验证DPT激活SIRT1和PARP1
确定DPT是否能激活SIRT1和PARP1,并诱导parthanatos。
用DPT处理U87、U251和U118细胞,通过Western blotting检测SIRT1、p-SIRT1(Ser27)、乙酰化p53、PAR和PARP1水平,并通过LDH释放实验评估细胞死亡。
Activated SIRT1 contributes to DPT-induced glioma cell parthanatos by upregulation of NOX2 and NAT10.
包含体外细胞实验(U87、U251、U118)、基因敲低(siRNA)、药理学抑制/激活、体内异种移植瘤模型,并涵盖功能验证(LDH、彗星实验)与机制验证(蛋白质印迹、免疫共沉淀)。
U87人胶质母细胞瘤细胞系 U251人胶质母细胞瘤细胞系 U118人胶质母细胞瘤细胞系 U87细胞异种移植瘤小鼠模型
DPT浓度450 nmol/L处理24小时 SIRT1激活剂SRT2183(10 μmol/L)预处理1小时 SIRT1抑制剂EX527(200 μmol/L)预处理1小时 NOX2抑制剂GSK2795039(5 μmol/L)预处理1小时 NAD+补充(0.5-2 mmol/L)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定DPT是否能激活SIRT1和PARP1,并诱导parthanatos。
用DPT处理U87、U251和U118细胞,通过Western blotting检测SIRT1、p-SIRT1(Ser27)、乙酰化p53、PAR和PARP1水平,并通过LDH释放实验评估细胞死亡。
通过药理学激活或抑制SIRT1,以及siRNA敲低SIRT1,验证SIRT1在DPT诱导细胞死亡中的作用。
使用SIRT1激活剂SRT2183、抑制剂EX527或SIRT1 siRNA预处理细胞,然后加入DPT,检测PARP1、PAR水平及细胞死亡。
探究DPT诱导的NAD+耗竭是否促进PARP1激活和细胞死亡。
用NAD+合成抑制剂FK866或外源性NAD+处理细胞,检测NAD+水平、PARP1活性、PAR生成以及细胞死亡。
确定NOX2是否通过产生ROS诱导DNA双链断裂,从而促进PARP1激活。
使用NOX2抑制剂GSK2795039或NOX2 siRNA处理细胞,检测ROS水平、NADPH氧化酶活性、γ-H2AX和p-ATM水平,以及细胞死亡和PARP1活化。
探究NAT10是否通过乙酰化PARP1促进其活化。
用NAT10抑制剂remodelin或NAT10 siRNA处理细胞,免疫沉淀检测NAT10与PARP1的相互作用及PARP1乙酰化水平,并评估细胞死亡。
确定JNK是否通过磷酸化SIRT1(Ser27)激活SIRT1。
使用JNK抑制剂SP600125或JNK siRNA处理细胞,检测p-JNK、p-SIRT1(Ser27)水平以及细胞死亡和PARP1活化。
验证激活的SIRT1是否通过NAD+耗竭和NOX2激活放大ROS-ASK1-JNK信号。
使用NAD+补充或FK866、SIRT1调节剂、NOX2抑制剂等处理,检测p-ASK1和p-JNK水平。
在动物模型中验证DPT诱导SIRT1和PARP1激活及下游通路。
建立U87细胞异种移植瘤模型,腹腔注射DPT,检测肿瘤重量和体积,并分析肿瘤组织中SIRT1、PARP1、NOX2、NAT10、p-JNK等表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 去氧鬼臼毒素 | Yuanye Bio-technology | -- |
| SRT2183 | Selleck Chemicals | -- | |
| SP600125 | Selleck Chemicals | -- | |
| EX527 | MedChemExpress | -- | |
| GSK2795039 | MedChemExpress | -- | |
| 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 | MedChemExpress | -- | |
| FK866 | MedChemExpress | -- | |
| 蛋白质印迹 | 抗SIRT1抗体 | Abcam | ab32441 |
| 抗NOX2抗体 | Abcam | ab129068 | |
| 抗乙酰化p53抗体 | Abcam | ab75754 | |
| 抗p53抗体 | Abcam | ab26 | |
| 抗磷酸化ATM(Ser1981)抗体 | Abcam | ab81292 | |
| 抗磷酸化H2AX(Ser139)抗体 | Abcam | ab26350 | |
| 抗JNK抗体 | Abcam | ab179461 | |
| 抗PAR抗体 | Cell Signaling Technology | 83732 | |
| 抗p300抗体 | Cell Signaling Technology | 86377 | |
| 抗AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 2920 | |
| 抗磷酸化AKT(Ser473)抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| 抗磷酸化JNK抗体 | Cell Signaling Technology | 4668 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 4970 | |
| 抗CREB1抗体 | Bioss | bs-0035M | |
| 抗磷酸化SIRT1(Ser27)抗体 | Bioss | bs-3416R | |
| 抗磷酸化CREB1(Ser133)抗体 | Bioss | bs-0036R | |
| 抗PARP1抗体 | Proteintech | 13371-1-AP | |
