DAZL基因克隆与序列分析
获取合作猪DAZL基因的CDS序列并分析其分子特征。
从合作猪睾丸组织提取总RNA,逆转录为cDNA,通过RT-PCR扩增DAZL CDS区域,连接至pMD19-T载体并转化大肠杆菌DH5α,筛选阳性克隆测序,并进行生物信息学分析。
Cloning, expression analysis and localization of DAZL gene implicated in germ cell development of male Hezuo pig.
包含RT-PCR克隆、qRT-PCR、Western blot和免疫组化等表达与定位分析,但缺乏功能验证或机制验证实验。
合作猪睾丸组织(30 d、90 d、120 d、180 d、240 d) E.coli DH5α感受态细胞(用于克隆)
组织样本来自合作猪五个发育阶段(30 d、90 d、120 d、180 d、240 d)的睾丸 qRT-PCR使用β-actin作为内参基因,采用2−ΔΔCt法计算相对表达量 Western blot使用anti-DAZL抗体(ab215718,1:1000)和anti-beta-actin(bs-0061R,1:2000) 免疫组化使用anti-DAZL抗体(ab215718,1:1000),以PBS替代一抗作为阴性对照 统计采用单因素方差分析,p<0.05为显著,p<0.01为极显著
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获取合作猪DAZL基因的CDS序列并分析其分子特征。
从合作猪睾丸组织提取总RNA,逆转录为cDNA,通过RT-PCR扩增DAZL CDS区域,连接至pMD19-T载体并转化大肠杆菌DH5α,筛选阳性克隆测序,并进行生物信息学分析。
检测DAZL在合作猪不同组织中的表达特异性。
提取睾丸、心、肝、脾、肺、肾等组织的RNA,通过qRT-PCR检测DAZL mRNA相对表达水平。
分析DAZL在合作猪五个发育阶段睾丸中的表达变化。
对30 d、90 d、120 d、180 d、240 d睾丸组织进行qRT-PCR和Western blot检测,比较不同阶段DAZL mRNA和蛋白的表达差异。
确定DAZL蛋白在合作猪睾丸不同发育阶段的细胞类型定位。
对五个发育阶段的睾丸组织进行HE染色和免疫组化染色,观察组织形态及DAZL蛋白的细胞定位。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| RNA提取 | TransZol Up试剂 | TransGen Biotech | -- |
| 分光光度计 | Thermo Scientific | -- | |
| cDNA合成 | PrimeScript™ RT试剂盒(含gDNA Eraser) | TaKaRa | -- |
| PCR产物纯化 | TIANgel Midi 纯化试剂盒 | TransGen Biotech | -- |
| 克隆载体连接 | pMD™19-T载体克隆试剂盒 | TaKaRa | -- |
| 转化 | 大肠杆菌DH5α感受态细胞 | TransGen Biotech | -- |
| qRT-PCR | 2×SYBR Premix Ex Taq | Takara | -- |
| LightCycler 480II 荧光定量PCR仪 | Roche | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Solarbio | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| 抗DAZL抗体 | Abcam | ab215718 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Bioss | bs-0061R | |
| HRP标记二抗 | Bioss | -- | |
| 增强化学发光试剂盒 | NCM Biotech | -- | |
| 免疫组化 | Histostain™-Plus试剂盒 | Bioss | -- |
| 抗DAZL抗体 | Abcam | ab215718 | |
| DAB显色试剂盒 | Bioss | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型和组织采集 | 合作猪为公猪,五个发育阶段:30 d、90 d、120 d、180 d、240 d,每个阶段3头;睾丸采集后一部分-80°C保存,一部分4%多聚甲醛固定。 阅读提示:Materials and Methods - Experimental animals and design |
| 基因克隆 | RT-PCR使用DAZL特异性引物(XM_003358321.3),PCR体系含2 µL cDNA、1 µL各引物、10 µL 2×Taq PCR Master Mix、6 µL ddH2O;PCR程序为95°C 5min,30个循环(94°C 30s,58°C 30s,72°C 1min),72°C 10min。 阅读提示:Materials and Methods - Full-length cDNA cloning of DAZL gene, Table 1 |
| qRT-PCR | 引物序列见表1,β-actin为内参;反应体系20 µL,含2 µL cDNA,0.8 µL各引物(10 µM),10 µL 2×SYBR Premix Ex Taq,6.4 µL ddH2O;反应程序:95°C 3min,40个循环(95°C 15s,60°C 15s,72°C 20s);三个技术重复和三个生物学重复,2−ΔΔCt法计算表达量。 阅读提示:Materials and Methods - Quantitative real-time polymerase chain reaction (qRT-PCR) |
| Western blot | 蛋白提取使用RIPA裂解液和PMSF;BCA法定量;蛋白上样量20 μg,12% SDS-PAGE,转PVDF膜;一抗:anti-DAZL (ab215718,1:1000) 和anti-beta-actin (bs-0061R,1:2000) 4°C过夜;二抗:HRP标记1:2000,37°C 2h;ECL显色。 阅读提示:Materials and Methods - Western blot |
| 免疫组化 | 石蜡切片脱蜡、抗原修复(0.01 mol/L柠檬酸钠),3% H2O2消除内源性过氧化物酶;封闭30 min,一抗:anti-DAZL (ab215718,1:1000) 4°C过夜;二抗和HRP-链霉亲和素,DAB显色,苏木精复染;阴性对照以PBS替代一抗。 阅读提示:Materials and Methods - Immunohistochemistry |