检测内源Dvl2相分离
观察内源Dvl2是否形成液滴样凝聚体
生成Dvl2-mEGFP敲入HEK293T细胞,使用GI-SIM和FRAP分析内源Dvl2的分布和动力学。
Dishevelled phase separation promotes Wnt signalosome assembly and destruction complex disassembly.
包含体外相分离实验、细胞成像(GI-SIM/TIRF)、基因编辑敲除/敲入、体内功能验证(TopFlash报告基因)等多层级证据。
HEK293T细胞 Dvl1/2/3敲除HEK293T细胞 Dvl2-mEGFP敲入HEK293T细胞 Axin1-tdTomato敲入HEK293T细胞
Wnt3a刺激浓度和时长 Dvl2-mEGFP或Axin1-tdTomato敲入细胞系 PEG8000浓度及相分离诱导条件 蛋白浓度(如0.2 μM Dvl2、0.5 μM Axin1) FRAP参数(荧光恢复率)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
观察内源Dvl2是否形成液滴样凝聚体
生成Dvl2-mEGFP敲入HEK293T细胞,使用GI-SIM和FRAP分析内源Dvl2的分布和动力学。
验证Dvl2是否具备液-液相分离特性
纯化MBP-Dvl2蛋白,加入PEG8000诱导相分离,观察液滴形成和融合。
确定Dvl2中负责LLPS的氨基酸区域
构建Dvl2缺失突变体并转染Dvl1/2/3 KO细胞,观察puncta形成。
实时追踪Wnt刺激下Dvl2和Axin1在质膜上的募集顺序
使用TIRF-SIM成像Dvl2-mEGFP和Axin1-tdTomato敲入细胞,记录Wnt3a处理后荧光强度变化。
确定Dvl2 LLPS是否对信号体组装必要
表达Dvl2-EGFP或Dvl2(dRE)-EGFP于KO细胞,用TIRF检测质膜puncta大小和数量。
探究Dvl2是否调节Axin1的LLPS
共表达Dvl2或Dvl2(dRE)与Axin1-mCherry,观察puncta大小和数目;体外混合纯化蛋白进行LLPS实验。
验证Dvl2 LLPS是否能抑制β-catenin降解
体外磷酸化实验检测β-catenin磷酸化水平;TopFlash报告基因检测Wnt信号活性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Corning | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 细胞转染 | VigoFect转染试剂 | Vigorous Biotechnology | -- |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| 免疫印迹 | Dvl2抗体 | Cell Signaling Technology | 3216 |
| Dvl1抗体 | Santa Cruz Technology | sc-8025 | |
| Dvl3抗体 | Santa Cruz Technology | sc-8027 | |
| β-catenin抗体 | Santa Cruz Technology | SC7963 | |
| CK1α抗体 | Abcam | ab108296 | |
| GSK3β抗体 | Cell Signaling Technology | 12456 | |
| 磷酸化β-catenin (S45)抗体 | Cell Signaling Technology | 9564 | |
| 磷酸化β-catenin (S33,37,T41)抗体 | Cell Signaling Technology | 2009 | |
| Axin1抗体 | Cell Signaling Technology | 2074 | |
| Flag抗体 | Bioss Antibodies | bsm-33346M | |
| GFP抗体 | Santa Cruz Technology | scc8334 | |
| 基因编辑 | PX459质粒 | Addgene | #48139 |
| 蛋白纯化 | 直链淀粉树脂 | NEB | -- |
| HiPrep 26/60 Sephacryl S-200 HR柱 | GE Healthcare | 17-1195-01 | |
| AKTA纯化系统 | GE Healthcare | -- | |
| 荧光标记 | Alexa Fluor 488 NHS酯 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 磺基花青素3马来酰亚胺 | Lumiprobe | -- | |
| Alexa Fluor 647 NHS酯 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 脱盐柱 | Thermo Fisher Scientific | 89882 | |
| 浊度测定 | VARIOSKAN FLASH酶标仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 成像 | NIKON A1 HD25显微镜 | Nikon | -- |
| 多色结构光照明显微系统 | NanoInsights | -- | |
| ORCA-Fusion C14440-20UP相机 | HAMAMATSU | C14440-20UP | |
| 质谱分析 | Q-Exactive HF-X杂化四极杆-Orbitrap质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Thermo-Dionex Ultimate 3000高效液相色谱系统 | Thermo Fisher Scientific | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与基因编辑 | HEK293T细胞来源、培养基成分、Dvl1/2/3 KO及Dvl2-mEGFP敲入细胞系构建方法 阅读提示:Materials and methods: Cell culture, Gene editing |
| 体外相分离实验 | Dvl2蛋白浓度、盐浓度、PEG8000浓度 阅读提示:Materials and methods: In vitro phase separation assay |
| TIRF成像 | Wnt3a浓度和处理时间、成像时间间隔 阅读提示:Materials and methods: GI-SIM/TIRF-SIM imaging, Figure legends |
| FRAP分析 | 荧光标记浓度、光漂白区域和恢复率 阅读提示:Materials and methods: FRAP analysis |
| TopFlash报告基因实验 | 转染量、Wnt3a处理时间、检测时间 阅读提示:Materials and methods: Reporter assays, Figure 4E legend |