临床样本中ITGA2、EMT标志物和PD-L1的表达分析
评估ITGA2、E-cadherin和PD-L1在胰腺癌肿瘤和间质区域的表达水平及其与临床病理特征的相关性。
对62例胰腺癌术后标本进行多重免疫荧光染色,定量分析ITGA2、E-cadherin和PD-L1阳性细胞密度,并分析其与临床病理参数的相关性。
High expression ITGA2 affects the expression of MET, PD-L1, CD4 and CD8 with the immune microenvironment in pancreatic cancer patients.
包括临床样本的免疫组化和多重免疫荧光,以及细胞功能实验(迁移、侵袭)和分子机制验证(Western blot、RT-qPCR),但缺乏动物实验和更深入的机制验证。
胰腺癌组织样本(62例) 人胰腺癌细胞系SW1990 人胰腺癌细胞系PANC-1 人正常胰腺导管上皮细胞HPDE-C7
62例胰腺癌患者手术切除标本,用于免疫组化和多重免疫荧光检测ITGA2、E-cadherin、PD-L1、CD4、CD8表达。 SW1990细胞系用于敲低ITGA2(sh-ITGA2-927),进行迁移和侵袭实验。 Transwell实验使用8μm孔径的Corning Costar插入小室,迁移实验未包被Matrigel,侵袭实验包被Matrigel(1:8稀释)。 Western blot检测ITGA2、E-cadherin、N-cadherin、Snail1、PD-L1蛋白表达。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估ITGA2、E-cadherin和PD-L1在胰腺癌肿瘤和间质区域的表达水平及其与临床病理特征的相关性。
对62例胰腺癌术后标本进行多重免疫荧光染色,定量分析ITGA2、E-cadherin和PD-L1阳性细胞密度,并分析其与临床病理参数的相关性。
比较胰腺癌组织和癌旁组织中ITGA2、CD4和CD8的表达差异,并评估其与患者总生存期的关系。
通过免疫组化检测62例胰腺癌组织和癌旁组织中ITGA2、CD4和CD8的表达,进行相关性分析和生存分析(Kaplan-Meier)。
比较正常胰腺导管上皮细胞和胰腺癌细胞系中ITGA2的表达水平。
通过Western blot检测HPDE-C7、PANC-1和SW1990细胞中ITGA2蛋白表达。
验证ITGA2对胰腺癌细胞增殖、迁移和侵袭能力的影响。
使用shRNA(sh-ITGA2-927)转染SW1990细胞,通过细胞迁移实验和Transwell侵袭实验评估细胞迁移和侵袭能力。
探讨ITGA2是否调控EMT标志物和PD-L1的表达。
在SW1990细胞中敲低ITGA2后,通过Western blot和RT-qPCR检测E-cadherin、N-cadherin、Snail和PD-L1的表达变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 高糖DMEM培养基 | Servicebio | -- |
| 胎牛血清 | PROCELL | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Servicebio | -- | |
| MycoAlert支原体检测试剂盒 | Westburg | -- | |
| 转染 | Lipo8000TM转染试剂 | Beyotime | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Epizyme Biotech | -- |
| BCA蛋白定量试剂 | Epizyme Biotech | -- | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| ECL化学发光试剂盒 | Fdbio Science | -- | |
| RT-qPCR | RNAqueous微量RNA提取试剂盒 | Ambion; Thermo Fisher Scientific | AM 1931 |
| High-capacity cDNA逆转录试剂盒 | Applied Biosystems; Thermo Fisher Scientific | 4368814 | |
| ChamQ SYBR qPCR预混液 | Vazyme Biotech | Q311-02 | |
| 多重免疫荧光 | E-cadherin抗体 | Servicebio | GB14076 |
| CY3-TSA溶液 | Servicebio | G1223 | |
| EDTA抗原修复液 | Servicebio | G1206 | |
| PD-L1抗体 | Servicebio | GB114196 | |
| FITC-TSA溶液 | Servicebio | G1222 | |
| ITGA2抗体 | bioss | BSM-52613R | |
| CY5标记二抗 | Servicebio | G1232 | |
| DAPI染液 | Servicebio | G1012 | |
| 免疫组化 | ITGA2单克隆抗体 | bioss | BSM-52613R |
| CD4单克隆抗体 | bioss | bsm-52469R | |
| CD8单克隆抗体 | bioss | bs-23447R | |
| 二抗IgG聚合物 | bioss | bs-0295G | |
| Western blot | ITGA2兔单克隆抗体 | bioss | bs-10132R |
| E-cadherin兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 3195S | |
| N-cadherin兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 13116S | |
| Snail1兔多克隆抗体 | ZEN-BIOSCIENCE | 340942 | |
| PD-L1兔单克隆抗体 | ZEN-BIOSCIENCE | R30023 | |
| HRP标记山羊抗兔二抗 | Epizyme Biotech | LF102 | |
| 细胞侵袭实验 | 基质胶 | BD | -- |
| 结晶紫染色液 | Solarbio | -- | |
| 组织扫描 | PANNORAMIC全景切片扫描仪 | 3DHISTECH | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本分析 | 62例胰腺癌患者的组织标本,包括肿瘤和间质区域;多重免疫荧光和免疫组化检测ITGA2、E-cadherin、PD-L1、CD4、CD8的抗体浓度(如ITGA2 1:200, PD-L1 1:3000等)和抗原修复条件;阳性细胞密度定量方法和统计相关性分析。 阅读提示:Methods中的Patient population and tissue sampling、Multiplexed immunofluorescence staining protocol、Immunohistochemical,以及Figure legends 1-4 |
| 细胞实验 | SW1990细胞系的培养条件(高糖DMEM+10%FBS+1%双抗);sh-ITGA2-927质粒转染(Lipo8000TM);转染后48小时进行实验;细胞迁移和侵袭实验的具体参数(细胞密度、Transwell孔径、Matrigel浓度、染色等)。 阅读提示:Methods中的Cells and culture conditions、Plasmids transfection、Cell migration、Cell invasion assay |
| 分子检测 | Western blot和RT-qPCR的引物序列、抗体稀释度、内参GAPDH;sh-ITGA2敲低后检测E-cadherin、N-cadherin、Snail、PD-L1的表达;RT-qPCR反应条件(95℃变性,58℃退火等)。 阅读提示:Methods中的Western blot analysis、Reverse transcription-quantitative PCR,以及图注5和6 |
| 生存分析 | 62例胰腺癌患者的随访时间(3-64个月),ITGA2、CD4、CD8的表达分级与总生存期的关系;Kaplan-Meier生存曲线和log-rank检验。 阅读提示:Results中的Prognostic significance of ITGA2, CD4 and CD8 in pancreatic cancer,以及Figure 4C-E |