| 抗NAT10抗体 | Proteintech | 13365-1-AP | |
| 泛乙酰化抗体 | Proteintech | 66289-1-Ig | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| siRNA转染 | SIRT1 siRNA | RiboBio | -- |
| NAT10 siRNA | RiboBio | -- | |
| JNK siRNA | GenePharma | -- | |
| NOX2 siRNA | GenePharma | -- | |
| 乱序siRNA | GenePharma | -- | |
| 细胞死亡检测 | LDH释放检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 免疫细胞化学 | Cy3标记的山羊抗兔IgG | -- | -- |
| Hoechst33342 | -- | -- | |
| 荧光显微镜观察 | 奥林巴斯IX71荧光显微镜 | Olympus | IX71 |
| 共聚焦显微镜观察 | 奥林巴斯FV1000共聚焦显微镜 | Olympus | FV1000 |
| 蛋白质印迹 | ChemiScope 5300化学发光仪 | Clinx Science Instrument Company | 5300 |
| 氧化应激检测 | DCFH-DA荧光探针 | Beyotime Biotechnology | -- |
| H2O2检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- | |
| NAD+/NADH检测 | NAD+/NADH检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| NADPH氧化酶活性检测 | NADPH氧化酶活性化学发光检测试剂盒 | Genmed Scientifics | -- |
| 动物实验 | BALB/c裸鼠 | Beijing Vital River laboratory | -- |
| 其他试剂 | 二甲基亚砜 | Sigma-Aldrich | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | 细胞系(U87、U251、U118)来源、培养条件(DMEM高糖、10%FBS、青霉素/链霉素)、DPT浓度(150和450 nmol/L)及处理时间。 阅读提示:Materials and methods: Cell lines and culture; Results: SIRT1 activation boosted DPT-induced glioma cell parthanatos |
| SIRT1活性调控 | SRT2183(激活剂)和EX527(抑制剂)的浓度(10 μmol/L和200 μmol/L)及预处理时间(1小时);SIRT1 siRNA转染效率。 阅读提示:Results: SIRT1 activation boosted DPT-induced glioma cell parthanatos; Materials and methods: Transfection of small interfering RNA |
| NAD+水平调控 | FK866(NAMPT抑制剂)浓度(100 μmol/L)及处理时间;外源性NAD+浓度(0.5、2 mmol/L);NAD+/NADH检测方法。 阅读提示:Materials and methods: Assay of NAD+, ROS, and H2O2; Results: NAD+ depletion contributed to DPT-induced upregulation of NAT10 and NOX2 |
| NOX2功能验证 | NOX2抑制剂GSK2795039浓度(5 μmol/L)及预处理时间;NOX2 siRNA序列及转染效率;ROS检测(DCFH-DA)和NADPH氧化酶活性检测。 阅读提示:Materials and methods: Measurement of NADPH oxidase activity; Assay of NAD+, ROS, and H2O2; Results: SIRT1 activation reinforced DPT-induced NOX2 activation |
| NAT10功能验证 | NAT10抑制剂remodelin浓度(50 μmol/L)及预处理时间;NAT10 siRNA序列及转染效率;免疫共沉淀检测NAT10与PARP1相互作用;PARP1乙酰化检测。 阅读提示:Materials and methods: Co-immunoprecipitation; Results: SIRT1 activation reinforced DPT-induced NAT10 upregulation |
| JNK通路验证 | JNK抑制剂SP600125浓度(15 μmol/L)及预处理时间;JNK siRNA序列及转染效率;检测p-JNK、p-SIRT1(Ser27)、p-ASK1水平。 阅读提示:Materials and methods: Transfection of small interfering RNA; Results: JNK regulated DPT-induced SIRT1 activation |
| 体内实验 | 小鼠品系(BALB/c nude)、年龄(4周)和体重(20-22g);U87细胞接种数量(1×10^6)和途径(皮下);DPT剂量(5 mg/kg)和给药方式(腹腔注射,每日一次);治疗周期(12天);对照组(vehicle)。 阅读提示:Materials and methods: Human U87 tumor xenograft in mice; Results: DPT induced activation of PARP1 and SIRT1 in vivo |