RNA甲基化调控因子交互作用及免疫浸润的综合分析用于糖尿病肾病的预测和个性化治疗

背景：RNA甲基化是一种广为人知的转录后调控，存在于许多癌症和免疫系统疾病中。然而，五种RNA甲基化调控因子在糖尿病肾病（DN）和免疫微环境中的潜在作用和交互作用仍不清楚。方法：在来自5个基因表达综合（GEO）数据集的112个样本中鉴定了37个RNA修饰调控因子及相关基因的mRNA表达。采用非负矩阵分解聚类方法确定RNA修饰模式。采用ssGSEA算法和人白细胞抗原表达评估免疫微环境特征。构建基于修饰调控因子相关差异表达基因的风险模型，以评估其对DN患者的预测能力。此外，通过免疫荧光共定位和体外蛋白实验验证结果。结果：我们发现与对照组相比，DN组肾小球中有24个RNA甲基化调控因子显著差异表达。使用单变量Logistic回归和综合LASSO回归，将4个甲基化相关基因和6个RNA调控因子引入风险评分模型，该模型能够精确区分DN患者和健康个体。高风险评分组与高免疫浸润相关。鉴定出三种不同的RNA修饰模式，其在免疫微环境、生物学通路和eGFR方面存在显著差异。验证分析显示，与正常葡萄糖培养的细胞相比，DN足细胞系中METTL3、ADAR1、DNMT1表达上调，而YTHDC1表达下调。结论：我们的研究表明RNA甲基化调控因子和免疫浸润调节在DN发病机制中发挥关键作用。生物信息学分析与体外验证相结合，可为鉴定DN中预测性RNA甲基化调控因子提供有力证据。