构建Menin表达改变模型
验证Menin表达水平对肝细胞代谢相关基因表达的影响。
在NCTC-1469细胞中转染Men1过表达质粒(mMen1)或Men1-siRNA(si-Men1),并检测Menin mRNA和蛋白水平的变化。
Menin orchestrates hepatic glucose and fatty acid uptake via deploying the cellular translocation of SIRT1 and PPARγ.
实验包含体外肝细胞模型(NCTC-1469)、油酸诱导脂肪肝细胞模型和奶牛脂肪肝组织样本,并进行了功能验证(过表达/敲低)和机制验证(ChIP、免疫共沉淀、亚细胞定位分析)。
小鼠肝细胞系NCTC-1469 油酸诱导的脂肪肝细胞模型 奶牛正常和脂肪肝肝组织活检样本
细胞系:小鼠肝细胞NCTC-1469 Menin过表达载体:pcDNA3.1(+)-mMen1;Menin敲低siRNA:si-Men1 油酸处理浓度:0.25 mM,处理72小时 ChIP实验:使用Magna ChIP G试剂盒,检测Menin结合FABP3/4/5启动子 Western blot定量:三次独立实验,蛋白质表达水平相对于内参β-actin或Histone 3
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证Menin表达水平对肝细胞代谢相关基因表达的影响。
在NCTC-1469细胞中转染Men1过表达质粒(mMen1)或Men1-siRNA(si-Men1),并检测Menin mRNA和蛋白水平的变化。
鉴定Menin调控的下游基因和信号通路。
使用RT2 Profiler PCR Array(脂肪肝相关基因)分析Menin敲低或过表达后肝细胞中基因表达差异,并进行PPI网络分析。
确认Menin直接结合脂肪酸转运蛋白基因的启动子区域。
在正常、Menin过表达或敲低的肝细胞中进行Menin-ChIP实验,检测FABP3、FABP4、FABP5启动子区域的富集。
揭示Menin如何通过蛋白互作和细胞转运调控代谢。
通过免疫共沉淀(Co-IP)检测Menin与PPARγ、SIRT1的相互作用;通过核质分离和免疫荧光观察Menin过表达后Akt、PPARγ、SIRT1的分布变化。
研究在脂肪沉积条件下Menin的表达和功能。
用油酸(OA)处理NCTC-1469细胞,建立脂肪肝细胞模型,检测Menin表达、脂质沉积和相关基因表达。
验证体外发现的机制是否在体内脂肪肝组织中存在。
收取奶牛正常和脂肪肝肝组织样本,进行基因表达分析、Menin-ChIP和Co-IP实验。
确认Menin对葡萄糖和脂肪酸摄取相关蛋白表达的影响。
在Menin过表达的肝细胞中,通过Western blot检测糖代谢(GK, PCK)、脂代谢(CD36)以及信号通路蛋白(IRS1, Akt, AMPK, PPARγ, GSK3β)的表达和磷酸化水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 基因表达分析 | RNA提取试剂盒 | -- | -- |
| SYBR-Premix Ex Taq II | TaKaRa | -- | |
| Mx3000p荧光定量PCR仪 | Agilent | -- | |
| PrimeScript RT试剂盒(含gDNA Eraser) | TaKaRa | -- | |
| RT2 Profiler PCR芯片 | Qiagen | PAMM-157Z | |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- |
| Western blot | PVDF膜 | -- | -- |
| BeyoECL Plus化学发光液 | Beyotime | -- | |
| 脂肪肝细胞诱导 | 油酸钠 | -- | -- |
| 甘油三酯测定 | 甘油三酯测定试剂盒 | Nanjing Jiancheng | -- |
| 免疫沉淀 | Protein G琼脂糖免疫沉淀试剂盒 | KPL | -- |
| 染色质免疫沉淀 | Magna ChIP G染色质免疫沉淀试剂盒 | Merck Millipore | -- |
| 组织学分析 | 油红O | -- | -- |
| 伊红 | -- | -- | |
| 奥林巴斯BX51显微镜 | Olympus | -- | |
| 免疫荧光 | anti-Menin抗体 | Bethyl Laboratories | A300-105A |
| anti-PPARγ抗体 | Bioss | bsm-33436M | |
| anti-SIRT1抗体 | CST | 2496T | |
| 山羊抗小鼠IgG H&L Cy5 | Bioss | 0296G-Cy5 | |
| 山羊抗兔IgG H&L PE | Bioss | bs-0295G-PE | |
| 山羊抗兔IgG H&L FITC | Bioss | bs-0295G-FITC | |
| 徕卡TCS SPE共聚焦显微镜 | Leica | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养和转染 | 细胞系:NCTC-1469;培养基:DMEM/F12+10%FBS;转染试剂:Lipofectamine 2000;转染时间:24小时;过表达质粒:pcDNA3.1(+)-mMen1;siRNA:si-Men1。 阅读提示:参见Materials and methods: Cell culture and cell transfer |
| 基因表达谱分析 | RT2 Profiler PCR Array试剂盒(PAMM-157Z, Qiagen);样本RNA质量;内参:β-actin。 阅读提示:参见Materials and methods: RT2 Profiler PCR array |
| 油酸诱导脂肪肝细胞模型 | 油酸浓度:0.25 mM;处理时间:72小时;细胞密度:1×10^4/孔(96孔板)。 阅读提示:参见Materials and methods: Fatty hepatocyte induction |
| ChIP实验 | ChIP试剂盒:Magna ChIP G (Merck Millipore);使用的抗体;引物序列(Additional file 1: Table S3和S4)。 阅读提示:参见Materials and methods: Chromatin immunoprecipitation assay |
| 蛋白免疫印迹 | 蛋白上样量20μg;SDS-PAGE浓度10%;一抗稀释比例1:1000;内参β-actin(全细胞/细胞质)或Histone 3(细胞核)。 阅读提示:参见Materials and methods: Electrophoresis and immunoblotting |