USP7和PRMT5依赖的G3BP2稳定化驱动头颈鳞状细胞癌的从头脂肪生成和肿瘤发生

USP7- and PRMT5-dependent G3BP2 stabilization drives de novo lipogenesis and tumorigenesis of HNSC.

作者信息Nan Wang, Tianzi Li, Wanyu Liu, Jinhua Lin, Ke Zhang, Zhenhao Li, Yanfei Huang, Yufei Shi, Meilan Xu, Xuekui Liu
PMID36878903
发布时间2023-03-06
DOI10.1038/s41419-023-05706-2

实验完整度

包含体外细胞实验(HEK293、HNSC细胞系)、蛋白互作与修饰分析(IP、Co-IP、质谱、体外甲基化)、功能实验(增殖、迁移、侵袭)、体内异种移植模型,以及临床样本免疫组化验证。

主要模型

HEK293细胞 HNSC细胞系(Tu686、Tu212、CAL-27等) 异种移植裸鼠模型 HNSC临床组织样本(50对)

重点核对

PRMT5介导G3BP2 R468对称二甲基化位点 USP7去泛素化依赖的G3BP2稳定性 PRMT5或USP7敲低或抑制对G3BP2蛋白水平的影响 G3BP2突变(R468K)对脂质代谢和肿瘤生长的影响 临床样本中G3BP2、PRMT5、USP7表达与预后的相关性

摘要

GTP酶激活蛋白结合蛋白2(G3BP2)是一种与应激颗粒(SGs)形成相关的关键RNA结合蛋白。G3BP2的过度活化与多种病理状况相关,尤其是癌症。新兴证据表明,翻译后修饰(PTMs)在基因转录、整合代谢和免疫监视中发挥关键作用。然而,PTMs如何直接调控G3BP2活性尚不清楚。在此,我们的分析确定了一种新机制:PRMT5介导的G3BP2-R468me2增强了其与去泛素化酶USP7的结合,从而确保G3BP2的去泛素化和稳定化。在机制上,USP7和PRMT5依赖的G3BP2稳定化保证了ACLY的强效激活,从而刺激从头脂肪生成和肿瘤发生。更重要的是,USP7诱导的G3BP2去泛素化被PRMT5缺失或抑制所减弱。PRMT5活性依赖的G3BP2甲基化是其被USP7去泛素化和稳定化的必要条件。一致地,在临床患者中,G3BP2、PRMT5和G3BP2 R468me2蛋白水平呈正相关,并与不良预后相关。总之,这些数据表明,PRMT5-USP7-G3BP2调控轴在肿瘤发生中作为脂质代谢重编程机制,并为头颈鳞状细胞癌的代谢治疗揭示了有前景的治疗靶点。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
PRMT5和USP7如何通过翻译后修饰调控G3BP2的稳定性,进而影响头颈鳞状细胞癌的从头脂肪生成和肿瘤发生。
核心机制
PRMT5介导G3BP2 R468对称二甲基化,增强G3BP2与去泛素化酶USP7的结合,导致G3BP2去泛素化和稳定化,稳定化的G3BP2增强ACLY的转录活性,促进从头脂肪生成和肿瘤发生。
主要证据
免疫沉淀和质谱鉴定PRMT5与G3BP2相互作用及R468甲基化位点;Co-IP和体外去泛素化实验证明USP7依赖PRMT5甲基化稳定G3BP2;体内异种移植实验证实G3BP2-WT而非R468K突变体挽救PRMT5敲低抑制的肿瘤生长;临床样本中G3BP2、PRMT5、USP7表达正相关并与不良预后相关。
研究意义
揭示PRMT5-USP7-G3BP2调控轴作为脂质代谢重编程机制,为头颈鳞状细胞癌的代谢治疗提供潜在靶点。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

鉴定PRMT5与G3BP2的相互作用及甲基化位点

探究G3BP2是否为PRMT5的新底物,并确定PRMT5介导的甲基化位点。

通过免疫沉淀和质谱分析鉴定PRMT5的相互作用蛋白G3BP2;通过截短突变体确定相互作用结构域;通过定制甲基化抗体和质谱验证G3BP2 R468对称二甲基化;体外甲基化实验和PRMT5抑制剂处理验证甲基化依赖性。

2

验证PRMT5和USP7对G3BP2稳定性的调控

确定PRMT5和USP7是否通过去泛素化途径稳定G3BP2。

在Tu686和Tu212细胞中敲低PRMT5或USP7,检测G3BP2蛋白和mRNA水平;使用MG132和CHX检测蛋白半衰期;免疫共沉淀和去泛素化实验评估G3BP2的泛素化水平。

