验证oar-miR-432直接靶向DDI1
通过双荧光素酶报告实验验证oar-miR-432是否直接与DDI1 3'UTR结合。
将包含预测结合位点的野生型或突变型DDI1 3'UTR克隆至psiCHECK2载体,与oar-miR-432 mimic或NC共转染HEK293T细胞,检测荧光素酶活性。
The Effects of DDI1 on Inducing Differentiation in Ovine Preadipocytes via Oar-miR-432.
包含体外细胞模型(绵羊前脂肪细胞、HEK293T)、双荧光素酶报告实验、过表达/敲低功能验证、油红O染色、Western blot及RT-qPCR等多层级验证。
绵羊原代前脂肪细胞 HEK293T细胞
双荧光素酶报告实验验证oar-miR-432与DDI1 3'UTR直接结合 使用oar-miR-432 mimic和inhibitor转染前脂肪细胞检测DDI1表达 DDI1过表达和敲低慢病毒转染前脂肪细胞(MOI=100) 油红O染色评估脂滴形成 RT-qPCR和Western blot检测DDI1、PPAR-γ、FABP4、ACACA和PDGFD表达
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
通过双荧光素酶报告实验验证oar-miR-432是否直接与DDI1 3'UTR结合。
将包含预测结合位点的野生型或突变型DDI1 3'UTR克隆至psiCHECK2载体,与oar-miR-432 mimic或NC共转染HEK293T细胞,检测荧光素酶活性。
观察oar-miR-432过表达或抑制对DDI1 mRNA和蛋白表达的影响。
将oar-miR-432 mimic、inhibitor或NC转染至绵羊前脂肪细胞,诱导分化后于第2天和第4天收集细胞,提取RNA和蛋白,分别进行RT-qPCR和Western blot检测DDI1表达。
探究DDI1过表达或敲低是否影响oar-miR-432的表达。
利用慢病毒介导的DDI1过表达或敲低转染前脂肪细胞,成功转染后收集细胞提取RNA,通过RT-qPCR检测oar-miR-432的表达,并设置NC对照。
评估DDI1过表达或敲低对前脂肪细胞成脂分化的影响。
通过慢病毒介导的DDI1过表达或敲低处理前脂肪细胞,诱导分化后通过RT-qPCR和Western blot检测PPAR-γ、FABP4和ACACA的表达,并使用油红O染色观察脂滴形成。
探讨DDI1过表达或敲低是否影响PDGFD的表达。
在DDI1过表达或敲低的前脂肪细胞中,通过RT-qPCR和Western blot检测PDGFD的mRNA和蛋白表达水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| 细胞转染 | opti培养基 | Gibco | -- |
| 诱导分化 | 地塞米松 | Macklin | -- |
| 异丁基甲基黄嘌呤 | Macklin | -- | |
| 维持分化 | 胰岛素 | Macklin | -- |
| 油红O染色 | 油红O染液 | Solarbio | -- |
| 异丙醇 | -- | -- | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| RNAprep纯化试剂盒 | TIANGEN | -- | |
| Prime Script II 第一链cDNA合成试剂盒 | Takara | -- | |
| miRNA RT-qPCR | miRNA第一链cDNA合成试剂盒 | Vazyme | MR101-01/02 |
| miRNA通用SYBR qPCR预混液 | Vazyme | MQ101-01/02 | |
| mRNA RT-qPCR | TB Green Premix Ex Taq | Takara | RR420L |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| BCA蛋白定量试剂 | Thermo Scientific | 23235 | |
| 4x还原型上样缓冲液 | Thermo Scientific | NP0007 | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| Bio-Rad转印系统 | Bio-Rad | 1703930 | |
| 脱脂奶粉 | Thermo Scientific | LP0031B | |
| 抗DDI1抗体 | Proteintech | 13968-1-AP | |
| 抗PDGFD抗体 | Bioss | bs-5776R | |
| 抗PPAR-γ抗体 | Proteintech | 60127-1-Ig | |
| 抗β-微管蛋白抗体 | Proteintech | 66240-1-Ig | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Bioss | bs-0061R | |
| TBST缓冲液 | Solarbio | T1085 | |
| 二抗 | Abcam | ab6721 | |
| 增强化学发光试剂 | Thermo Scientific | 32209 | |
| Tanon 5200成像系统 | Tanon | -- | |
| 仪器设备 | Nanodrop 2000核酸蛋白分析仪 | Thermo | -- |
| 显微观察 | 徕卡显微镜 | Leica | -- |
| 统计分析 | GraphPad Prism软件 | GraphPad Software | -- |
| 图像分析 | ImageJ软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞分离与培养 | 绵羊原代前脂肪细胞分离自70日龄胎羊尾部脂肪组织;细胞培养于DMEM(含10% FBS和5% PS) 阅读提示:Materials and Methods 4.1 |
| 双荧光素酶报告实验 | HEK293T细胞,每孔1×10^4细胞;转染100 ng重组载体和20 nM oar-miR-432 mimic或NC;转染后48小时检测 阅读提示:Materials and Methods 4.2,图2 |
| 细胞转染 | oar-miR-432 mimic/inhibitor/NC浓度20 nM;慢病毒MOI=100;诱导分化培养基含1 µM地塞米松和0.5 mM IBMX,维持培养基含10 mg/mL胰岛素 阅读提示:Materials and Methods 4.3,图4 |
| 油红O染色 | 细胞固定用4%多聚甲醛,染色用油红O溶液,洗涤用60%异丙醇,显微镜放大倍数40× 阅读提示:Materials and Methods 4.4,图5 |
| RT-qPCR | 绵羊尾部脂肪组织样本:3只湖羊和3只藏羊(6月龄成年母羊);内参基因β-actin;引物序列见表1;qPCR条件:95°C 5 min,40个循环(95°C 10 s, 60°C 30 s),熔解曲线分析 阅读提示:Materials and Methods 4.5,表1 |
| Western blot | 蛋白提取使用RIPA裂解液,BCA定量;上样量20 µg;SDS-PAGE后转PVDF膜;抗体信息:anti-DDI1 (44 kDa, Proteintech #13968-1-AP)、anti-PDGFD (57 kDa, Bioss #bs-5776R)、anti-PPAR-γ (58 kDa, Proteintech #60127-1-Ig)、anti-β-tubulin (50 kDa, Proteintech #66240-1-Ig)、anti-β-actin (42 kDa, Bioss #bs-0061R) 阅读提示:Materials and Methods 4.6 |
| 统计分析 | 两组比较用非配对t检验,多组比较用单因素方差分析,p<0.05表示统计学显著;数据以mean±SEM表示 阅读提示:Materials and Methods 4.7 |