细胞增殖和活力评估
确定蟾毒灵对CRC细胞增殖和活力的影响。
对HCT116、DLD1和SW480细胞进行MTT测定,计算IC50;LIVE/DEAD染色评估细胞活力。
Bufalin Inhibits Tumorigenesis, Stemness, and Epithelial-Mesenchymal Transition in Colorectal Cancer through a C-Kit/Slug Signaling Axis.
包含细胞系体外实验、患者来源类器官实验、网络分析和TCGA数据相关性分析等多个独立证据层级,并有功能验证(球体形成、迁移侵袭)和机制验证(C-Kit/Slug过表达)。
结直肠癌细胞系HCT116、DLD1、SW480、HCT15 结直肠癌患者来源类器官(PDOs:T0519、T0528、T0714、T1208、T1101)
细胞系:HCT116、DLD1、SW480,处理浓度20或40 nM蟾毒灵,处理时间24-72小时 PDO培养:从结肠镜活检组织分离,在Matrigel中培养,成熟后加入20或40 nM蟾毒灵处理 C-Kit过表达:SW480细胞转染KIT-OE质粒,通过球体形成和Western blot验证功能 Slug过表达:DLD1细胞感染Slug慢病毒激活颗粒,通过球体形成和Western blot验证功能 统计:使用Student's t-test和ANOVA,P<0.05为显著
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定蟾毒灵对CRC细胞增殖和活力的影响。
对HCT116、DLD1和SW480细胞进行MTT测定,计算IC50;LIVE/DEAD染色评估细胞活力。
评估蟾毒灵对CRC细胞迁移和侵袭能力的影响。
使用Transwell小室进行迁移和侵袭实验,以含10% FBS的培养基作为趋化因子。
检测蟾毒灵对EMT标志物和β-连环蛋白亚细胞定位的影响。
免疫荧光和Western blot检测β-连环蛋白核转位及EMT标志物(N-钙粘蛋白、ZEB1、Slug)表达。
检测蟾毒灵对CRC细胞球体形成能力和ALDH活性的影响。
进行Matrigel球体形成实验和ALDEFLUOR流式细胞术分析,并检测ALDH1A1表达。
验证C-Kit和Slug之间的正反馈关系及其对蟾毒灵敏感性的影响。
分别在SW480和DLD1细胞中过表达C-Kit和Slug,检测下游蛋白表达和球体形成能力。
在临床相关模型中验证蟾毒灵的抗肿瘤作用及其机制。
从患者结肠镜活检组织中建立PDOs,用蟾毒灵处理,观察生长抑制和凋亡,并通过Western blot检测相关蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| PDO建立 | D-PBS缓冲液 | STEMCELL | 37350 |
| 普利莫辛抗生素 | InvivoGen | ant-pm-2 | |
| 温和细胞解离试剂 | STEMCELL | 7174 | |
| DMEM/F12培养基 | STEMCELL | 36254 | |
| 牛血清白蛋白 | Solarbio | A8010 | |
| 70微米细胞筛网 | STEMCELL | 27216 | |
| 低生长因子Matrigel基质胶 | Corning | 356231 | |
| Complete IntestiCult类器官生长培养基 | STEMCELL | 6005 | |
| PDO冻存 | CS10冻存液 | STEMCELL | 7931 |
| 药物处理 | 蟾毒灵 | MCE | HY-N0877 |
| 二甲基亚砜 | Sigma | D2650 | |
| 蛋白提取 | 哺乳动物蛋白提取试剂 | Thermo-Fisher | 78501 |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | MCE | HY-K0010 | |
| PDO生长实验 | 钙黄绿素-AM | Keygen | KGMP012-1 |
| 细胞培养 | 高糖培养基 | Hyclone | SH30022.01B |
| 胎牛血清 | PAN | ST30-3302 | |
| 抗生素-抗真菌剂 | Gibco | 2108964 | |
| 细胞增殖 | MTT试剂 | Solarbio | M1025 |
| 氢氧化铵 | Sigma | 30501 | |
| Spark多功能酶标仪 | TECAN | -- | |
| LIVE/DEAD实验 | 碘化丙啶 | Keygen | KGA107 |
| 迁移/侵袭实验 | 10%中性缓冲福尔马林 | Solarbio | G2161 |
| 结晶紫溶液 | Solarbio | G1062 | |
| 侵袭实验 | BD BioCoat Matrigel侵袭小室 | Corning | 354480 |
| 转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher | L3000008 |
| 慢病毒感染 | Slug慢病毒激活颗粒 | Santa Cruz Biotechnology | sc-400389-LAC |
| C-Kit慢病毒激活颗粒 | Santa Cruz Biotechnology | sc-400106-LAC | |
| copGFP对照慢病毒颗粒 | Santa Cruz Biotechnology | sc-108084 | |
| 对照慢病毒激活颗粒 | Santa Cruz Biotechnology | sc-437282 | |
