体外抗增殖活性评估
评估indisulam对宫颈癌细胞活力及增殖的抑制作用。
使用MTS法检测不同浓度indisulam处理HeLa和C33A细胞24、48、72小时后的细胞活力;使用克隆形成实验评价长期增殖能力。
Indisulam exerts anticancer effects via modulation of transcription, translation and alternative splicing on human cervical cancer cells.
包含体外细胞活力、克隆形成、凋亡检测,体内异种移植瘤模型,以及转录组和蛋白质组学等多层级验证,并涉及机制研究。
HeLa人宫颈腺癌细胞系 C33A人宫颈鳞癌细胞系 Balb/c裸鼠异种移植瘤模型
细胞系:HeLa (HPV-18阳性,p53野生型) 和 C33A (HPV阴性,p53突变型 R273C) 药物处理:indisulam浓度范围(0-5 μM用于细胞实验,25 mg/kg用于动物实验) 处理时间:24小时、48小时、72小时(细胞实验),8天(动物实验) 对照:DMSO溶剂对照和未处理对照组,动物实验设置载体组 给药方式:细胞实验培养基给药,动物实验尾静脉注射每日一次
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估indisulam对宫颈癌细胞活力及增殖的抑制作用。
使用MTS法检测不同浓度indisulam处理HeLa和C33A细胞24、48、72小时后的细胞活力;使用克隆形成实验评价长期增殖能力。
验证indisulam在体内对宫颈癌移植瘤生长的抑制作用。
构建HeLa细胞裸鼠异种移植瘤模型,待肿瘤生长至约100mm3后,尾静脉注射indisulam(25mg/kg)每天一次,连续8天,并测量肿瘤体积和重量。
验证indisulam是否导致宫颈癌细胞中RBM39蛋白降解。
通过Western blot检测不同浓度indisulam处理后HeLa和C33A细胞中RBM39蛋白水平;通过蛋白质组学分析验证RBM39蛋白的下调。
全面分析indisulam处理后HeLa细胞转录和翻译水平的变化。
对5 μM indisulam处理24小时的HeLa细胞进行RNA-seq和TMT标记蛋白质组学分析,鉴定差异表达基因和蛋白质,并进行GO和KEGG富集分析。
评估indisulam引起的剪接异常及对核斑结构的影响。
利用ASprofile软件分析RNA-seq数据鉴定可变剪接事件;通过免疫荧光染色观察SC35标记的核斑形态变化。
验证indisulam诱导宫颈癌细胞凋亡及其机制是否涉及p73介导的线粒体凋亡通路。
通过流式细胞术检测Annexin V-FITC/PI双染凋亡细胞比例;通过Western blot检测p73亚型(ΔNp73, TAp73)和凋亡相关蛋白(Bcl-2, Bax, procaspase-3, cleaved caspase-3, cytochrome c)的表达变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | BI | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 药物处理 | Indisulam | Sigma-Aldrich | SML1225 |
| 二甲基亚砜 | Solarbio | -- | |
| 细胞活力检测 | Cell Titer 96 AQueous One Solution 细胞增殖检测试剂盒 | Promega | -- |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V-FITC凋亡检测试剂盒I | BD | -- |
| 流式分析 | FlowSight流式细胞仪 | Amnis | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Solarbio | -- |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 抗RBM39抗体 | Abcam | ab244254 | |
| 抗caspase-3抗体 | Abcam | ab184787 | |
| 抗ΔNp73抗体 | Novus | 38C674.2 | |
| 抗p73抗体 | Novus | 5B429 | |
| 抗细胞色素c抗体 | Immunoway | YM3402 | |
| 抗Bax抗体 | Immunoway | YT0455 | |
| 抗Bcl-2抗体 | Immunoway | YT0470 | |
| 抗活化的caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9661S | |
| 抗p21抗体 | Abcam | ab109199 | |
| 抗Cyclin D1抗体 | Abcam | ab16663 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Bioss | bs-10966R | |
| RNA-seq | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| Illumina Novaseq 6000测序仪 | Illumina | -- | |
| 蛋白质组学 | TMT标记 | -- | -- |
| Agilent 1260 infinity II高效液相色谱系统 | Agilent | -- | |
| 免疫荧光 | 抗SC35抗体 | Abcam | ab11826 |
| 抗Lamin A抗体 | Abcam | ab8090 | |
| Zeiss LSM-700共聚焦显微镜 | Carl Zeiss | -- | |
| 免疫组织化学 | 抗Ki67抗体 | Immunoway | YM3064 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外细胞实验 | 细胞系(HeLa和C33A),细胞培养条件(DMEM+10%FBS,37°C,5%CO2),药物浓度(0-5μM),处理时间(24-72h),细胞接种密度(3000细胞/孔),检测方法(MTS) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and reagents, Cell viability assay |
| 克隆形成实验 | 细胞接种密度(1000细胞/皿),药物浓度(0-5μM),培养时间(10-14天),克隆计数标准(>50个细胞) 阅读提示:Materials and methods: Clonogenic assay |
| 凋亡检测 | 药物处理时间(24h),Annexin V-FITC和PI染色,流式细胞仪(FlowSight) 阅读提示:Materials and methods: Cell apoptosis assay |
| Western blot | 药物浓度(如0, 5nM, 0.5μM, 5μM),处理时间(24h),抗体信息(特异性、稀释比例) 阅读提示:Materials and methods: Western blot analysis |
| RNA-seq | 处理条件(5μM indisulam,24h),RNA质量(RIN>7),测序平台和模式(Illumina Novaseq 6000, PE150) 阅读提示:Materials and methods: RNA sequencing |
| 蛋白质组学 | 处理条件(5μM indisulam,24h),肽段标记(TMT),质谱鉴定(Easy nLC) 阅读提示:Materials and methods: Proteome analysis |
| 选择性剪接分析 | 分析软件(ASprofile),参考基因组,差异事件筛选标准 阅读提示:Materials and methods: Alternative splicing analysis |
| 免疫荧光 | 细胞处理(有无indisulam),固定和透化条件(4%多聚甲醛,0.5% Triton X-100),抗体(SC35, Lamin A),成像(Zeiss LSM-700) 阅读提示:Materials and methods: Immunofluorescence staining of nuclear speckles |
| 动物实验 | 细胞系(HeLa),细胞数量(5*10^7/只),裸鼠品系(Balb/c),分组(对照、载体、indisulam),给药剂量(25mg/kg),给药方式(尾静脉),给药频率(每日一次),给药天数(8天) 阅读提示:Materials and methods: Xenograft assay |