验证HK2在HCC中的表达和预后价值
评估HK2在HCC组织和细胞系中的表达水平及其与患者预后的关系。
通过Western blot检测HCC细胞系和组织中HK2蛋白水平,利用GEO数据库分析HK2 mRNA表达,TMA进行IHC染色和预后分析,并用Cox回归模型评估独立危险因素。
Hexokinase 2 confers radio-resistance in hepatocellular carcinoma by promoting autophagy-dependent degradation of AIMP2.
包含体外细胞功能、体内异种移植模型、机制研究(IP/质谱、自噬抑制)及临床样本验证等多个独立证据层级,并进行功能验证和机制验证。
HCC细胞系MHCC97H、MHCC97L及其放射抗性亚系IR-R、QGY7701 小鼠肝癌细胞系H22 裸鼠皮下异种移植模型 C57BL/6小鼠皮下异种移植模型
放射剂量(0-8 Gy)及IR处理时间 HK2过表达或敲低的细胞模型构建 AIMP2表达调控(siRNA或过表达载体) 自噬抑制剂CQ和蛋白酶体抑制剂MG-132的处理浓度和时间 酮康唑给药方案(20 mg/kg,腹腔注射,每两天一次)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估HK2在HCC组织和细胞系中的表达水平及其与患者预后的关系。
通过Western blot检测HCC细胞系和组织中HK2蛋白水平,利用GEO数据库分析HK2 mRNA表达,TMA进行IHC染色和预后分析,并用Cox回归模型评估独立危险因素。
探究HK2表达水平是否影响HCC细胞对电离辐射的敏感性。
构建HK2过表达或敲低的稳定细胞系,通过CCK8、集落形成、免疫荧光及流式细胞术检测细胞增殖、DNA损伤修复和凋亡。
在动物模型中验证HK2对肿瘤放射敏感性的影响。
建立皮下异种移植模型,用不同HK2表达状态的细胞,给予或不给予IR处理,监测肿瘤生长,并通过IHC检测增殖标志物和免疫细胞浸润。
阐明HK2如何调控AIMP2蛋白水平及其在放射抗性中的作用机制。
通过免疫沉淀、质谱鉴定HK2相互作用蛋白,Co-IP和IF验证蛋白相互作用和共定位,使用自噬和蛋白酶体抑制剂处理,并检测自噬相关蛋白表达和自噬流。
验证HK2的放射抗性功能是否部分依赖于AIMP2的降解。
通过siRNA敲低或过表达AIMP2,检测对HK2表达改变的细胞凋亡和增殖的影响,并在体内模型中验证。
探索抑制HK2是否可增强HCC放疗的抗肿瘤效果。
使用酮康唑(Keto)处理HK2过表达细胞及异种移植模型,评估联合IR的抗增殖、促凋亡和逆转免疫抑制的作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gbico | -- |
| 胎牛血清 | Gbico | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fischer Scientific | -- |
| 药物处理 | 酮康唑 | Selleck | -- |
| 氯喹 | Selleck | -- | |
| MG-132 | Selleck | -- | |
| CCK8实验 | CCK8试剂盒 | DOJINDO Laboratories | -- |
| Western blotting | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 蛋白酶抑制剂 | CWBIO | -- | |
| 磷酸酶抑制剂 | CWBIO | -- | |
| HRP标记二抗 | Proteintech | SA00001-2 | |
| 增强化学发光试剂 | Tanon | -- | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 10494-1-AP | |
| HK2抗体 | Proteintech | 22029-1-AP | |
| AIMP2抗体 | Proteintech | 10424-1-AP | |
| 细胞色素c抗体 | Proteintech | 10993-1-AP | |
| Caspase 3抗体 | Proteintech | 19677-1-AP | |
| Bcl-xL抗体 | Abcam | ab32370 | |
| LC3抗体 | Proteintech | 14600-1-AP | |
| P62抗体 | Proteintech | 18420-1-AP | |
| Beclin1抗体 | Proteintech | 11306-1-AP | |
| 免疫组织化学 | HK2抗体 | Proteintech | 66974-1-Ig |
| Ki-67抗体 | Cell Signaling Technology | 9449 | |
| PCNA抗体 | Abclonal | a0264 | |
| LC3 II抗体 | Proteintech | 18725-1-AP | |
| CD8抗体 | Abcam | ab217344 | |
| CD163抗体 | Proteintech | 16646-1-AP | |
| CD206抗体 | Cell Signaling Technology | 24595 | |
| qRT-PCR | TRIzol试剂 | AG | -- |
| Evo M-MLV逆转录预混液 | AG | -- | |
| SYBR Green qPCR试剂盒 | AG | -- | |
| LightCycler 96检测系统 | Roche | -- | |
| 流式细胞术 | 凋亡检测试剂盒 | KeyGEN | -- |
| 免疫荧光 | HK2抗体 | Proteintech | 66974-1-Ig |
| Alexa-488标记山羊抗小鼠二抗 | Bioss | -- | |
| Alexa-555标记山羊抗兔二抗 | Bioss | -- | |
| DAPI | -- | -- | |
| 共聚焦激光扫描显微镜 | Olympus | FV1000 | |
| 动物实验 | 酮康唑 | Selleck | -- |
| 放射治疗 | 直线加速器 | Varian | Clinac |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养条件 | 所用细胞系(MHCC97H, MHCC97L等)的来源和身份;培养基DMEM补充10% FBS,5% CO2,37°C培养条件。 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and cell construction |
| 辐射处理 | 辐射剂量(0-8 Gy)和辐射源(Varian Clinac 23EX直线加速器);体外和体内实验辐射剂量和时间点。 阅读提示:Materials and methods: IR treatment and CCK8 and colony formation assays / Subcutaneous xenograft model |
| HK2/AIMP2表达调控 | 过表达或敲低构建的载体和序列信息(LV-HK2, shHK2, LV-AIMP2, siAIMP2);转染试剂和条件。 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and cell construction |
| 药物处理 | 酮康唑浓度(体外20 μM,体内20 mg/kg)及溶媒;CQ和MG-132的浓度和时间(CQ 5 μM, 24h; MG-132 20 μM, 24h)。 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and cell construction / Subcutaneous xenograft model |
| 体内模型 | 动物品系(裸鼠,C57BL/6)、年龄、性别;接种细胞数和部位(5×10^6皮下);IR时间(第12、13天);分组条件(肿瘤体积达200 mm³)。 阅读提示:Materials and methods: Subcutaneous xenograft model |
| 分子检测 | 所用抗体(品牌、货号)和稀释比例;Western blot、IHC、IF等实验详细步骤和条件。 阅读提示:Materials and methods: Western blotting analysis, Immunohistochemistry, Immunofluorescence |
| 统计方法 | 数据正态性和方差齐性;采用的统计检验(t检验、ANOVA);样本量(平均值±SEM)。 阅读提示:Materials and methods: Statistics |