体外铁死亡敏感性检测
确定LDLR介导的胆固醇摄取是否调节肿瘤细胞对铁死亡诱导剂的敏感性。
使用siRNA敲低LDLR、LDLRAP1或PCSK9,检测HT1080细胞对RSL3和erastin的敏感性,以及LPO水平。
Accumulated cholesterol protects tumours from elevated lipid peroxidation in the microenvironment.
体外细胞实验、临床样本分析、体内异种移植模型等多个证据层级,并包含功能验证和机制验证。
A375黑色素瘤细胞系 HT1080纤维肉瘤细胞系 A549肺癌细胞系(包括耐erastin的持久性细胞) BALB/c裸鼠A375异种移植模型
LDLR介导的胆固醇摄取对铁死亡敏感性的影响 胆固醇补充(LDL、HDL、胆固醇-MβCD)对铁死亡的作用 MβCD消耗胆固醇对肿瘤生长和脂质过氧化的影响 膜流动性和脂筏形成的变化 肾癌患者组织中4-HNE与FLOT1的相关性
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定LDLR介导的胆固醇摄取是否调节肿瘤细胞对铁死亡诱导剂的敏感性。
使用siRNA敲低LDLR、LDLRAP1或PCSK9,检测HT1080细胞对RSL3和erastin的敏感性,以及LPO水平。
验证胆固醇累积是否足以抑制铁死亡,并探究其机制。
在多种癌细胞中补充LDL、HDL或胆固醇-MβCD,或使用MβCD消耗胆固醇,检测铁死亡敏感性和LPO。
验证胆固醇是否通过降低膜流动性和促进脂筏形成来抑制LPO。
测量TMA-DPH荧光偏振评估膜流动性;用荧光染料标记脂筏(GM1、FLOT1);在体外脂质体系统中测试胆固醇对LPO的影响。
评估靶向TME胆固醇是否增强铁死亡诱导剂的抗肿瘤效果。
在A375异种移植模型中,单独或联合使用MβCD和ML210处理,监测肿瘤生长、LPO水平和脂质过氧化标志物。
在患者肿瘤组织中验证脂质过氧化与脂筏的相关性。
收集肾癌患者的肿瘤及邻近组织,进行免疫荧光染色检测4-HNE和FLOT1,并分析其相关性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 铁死亡诱导剂 | Erastin | Selleckchem | -- |
| RSL3 | Selleckchem | -- | |
| ML210 | Selleckchem | -- | |
| 铁死亡抑制剂 | Liproxstatin-1 | Selleckchem | -- |
| 化疗药物 | 环磷酰胺 | TargetMol | -- |
| 紫杉醇 | TargetMol | -- | |
| 胆固醇转运抑制剂 | U18666A | TargetMol | -- |
| 化疗药物 | 顺铂 | TargetMol | -- |
| 5-氟尿嘧啶 | TargetMol | -- | |
| PPARγ激动剂 | 罗格列酮 | MedChemExpress | -- |
| 胆固醇消耗剂 | 甲基-β-环糊精 | MedChemExpress | -- |
| ACAT抑制剂 | Avasimibe | MedChemExpress | -- |
| 脂质处理 | 胆固醇 | MedChemExpress | -- |
| HMGCR抑制剂 | 洛伐他汀 | Sigma | -- |
| 细胞因子处理 | 干扰素-γ | MedChemExpress | -- |
| 脂质处理 | 低密度脂蛋白 | Guangzhou Yiyuan Biological Technology Co., Ltd. | -- |
| 氧化低密度脂蛋白 | Guangzhou Yiyuan Biological Technology Co., Ltd. | -- | |
| 高密度脂蛋白 | Guangzhou Yiyuan Biological Technology Co., Ltd. | -- | |
| Dil标记低密度脂蛋白 | Guangzhou Yiyuan Biological Technology Co., Ltd. | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | VivaCell | -- |
| McCoy's 5A培养基 | Procell Life Science & Technology Co., Ltd | PM150710B | |
| α-MEM培养基 | VivaCell | -- | |
| 1640培养基 | VivaCell | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青链霉素 | HAKATA | H8610 | |
| 细胞活性检测 | Calcein-AM | absin | abs42014734 |
| CCK-8试剂盒 | TargetMol | C0005 | |
| 脂质过氧化检测 | C11-BODIPY 581/591 | Invitrogen | D3861 |
| 胆固醇检测 | Amplex Red胆固醇检测试剂盒 | Invitrogen | A12216 |
| 胆固醇染色 | 菲律宾菌素 | Sigma-Aldrich | SAE0088 |
| 蛋白浓度测定 | BCA蛋白检测试剂盒 | LABLEAD Inc. | B5000 |
| MDA检测 | TBARS检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | S0131S |
| siRNA转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Invitrogen | 13778030 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596026 |
