分子对接预测靶点
预测豆甾醇在哮喘中的潜在作用靶点,并确定最优靶点。
从TCMSP数据库获取豆甾醇相关疾病和哮喘相关靶点,使用AutoDock Vina进行分子对接,计算豆甾醇与34个哮喘相关靶点的结合能。
Stigmasterol alleviates allergic airway inflammation and airway hyperresponsiveness in asthma mice through inhibiting substance-P receptor.
研究包含分子对接、细胞实验(IL-13诱导的BEAS-2B)、动物模型(OVA诱导的哮喘小鼠)及体内外功能验证(炎症、氧化应激、气道反应性)等相互独立的证据层级,并包含NK1-R拮抗剂和激动剂的机制验证。
IL-13诱导的BEAS-2B细胞 OVA诱导的哮喘小鼠模型
豆甾醇浓度: 10 μg/mL和20 μg/mL处理BEAS-2B细胞48小时 OVA致敏和攻击方案: 腹腔注射20 μg OVA(第0、7、14天),第21-27天雾化吸入20 μg/mL OVA 豆甾醇体内给药: 100 mg/kg腹腔注射,第21-27天每天一次 NK1-R拮抗剂WIN62577处理: 体外0.1 μM,体内300 μg/只 气道高反应性检测: 使用flexivent测量肺阻力,在递增浓度乙酰甲胆碱(0-40 mg/mL)下进行
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
预测豆甾醇在哮喘中的潜在作用靶点,并确定最优靶点。
从TCMSP数据库获取豆甾醇相关疾病和哮喘相关靶点,使用AutoDock Vina进行分子对接,计算豆甾醇与34个哮喘相关靶点的结合能。
评估豆甾醇对BEAS-2B细胞的毒性,确定安全浓度范围。
使用MTT法检测不同浓度豆甾醇处理BEAS-2B细胞48小时后的细胞活力。
验证豆甾醇对IL-13诱导的BEAS-2B细胞炎症和氧化应激的影响。
用IL-13诱导BEAS-2B细胞建立哮喘细胞模型,然后用低剂量(10 μg/mL)和高剂量(20 μg/mL)豆甾醇处理,检测炎症因子(IL-4、IL-5、IFN-γ)和氧化应激指标(MDA、SOD、CAT)及ROS水平。
检测豆甾醇对IL-13诱导的BEAS-2B细胞中NK1-R表达的影响。
使用免疫荧光染色和Western blot检测NK1-R蛋白表达水平。
验证NK1-R是否为豆甾醇发挥抗炎和抗氧化作用的关键靶点。
使用NK1-R特异性拮抗剂WIN62577和激动剂(重组人NK1-R蛋白)处理细胞,检测炎症因子和氧化应激指标的变化。
在体内验证豆甾醇对OVA诱导哮喘小鼠的保护作用及NK1-R的作用。
建立OVA诱导的哮喘小鼠模型,分组给予豆甾醇、WIN62577和rh-NK1R蛋白,检测气道高反应性、BALF中炎症细胞和细胞因子、氧化应激指标、肺组织病理改变及NK1R表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 胰蛋白酶 | -- | -- | |
| 细胞毒性检测 | MTT | -- | -- |
| 二甲基亚砜 | -- | -- | |
| 细胞处理 | 重组人IL-13 | Abcam | ab270079 |
| 豆甾醇 | -- | -- | |
| WIN62577 | Sigma | 138091-43-7 | |
| 重组人NK1-R蛋白 | Abcam | ab152721 | |
| 流式分析 | DCFH-DA荧光探针 | Jiangsu KeyGEN BioTECH Corp., Ltd | KGT010-1 |
| 免疫荧光 | 抗神经激肽1受体抗体 | Bioss | bs-0064R |
| Cy3标记的山羊抗兔IgG (H+L) | Beyotime | A0516 | |
| DAPI | -- | -- | |
| Western blot | TRIzol试剂 | -- | -- |
| 神经激肽-1受体多克隆抗体 | Proteintech | 17942-1-AP | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 10494-1-AP | |
| 二抗 | Abcam | ab6721 | |
| 动物实验 | 卵清蛋白 | -- | -- |
| 铝佐剂 | -- | -- | |
| BALF分析 | IL-4 ELISA试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | H005 |
| IL-5 ELISA试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | H006 | |
| IFN-γ ELISA试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | H025 | |
| MDA检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A-003-1-2 | |
| SOD检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A001-3-2 | |
| CAT检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A007-1-1 | |
| GSH检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A005-1-2 | |
| 病理染色 | PAS染色试剂盒 | Solarbio | G1281 |
| 气道高反应性检测 | flexivent | SCIREQ, Emka Technologies | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | BEAS-2B细胞系来源(Pricella, CL-0496);培养条件(DMEM+10%FBS+1%青霉素-链霉素,37°C,5% CO2);IL-13刺激浓度20 ng/mL,时间72小时;豆甾醇浓度10和20 μg/mL,时间48小时。 阅读提示:Materials and methods: Cell incubation, Cell administration |
| MTT细胞毒性检测 | 豆甾醇浓度梯度(0-60 μg/mL),孵育时间48小时;MTT孵育4小时;DMSO溶解;检测波长490 nm。 阅读提示:Materials and methods: MTT assay |
| 体外机制验证 | WIN62577浓度0.1 μM,处理24小时;重组人NK1R蛋白浓度1 μM,处理24小时;联合处理组(Stig+rh-NK1R)浓度及时间。 阅读提示:Materials and methods: Cell administration Part 2 |
| 动物模型及给药 | 小鼠品系、性别、周龄(雄性C57BL/6J,6周龄);OVA致敏方案(第0、7、14天腹腔注射20 μg OVA+Alum);OVA攻击方案(第21-27天雾化吸入20 μg/mL OVA,每天30分钟);给药剂量和时间(豆甾醇100 mg/kg,WIN62577 300 μg,rh-NK1R 100 μg,第21-27天攻击前腹腔注射)。 阅读提示:Materials and methods: OVA-induced mice model of asthma and administration |
| 气道高反应性检测 | 使用flexivent系统;麻醉(3%戊巴比妥钠50 mg/kg);机械通气参数(呼吸频率150次/分钟,潮气量0.2 mL,PEEP 2 mL H2O);乙酰甲胆碱浓度梯度(0-40 mg/mL);检测肺阻力。 阅读提示:Materials and methods: Airway hyperreactivity detection |