基因克隆与序列分析
获取On-VIP和On-VIPR1的完整编码序列并分析其结构特征。
从罗非鱼肠道cDNA中克隆On-VIP和On-VIPR1的ORF,进行多序列比对、系统发育及结构域预测。
Vasoactive Intestinal Peptide (VIP) Protects Nile Tilapia (Oreochromis niloticus) against Streptococcus agalatiae Infection.
包含基因克隆、表达分析、体外细胞实验和体内感染实验,涵盖分子、细胞和动物水平验证。
尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus) 罗非鱼单核/巨噬细胞(MO/MΦ) 无乳链球菌感染模型
On-VIP合成肽纯度98%,溶解浓度1 mg/mL 体外LPS和LTA处理浓度为10 μg 体内感染剂量5×10^7 CFU/mL,100 μL/鱼 体内On-VIP用量16.66 μg(5 nmol)/鱼 生存率统计每组100条鱼,观察120 h
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获取On-VIP和On-VIPR1的完整编码序列并分析其结构特征。
从罗非鱼肠道cDNA中克隆On-VIP和On-VIPR1的ORF,进行多序列比对、系统发育及结构域预测。
检测On-VIP和On-VIPR1在健康罗非鱼各组织的分布。
用qRT-PCR和Western blot检测各组织mRNA和蛋白水平,并用荧光免疫组化定位肠道中的信号。
研究无乳链球菌感染后On-VIP和On-VIPR1的表达动态。
对罗非鱼腹腔注射无乳链球菌,在0-48小时收集各组织,用qRT-PCR检测表达变化。
评估On-VIP对罗非鱼MO/MΦ炎症反应和信号通路的影响。
分离罗非鱼头肾MO/MΦ,用LPS或LTA刺激,并加入On-VIP,检测炎症因子及通路相关基因表达。
验证On-VIP对罗非鱼抗感染的保护作用及机制。
将On-VIP与无乳链球菌混合腹腔注射罗非鱼,记录存活率、细菌载量及免疫相关基因表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| On-VIP合成 | On-VIP成熟肽 | Sangon Biotech | -- |
| 细菌培养 | BHI培养基 | Huankai Microbial | -- |
| 体外刺激 | 脂多糖 | Beyotime | -- |
| 脂磷壁酸 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 细胞培养 | L-15培养基 | Gibco | -- |
| 细胞分离 | Percoll分离液 | Solarbio | -- |
| 细胞消化 | 含0.05% EDTA的胰酶 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RNA提取 | RNAiso Plus试剂 | TaKaRa | -- |
| cDNA合成 | PrimeScript™ RT试剂盒(含gDNA去除剂) | TaKaRa | -- |
| qRT-PCR | TB Green® Premix Ex Taq™ II | TaKaRa | -- |
| 蛋白提取 | 蛋白提取试剂盒 | Solarbio | -- |
| Western blot | 6×蛋白上样缓冲液 | TRANS | -- |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| 干转仪 | Bio-rad | -- | |
| QuickBlock™封闭液 | Beyotime | -- | |
| 抗VIP抗体 | Bioss | bs-0077R | |
| 抗VIPR1抗体 | BOSTER | BA1462-2 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | ABclonal | AC026 | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG(H+L) | Beyotime | -- | |
| 超敏ECL化学发光试剂盒 | Beyotime | P0018S | |
| 免疫组化 | EDTA抗原修复液 | Beyotime | -- |
| Cy3标记的山羊抗兔IgG(H+L) | ABclonal | AS007 | |
| DAPI染液 | Beyotime | -- | |
| 显微镜观察 | ZEISS Axioscope 5显微镜 | Zeiss | -- |
| qRT-PCR | QuantStudio 6 Flex实时荧光定量PCR系统 | Thermo Fisher Scientific | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物饲养 | 鱼体重50±10 g,密度每1000 L水50条,温度、pH、溶解氧按参考文献 阅读提示:Material and Methods 4.1 Fish Preparation |
| On-VIP制备 | 合成肽序列及纯度98%,溶解浓度1 mg/mL 阅读提示:Material and Methods 4.2 On-VIP Preparation |
| 细菌感染 | S. agalactiae ZQ0910菌株培养条件(BHI培养基,28℃,10 h),感染剂量5×10^7 CFU/mL,100 μL/鱼 阅读提示:Material and Methods 4.3 |
| 体外MO/MΦ实验 | MO/MΦ分离(34%/51% Percoll),细胞浓度1×10^6 cells/mL,LPS/LTA浓度10 μg,On-VIP浓度0.1 μmol 阅读提示:Material and Methods 4.4 |
| 体内实验 | 分组(PBS, PBS+S.agalactiae, On-VIP+S.agalactiae),On-VIP剂量5 nmol/鱼,每组100条(生存率) 阅读提示:Material and Methods 4.10 |