| TRIzol试剂 | Yeasen | 10606ES60 | |
| cDNA合成 | TransScript II第一链cDNA合成预混液 | TransGen Biotech | AT301-02 |
| qPCR | Hieff UNICON通用蓝色qPCR SYBR Green预混液 | Yeasen | 11184ES03 |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime Biotechnology | P0013B |
| 蛋白酶磷酸酶抑制剂混合物 | Thermo Fisher Scientific | 87786 | |
| 脱脂牛奶 | LABLEAD Inc. | N7861 | |
| 抗LDLR抗体 | Abcam | ab271189 | |
| 抗GPX4抗体 | Abcam | ab125066 | |
| 抗ACSL4抗体 | Abcam | ab155282 | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Proteintech | 11224-1-AP | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Bioss | bsm-33036M | |
| 肿瘤消化 | I型胶原酶 | Gibco | 17100017 |
| 1640培养基 | Gibco | 31870082 | |
| 70 μm细胞筛网 | Falcon | 352350 | |
| 脂筏染色 | Vybrant Alexa Fluor 555脂筏标记试剂盒 | Invitrogen | V34405 |
| DAPI | Solarbio | C0065 | |
| 膜流动性检测 | TMA-DPH | TargetMol | T19068 |
| 免疫荧光 | 柠檬酸钠抗原修复液 | Solarbio | C1032 |
| 牛血清白蛋白 | Life-iLab | AP36L014 | |
| 抗4-HNE抗体 | Abcam | ab46544 | |
| 抗FLOT1抗体 | Abcam | ab133497 | |
| DyLight 488偶联抗山羊IgG | EarthOx | E032231 | |
| DyLight 594偶联抗兔IgG | EarthOx | E032421 | |
| 含DAPI的抗荧光淬灭封片剂 | Solarbio | S2100 | |
| Vectra Polaris自动化定量病理成像系统 | -- | -- | |
| 显微镜 | Olympus IX83倒置显微镜 | Olympus | -- |
| Nikon A1R SI共聚焦显微镜 | Nikon | -- | |
| 流式细胞术 | BD FACSCalibur流式细胞仪 | BD | -- |
| qPCR | ABI Quant Studio 6实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- |
| 蛋白定量 | Thermo Scientific Multiskan SkyHigh酶标仪 | Thermo Scientific | -- |
| 超速离心 | Beckman Optima XPN-100超速离心机 | Beckman | -- |
| 色谱 | AKTA purifier 100蛋白质纯化系统 | GE Healthcare | -- |
| Superose 6 Increase 10/300 GL凝胶色谱柱 | GE Healthcare | -- | |
| 脂质过氧化检测 | 大豆磷脂混合物 | Sigma | -- |
| 亚油酸甲酯 | Sigma | -- | |
| 亚油酸 | Sigma | -- | |
| 阿霉素 | Sigma | -- | |
| 脂质过氧化诱导 | 氙弧灯 | -- | -- |
| TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596-026 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基类型、血清浓度、培养条件 阅读提示:Materials and methods, Cell line culture |
| 铁死亡诱导 | 铁死亡诱导剂(RSL3、ML210、erastin)的浓度和处理时间 阅读提示:Materials and methods, Chemicals; Figure legends (Fig. 2, 3) |
| 胆固醇处理 | LDL、HDL、胆固醇-MβCD的浓度,MβCD的浓度 阅读提示:Materials and methods, Modification of membrane cholesterol; Figure legends (Fig. 3) |
| 基因敲低 | siRNA序列、转染试剂、转染时间 阅读提示:Materials and methods, siRNA transfection |
| 动物实验 | 动物品系、性别、年龄、细胞接种数量、给药剂量和频率 阅读提示:Materials and methods, Xenograft assay |
| 脂质过氧化检测 | C11-BODIPY浓度、孵育时间;MDA检测试剂盒和方法 阅读提示:Materials and methods, Lipid peroxidation assay, Xenograft lipid peroxidation |
| 膜流动性和脂筏检测 | TMA-DPH浓度、孵育时间;脂筏标记方法 阅读提示:Materials and methods, Membrane fluidity test, Lipid raft staining |