| ALDEFLUOR实验 | ALDEFLUOR检测缓冲液 | STEMCELL | 01700 |
| BD FACSCalibur流式细胞仪 | BD | -- | |
| 核质分离 | Ne-per核质提取试剂盒 | Thermo-Fisher | 78833 |
| 免疫荧光 | 八孔玻璃腔室载玻片 | Ibidi | 80806 |
| 曲拉通X | Keygen | KGF011 | |
| β-连环蛋白一抗 | Abcam | aAb32672 | |
| 驴血清 | Solarbio | SL050 | |
| FITC偶联二抗 | Abcam | ab150073 | |
| DAPI染色液 | Beyotime | C1005 | |
| Leica DMI4000 B荧光显微镜 | Leica | -- | |
| Western blot | BCA蛋白浓度测定试剂盒 | Thermo-Fisher | 23227 |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 封闭液 | Abcam | ab126587 | |
| β-肌动蛋白抗体 | Santa Cruz Biotechnology | SC-47778 | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-IG | |
| N-钙粘蛋白 (D4R1H) XP® 抗体 | CST | 13116 | |
| ZEB1抗体 | CST | 3396 | |
| 波形蛋白 (D21H3) XP® 抗体 | CST | 5741 | |
| CD44抗体 | Proteintech | 60224-1-LG | |
| C-Myc抗体 | Proteintech | 10828-1-AP | |
| NANOG抗体 | Proteintech | 67255-1-lg | |
| SOX2抗体 | Proteintech | 66411-1-lg | |
| CD133抗体 | Proteintech | 66666-1-lg | |
| C-Kit抗体 | Proteintech | 18696-1-AP | |
| LGR5抗体 | Bioss | bs-20747R | |
| KLF4抗体 | Bioss | bs-1064R | |
| ALDH1A1抗体 | Solarbio | K000356P | |
| Slug抗体 | ABclonal | A1057 | |
| HRP标记亲和纯化山羊抗小鼠IgG(H+L) | Proteintech | SA00001-1 | |
| HRP标记亲和纯化山羊抗兔IgG(H+L) | Proteintech | SA00001-2 | |
| SuperLumia ECL Plus HRP底物 | Abbkine | K22030 | |
| BioRad Gel Doc XR+凝胶成像系统 | BioRad | -- | |
| 数据分析 | GraphPad Prism v8统计软件 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源和培养条件:HCT116、DLD1、SW480和HCT15购自中国科学院典型培养物保藏委员会细胞库,在高糖培养基中添加10% FBS和1%抗生素-抗真菌剂,在5% CO2和37°C下培养。 阅读提示:Materials and Methods: 4.4. Cell Lines and Culture |
| 药物处理 | 蟾毒灵浓度和处理时间:细胞实验使用20或40 nM,处理时间因实验而异(如MTT 72 h,迁移侵袭48 h);PDO实验使用20或40 nM,处理3天(Western blot)或长达10天(生长实验)。 阅读提示:Materials and Methods: 4.5, 4.6, 4.7, 4.10, 4.11, 4.12, 4.13;Figure legends 1-6 |
| PDO建立 | PDO建立步骤:从结肠镜活检组织中获得,用D-PBS加Primocin清洗,剪碎后用Gentle Cell Dissociation Reagent消化,通过70 µm筛网过滤,与Matrigel混合并按1000 crypts/well接种于24孔板,使用Complete IntestiCult培养基。 阅读提示:Materials and Methods: 4.1. Establishment and Cultivation of PDOs |
| 球体形成实验 | 球体形成实验条件:500细胞/孔与Matrigel混合于96孔板,加入不同浓度蟾毒灵(8、20、40 nM),培养10天,每3天换液。 阅读提示:Materials and Methods: 4.6. Matrigel Spheroid-Forming Assay |
| C-Kit/Slug过表达 | 过表达方法:C-Kit用Lipofectamine 3000转染;Slug用慢病毒感染,并用嘌呤霉素筛选。 阅读提示:Materials and Methods: 4.8. Plasmid Transfection, 4.9. Lentivirus Infection |
| 统计分析 | 统计方法:使用GraphPad Prism v8,Student's t-test和ANOVA用于组间比较,显著性水平P<0.05。 阅读提示:Materials and Methods: 4.14. Bioinformatics and Statistical Analysis |