3

分析G3BP2甲基化对脂质代谢的影响

探究PRMT5介导的G3BP2甲基化是否促进脂质代谢重编程。

在Tu212细胞中过表达G3BP2-WT或R468K,进行转录组测序和代谢组学分析;RT-PCR和Western blot检测脂质代谢相关基因;油红O染色检测脂滴形成。

4

评估G3BP2甲基化对肿瘤细胞增殖、迁移和侵袭的影响

验证PRMT5-USP7-G3BP2轴是否促进肿瘤细胞的恶性行为。

在Tu686细胞中敲低PRMT5或USP7并过表达G3BP2-WT或R468K,进行CCK-8增殖、集落形成、Transwell迁移侵袭及划痕愈合实验。

5

体内异种移植实验验证肿瘤生长和脂质积累

验证PRMT5-USP7-G3BP2轴在体内对肿瘤生长和脂质积累的影响。

将Tu686细胞(稳定敲低G3BP2、USP7或过表达G3BP2-WT、G3BP2-R468K)皮下注射到裸鼠,测量肿瘤体积和重量,进行Ki-67免疫组化和油红O染色。

6

临床样本验证G3BP2甲基化与预后相关性

验证G3BP2甲基化在临床HNSC组织中的表达及其与预后的关系。

对50对HNSC及癌旁组织进行免疫组化染色检测G3BP2、PRMT5、USP7和甲基化G3BP2表达,并进行生存分析和TCGA数据库验证。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
RPMI-1640培养基Gibco--
DMEM培养基Gibco--
胎牛血清----
青霉素-链霉素----
Lipofectamine 3000转染试剂Life Technologies/Invitrogen--
MG132蛋白酶体抑制剂----
RIPA裂解液----
蛋白A/G磁珠----
快速银染试剂盒Beyotime--
抗PRMT5抗体Abcamab109451
抗G3BP2抗体Proteintech16276-1-AP
抗G3BP2抗体Abcamab86135
抗Flag抗体Cell Signaling Technology9A3
抗α-微管蛋白抗体MilliporeSigmaT6074
抗USP7抗体Cell Signaling Technology4833S
抗ACLY抗体Cell Signaling Technology4332
抗FASN抗体Cell Signaling Technology3180
抗PPARγ抗体Bioss Antibodies33436M
抗SCD1抗体Bioss Antibodies3787R
抗nSREBP1抗体Abcamab159577
抗ELOVL6抗体Abcamab69857
抗ACSL3抗体Abcamab151959
抗甲基化G3BP2抗体(定制)----
双荧光素酶报告基因检测试剂盒Promega--
LentiCRISPRv2质粒----
psPAX2包装质粒----
pMD2G包装质粒----
嘌呤霉素----
CCK-8试剂盒MCEHY-K0301
Spark多功能酶标仪Tecan--
结晶紫----
谷胱甘肽琼脂糖4B磁珠GE Healthcare--
Ni-NTA琼脂糖磁珠Qiagen--
超高效液相色谱系统Thermo Fisher Scientific--
Q Exactive HFX质谱仪Thermo--
UPLC BEH Amide色谱柱----
S-腺苷甲硫氨酸,[甲基-3H]----
基质胶Corning--
Transwell小室Corning--
HiScript Q RT SuperMix试剂盒Vazyme Biotech--
SYBR Green预混液Vazyme Biotech--
LightCycler 480实时荧光定量PCR仪Roche--
GSK3326595(PRMT5抑制剂)----
P5091(USP7抑制剂)----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
细胞培养与转染
细胞系(HEK293、Tu686、Tu212、CAL-27等)来源;培养基(RPMI-1640或DMEM)及添加物(10% FBS、1%青霉素-链霉素);转染试剂Lipofectamine 3000用量;质粒、siRNA、shRNA序列
阅读提示:Methods: Cell lines and transfections
蛋白相互作用与修饰分析
免疫沉淀与免疫印迹的具体条件;抗体浓度及来源;质谱分析条件;甲基化位点验证(R468K突变)
阅读提示:Methods: Immunoprecipitation and Immunoblotting analysis; Results 图1
蛋白稳定性实验
CHX浓度(50 μg/mL)和时间点(2、4、6小时);MG132浓度(40 μM)和处理时间(6小时);蛋白酶体抑制剂对照
阅读提示:Methods: Cell lines and transfections; Results 图2D
脂质代谢功能实验
RT-PCR和Western blot检测的脂质基因(ACLY、FASN等);荧光素酶报告基因实验条件(共转染、检测时间60小时);油红O染色条件
阅读提示:Methods: Luciferase reporter analysis; Results 图4
体内动物实验
小鼠品系(裸鼠)和年龄(4-5周);注射细胞数和体积;测量时间点;对照组设置;肿瘤体积计算公式
阅读提示:Methods: Xenograft mouse model and Immunohistochemistry; Results 图6