA,极化M1/M2后检测K48泛素化水平、MITA表达、GSDMD-N水平及极化效率。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养和极化 | RPMI 1640培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 4-羟乙基哌嗪乙磺酸 | Gibco | -- | |
| 佛波醇12-豆蔻酸13-乙酸酯 | Sigma | P1585 | |
| 细胞极化 | 干扰素-γ | R&D Systems | 285-IF |
| 脂多糖 | Sigma | L2630 | |
| 白细胞介素4 | R&D Systems | 204-IL | |
| 白细胞介素13 | R&D Systems | 213-ILB | |
| 药物处理 | 贝纳卡桑 | MCE | HY13205 |
| 二甲基亚砜 | -- | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| Opti-MEM培养基 | Gibco | -- | |
| 细胞转染 | PEI MAX转染试剂 | SenGene | -- |
| 流式细胞术 | CD14抗体 | BD Biosciences | 12-0149-42 |
| CD86抗体 | Biolegend | 305412 | |
| CD209抗体 | Biolegend | 330104 | |
| 活死细胞染料FVS780 | BD Biosciences | 565388 | |
| 牛血清白蛋白 | Merck | V900933 | |
| FACSAria III流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| qPCR | TRIzol试剂 | TaKaRa | -- |
| cDNA逆转录试剂盒 | TaKaRa | -- | |
| SYBR Green PCR预混液 | TaKaRa | -- | |
| QuantStudio5实时荧光定量PCR系统 | Thermo Fisher | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | GBCBIO Technologies | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Solarbio | -- | |
| 增强化学发光试剂 | Millipore | -- | |
| 抗MITA抗体 | Abcam | 239074 | |
| 抗TRIM38抗体 | Invitrogen | MA5-26235 | |
| 抗caspase-1抗体 | Abcam | 207802 | |
| 抗cleaved GSDMD-N端抗体 | Abcam | 215203 | |
| 抗GSDMD抗体 | Abcam | 210070 | |
| 抗cGAS抗体 | Abcam | 302617 | |
| 抗GAPDH抗体 | Abcam | 181602 | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG | Abcam | 6721 | |
| HRP标记的山羊抗小鼠IgG | Abcam | 6789 | |
| 免疫共沉淀 | 抗Flag抗体 | CST | 2368 |
| 抗HA抗体 | Abcam | 236632 | |
| 抗His抗体 | CST | #12698 | |
| 磁珠 | MCE | -- | |
| 正常兔IgG | CST | 2729 | |
| 免疫组织化学 | 抗MITA抗体 | Abcam | 239074 |
| 抗TRIM38抗体 | Invitrogen | MA5-26235 | |
| 山羊抗兔二抗 | SeraCare | 5220-0336 | |
| 山羊抗小鼠二抗 | SeraCare | 5220-0341 | |
| 苏木素 | -- | -- | |
| 免疫荧光 | 抗CD206抗体 | Proteintech | 60143-1-Ig |
| Alexa Fluor 488酪酰胺 | -- | -- | |
| 抗CD80抗体 | Bioss | bs-1035R | |
| Cy3酪酰胺 | -- | -- | |
| 抗TRIM38抗体 | Invitrogen | 334BAA80 | |
| Cy5酪酰胺 | -- | -- | |
| 抗MITA抗体 | Abcam | ab239073 | |
| 显微镜 | Olympus BX50荧光显微镜 | Olympus | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本收集 | URSA组和对照组各4例,患者年龄、停经天数、HCG阳性,URSA组有反复流产史,对照组正常早孕人工流产。 阅读提示:Materials and methods: Collection of clinical samples |
| 细胞极化 | THP-1细胞浓度106/ml,PMA 100 ng/ml诱导M0 24小时;M1极化:IFN-γ 20 ng/ml、LPS 10 pg/ml,48小时;M2极化:IL-4 20 ng/ml、IL-13 20 ng/ml,48小时。 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and polarization and VX765 treatment |
| VX765处理 | VX765工作浓度25 μM,DMSO作为溶剂对照,与IFN-γ和LPS同时加入。 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and polarization and VX765 treatment |
| 敲低实验 | 慢病毒敲低TRIM38(Santa Cruz #sc-95352-V)和MITA(GenePharma #D01001),MOI 1:100。 阅读提示:Materials and methods: Knockdown of TRIM38 and MITA in THP-1 cells |
| 蛋白检测 | Western blot抗体:MITA (#239074 Abcam)、TRIM38 (#MA5-26235 Invitrogen)、GSDMD (#210070 Abcam)、GSDMD-N (#215203 Abcam)、caspase-1 (#207802 Abcam)、cGAS (#302617 Abcam)。 阅读提示:Materials and methods: Western blotting |