预测并验证 mortalin 的靶向 miRNA
鉴定能够调控 mortalin 表达的 miRNA。
通过四个数据库(TargetScan、miRanda、miRDB、MicroCosm)预测候选 miRNA,并利用双荧光素酶报告实验验证 miR-200b/c 与 mortalin 3'-UTR 的直接结合。
A Regulatory Loop Involving miR-200c and NF-κB Modulates Mortalin Expression and Increases Cisplatin Sensitivity in an Ovarian Cancer Cell Line Model.
包含体外细胞实验(增殖、迁移、凋亡、荧光素酶报告)、体内移植瘤模型及临床数据相关性分析,并进行了功能验证(过表达/抑制、回复实验)和机制验证(ChIP、p53核转位)。
A2780S 卵巢癌细胞系 A2780CP 顺铂耐药卵巢癌细胞系 293T 细胞 裸鼠皮下移植瘤模型
miR-200b/c 对 mortalin 3'-UTR 的直接靶向作用(双荧光素酶报告实验) miR-200c 对卵巢癌细胞顺铂敏感性的影响(CCK-8 和凋亡检测) NF-κB p65 与 miR-200b/c 启动子的结合(ChIP 实验) 体内实验中 agomiR-200c 对肿瘤生长和 mortalin 表达的影响(裸鼠移植瘤模型) TCGA 数据库中 miR-200c 表达与患者预后的相关性
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定能够调控 mortalin 表达的 miRNA。
通过四个数据库(TargetScan、miRanda、miRDB、MicroCosm)预测候选 miRNA,并利用双荧光素酶报告实验验证 miR-200b/c 与 mortalin 3'-UTR 的直接结合。
确定 miR-200b/c 是否影响卵巢癌细胞的增殖和迁移。
在 A2780S 和 A2780CP 细胞中过表达或抑制 miR-200b/c,检测细胞活力、迁移能力及信号通路蛋白磷酸化水平。
探究 miR-200c 是否通过调控 mortalin 影响卵巢癌细胞对顺铂的敏感性。
在 A2780CP 细胞中过表达 miR-200c,并联合或不联合 mortalin 过表达,检测细胞活力、凋亡及 p53 表达和定位。
验证 miR-200c 在体内是否抑制肿瘤生长并增强顺铂疗效。
构建 A2780CP 细胞皮下移植瘤模型,瘤内注射 agomiR-200b/c 或 NC,并腹腔注射顺铂,测量肿瘤体积和重量,检测 mortalin 表达。
评估 miR-200c 表达水平与卵巢癌患者预后的关系。
利用 TCGA 卵巢癌数据,分析 miR-200b/c 表达与临床分期、总生存期及 mortalin 表达的相关性。
确定 NF-κB p65 与 miR-200b/c 之间的调控关系及其对 mortalin 的共同调节。
过表达 NF-κB p65 检测 miR-200b/c 表达,并利用 ChIP 实验验证 p65 与 miR-200b/c 启动子的结合;在 NF-κB 过表达细胞系中转染 miR-200b/c mimic,检测 mortalin 表达和细胞功能。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | meilunbio | -- |
| 胎牛血清 | yeasen | -- | |
| 细胞转染 | Hieff TransTM脂质体转染试剂 | yeasen | -- |
| 双荧光素酶报告实验 | pmiRGLO荧光素酶报告载体 | Youbio | -- |
| 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Beyotime | -- | |
| Multiskan MK3酶标仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Vazyme | -- |
| cDNA合成 | HiScript III第一链cDNA合成试剂盒 | Vazyme | -- |
| qPCR | Hieff® qPCR SYBR Green预混液 | yeasen | -- |
| LightCycler Nano实时荧光定量PCR仪 | Roche | -- | |
| miR-200b引物 | RiboBio | MQPS0000781-1-100 | |
| miR-200c引物 | RiboBio | MQPS0000783-1-100 | |
| U6引物 | RiboBio | MQPS0000002-1-100 | |
| Western blot | 二抗 | Proteintech | -- |
| 超敏化学发光试剂 | meilunbio | -- | |
| Gel Doc XR凝胶成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| 抗Mortalin抗体 | Cell Signaling Technology | 3593S | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 6004-1-Ig | |
| 抗PARP1抗体 | Proteintech | 13371-1-AP | |
| 抗Caspase-3抗体 | Proteintech | 19677-1-AP | |
| 抗p53抗体 | Proteintech | 60283-2-Ig | |
| 抗p65抗体 | Proteintech | 10745-1-AP | |
| 抗Erk1/2抗体 | Bioss | bsm-53359R | |
| 抗磷酸化Erk1/2抗体 | Proteintech | 28733-1-AP | |
| 抗Akt抗体 | Cell Signaling Technology | 88800SF | |
| 抗磷酸化Akt抗体 | Cell Signaling Technology | 4060S | |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor 488(563)偶联二抗 | yeasen | -- |
| DAPI | meilunbio | -- | |
| DM2500荧光显微镜 | Leica | -- | |
| 抗 cleaved Caspase-3 抗体 | Cell Signaling Technology | 9664 | |
| Transwell实验 | 24孔Transwell小室 | Corning | -- |
| 结晶紫染色液 | meilunbio | -- | |
| 流式细胞术 | Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | meilunbio | -- |
| 流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 动物实验 | Matrigel基质胶 | CORNING | -- |
| 免疫组化 | DAB显色液 | Dako | -- |
| ChIP实验 | ChIP检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| NF-κB p65抗体 | Cell Signaling Technology | 8242 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与转染 | 细胞系来源:A2780S (ECACC 93112519)、A2780CP (ECACC 93112517)、293T (ATCC CRL-3216);转染浓度:miRNA mimic/inhibitor 50 nM;转染试剂:Hieff Trans 阅读提示:参见 Materials and Methods 4.1 Cell Culture and Transfection |
| 双荧光素酶报告实验 | 质粒:pmiRGLO-mortalin 3'-UTR 野生型/突变型;共转染 293T 细胞;检测时间:转染后 24 h 阅读提示:参见 Materials and Methods 4.2 Dual Luciferase Reporter Assay and Mortalin 3′-UTR Site Mutagenesis |
| 细胞增殖与迁移实验 | CCK-8 检测:1000 细胞/孔;划痕实验:细胞达到 90-100% 融合,0 和 48 h 观察;Transwell:2×10^5 细胞/孔,24 h 阅读提示:参见 Materials and Methods 4.6, 4.7, 4.8 |
| 顺铂耐药实验 | A2780CP 细胞转染 miR-200c mimic 后,顺铂浓度:0, 10, 20, 40 μM;处理时间:24 h;细胞密度:5000 细胞/孔 阅读提示:参见 Materials and Methods 4.8 Determination of Cell Viability |
| 体内移植瘤实验 | 动物:雌性裸鼠;细胞接种:A2780CP 5×10^6 与 Matrigel 混合皮下接种;分组:无治疗、顺铂+NC、顺铂+agomiR-200b、顺铂+agomiR-200c;顺铂剂量:3 mg/kg 腹腔注射;agomiR 剂量:3 nmol/只瘤内注射;给药频率:每三天一次;肿瘤体积测量:每三天 阅读提示:参见 Materials and Methods 4.10 Xenograft Tumor Growth Study |
| TCGA数据分析 | 数据来源:TCGA 卵巢癌数据(489例);分析方法:Pearson相关、Kaplan-Meier、log-rank 检验 阅读提示:参见 Materials and Methods 4.12 Analysis of Clinical Ovarian Cancer Data from TCGA Dataset |