临床样本表达与预后分析
检测EIF4G1在LSCC组织中的表达水平及其与患者临床病理特征和预后的关系
使用组织芯片(HLug-Squ150Sur-02和HLugS180Sur01)进行免疫组化染色和H-score评分,并采用Kaplan-Meier曲线和Cox回归分析评估EIF4G1表达与总生存期的关系。
Prognostic and functional roles of EIF4G1 in lung squamous cell carcinoma.
包括临床组织芯片免疫组化、细胞系功能实验(增殖、集落形成、细胞周期)和体内异种移植瘤模型,并涉及机制蛋白检测。
NCI-H1703细胞 NCI-H226细胞 SK-MES-1细胞 BALB/C裸鼠异种移植瘤模型
LSCC组织芯片样本量:137对肿瘤及癌旁组织 EIF4G1高表达与总生存期缩短相关(P=0.007) siRNA敲低EIF4G1后,细胞增殖和集落形成能力下降 EIF4G1敲低导致G1期阻滞及cyclin D1、AKT/mTOR信号下调 体内实验:NCI-H1703细胞接种于裸鼠,每组18只,肿瘤体积监测至15天
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测EIF4G1在LSCC组织中的表达水平及其与患者临床病理特征和预后的关系
使用组织芯片(HLug-Squ150Sur-02和HLugS180Sur01)进行免疫组化染色和H-score评分,并采用Kaplan-Meier曲线和Cox回归分析评估EIF4G1表达与总生存期的关系。
比较LSCC细胞系与正常肺成纤维细胞中EIF4G1的蛋白表达水平
通过Western blot检测NCI-H1703、NCI-H226、SK-MES-1和HFL1细胞中EIF4G1蛋白表达。
确认siRNA能够有效降低EIF4G1表达
在NCI-H1703、NCI-H226和SK-MES-1细胞中转染EIF4G1 siRNA或阴性对照,通过Western blot检测敲低效率。
评估EIF4G1对LSCC细胞增殖和锚定非依赖性生长的影响
采用CCK-8试剂盒检测不同时间点的细胞活力,并采用集落形成实验检测克隆形成能力。
检测EIF4G1敲低对LSCC细胞周期分布的影响
通过PI染色和流式细胞术分析细胞周期分布,并通过Western blot检测细胞周期相关蛋白。
探究EIF4G1调控细胞增殖的分子机制
通过Western blot检测敲低EIF4G1后AKT、p-AKT、mTOR、cyclin D1等蛋白的表达变化。
评估EIF4G1敲低对LSCC细胞体内肿瘤生长的影响
将稳定敲低EIF4G1的NCI-H1703细胞皮下接种于BALB/C裸鼠,监测肿瘤体积和重量,并通过免疫组化分析EIF4G1表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组织化学 | 免疫组织化学染色试剂盒 | SHANGHAI OUT BIOTECH CO., LTD. | -- |
| 细胞培养 | Ham's F12K培养液 | Gibco | 21127022 |
| RPMI 1640培养基 | GIBCO | A1049101 | |
| 胎牛血清 | Clark | FB25011 | |
| 青霉素-链霉素 | GIBCO | 10378016 | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| 反转录 | 第一链cDNA合成试剂盒 | Takara | -- |
| RT-PCR | SYBR Green PCR预混液 | Takara | -- |
| ABI PRISM 7500实时荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems | -- | |
| 转染 | 小干扰RNA | GenePharma | -- |
| 脂质体转染试剂3000 | Invitrogen | -- | |
| 细胞裂解 | RIPA裂解液 | EpiZyme | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Bimake | -- | |
| Western blot | PVDF膜 | PerkinElmer | -- |
| EIF4G1抗体 | Cell Signaling Technology | 8701 | |
| AKT抗体 | Immunoway | YP0007 | |
| 磷酸化AKT抗体 | ABclonal technology | AP1208 | |
| mTOR抗体 | Bioss Anti Bodies | bs3494R | |
| 细胞周期蛋白D1抗体 | ABclonal technology | A11022 | |
| β-肌动蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 辣根过氧化物酶标记二抗 | Invitrogen | -- | |
| 增强化学发光试剂 | Beyotime | -- | |
| 细胞增殖检测 | 细胞计数试剂盒-8 | KeyGEN BioTECH | -- |
| 酶标仪(SpectraMax M5) | Molecular Devices | -- | |
| 流式细胞术 | 碘化丙啶 | BD Pharmingen | 556463 |
| 动物实验 | 水合氯醛 | Sangon Biotech | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本分析 | 组织芯片来源及样本量(137对肿瘤及癌旁组织)、免疫组化评分标准(H-score) 阅读提示:Materials and methods: Tissue samples, immunohistochemical staining and scoring; Fig. 1 |
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基类型、血清和抗生素浓度、培养条件(37°C, 5% CO2) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture |
| siRNA转染 | siRNA序列、浓度(83 pmol)、转染试剂(Lipofectamine 3000)及体积(7.5 μl)、转染时间(48小时) 阅读提示:Materials and methods: Transfection |
| 细胞增殖检测 | 细胞接种密度(5000细胞/孔)、CCK-8试剂添加量(10 μl)及检测时间点(0,24,48,72小时) 阅读提示:Materials and methods: Cell proliferation assay |
| 体内实验 | 动物品系(BALB/C裸鼠)、性别(雌性)、周龄(5周)、细胞接种量(6×10^6)、肿瘤体积监测频率(每3天)及实验持续时间(15天) 阅读提示:Materials and methods: Xenograft model; Fig. 4 |
| 统计分析方法 | 统计检验方法(Student's t test、one-way ANOVA、Mann-Whitney U test)、显著性水平(P<0.05) 阅读提示:Materials and methods: Statistical analysis |