仔猪体内感染模型建立与组织损伤评估
验证L. johnsonii L531对S. Infantis引起的肠道组织损伤的保护作用
将仔猪分为对照组、S. Infantis感染组和L. johnsonii L531预处理组,进行组织病理学观察。
Lactobacillusjohnsonii L531 Protects against Salmonella Infantis-Induced Intestinal Damage by Regulating the NOD Activation, Endoplasmic Reticulum Stress, and Autophagy.
包含仔猪体内模型和Caco2细胞体外模型两个独立证据层级,并进行了Western blot、免疫荧光、电子显微镜、siRNA敲低等功能和机制验证。
仔猪腹泻模型 Caco2细胞感染模型
S. Infantis感染浓度:1.0 × 10^11 CFU/mL,10 mL,第8天攻毒 L. johnsonii L531预处理:1.0 × 10^10 CFU/mL,10 mL,第1至7天每日一次 Caco2细胞感染复数:S. Infantis MOI=20,L. johnsonii L531 MOI=50,预处理3小时 自噬降解抑制剂氯喹(CQ)处理2小时 RIP2 siRNA转染条件:60-80%汇合度,转染5小时后继续培养36小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证L. johnsonii L531对S. Infantis引起的肠道组织损伤的保护作用
将仔猪分为对照组、S. Infantis感染组和L. johnsonii L531预处理组,进行组织病理学观察。
检测S. Infantis感染和L. johnsonii L531对NOD通路蛋白表达的影响
通过免疫荧光和Western blot检测仔猪空肠和回肠中NOD1、NOD2、RIP2蛋白表达。
检测S. Infantis感染和L. johnsonii L531对自噬相关蛋白表达的影响
通过免疫荧光和Western blot检测ATG16L1和IRGM,以及Il6 mRNA表达。
在体外验证L. johnsonii L531对NOD通路和自噬的影响
Caco2细胞分为对照组、S. Infantis感染组、L. johnsonii L531组和预处理组,检测相关蛋白表达和免疫荧光共定位。
验证L. johnsonii L531是否促进自噬降解
使用自噬降解抑制剂CQ处理Caco2细胞,比较LC3-II水平。
评估L. johnsonii L531对S. Infantis诱导的内质网应激和超微结构损伤的影响
通过SEM和TEM观察Caco2细胞超微结构,Western blot检测GRP78、IRE1、EIF2S1,RT-qPCR检测Il6和DDIT3 mRNA。
验证RIP2是否参与S. Infantis诱导的自噬和内质网应激
使用siRNA敲低Caco2细胞中RIP2,检测自噬和内质网应激蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 高糖DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 细菌培养 | 庆大霉素 | -- | -- |
| RNA干扰 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | ThermoFisher Scientific | 13778075 |
| RIP2 siRNA | Shanghai GenePharma Co., Ltd. | -- | |
| 蛋白质印迹 | RIPA裂解液 | Solarbio | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | ThermoFisher Scientific | 23227 | |
| PVDF膜 | Roche | -- | |
| ECL检测系统 | Tanon Science & Technology Co., Ltd. | -- | |
| NOD1单克隆抗体 | Santa Cruz | sc-398696 | |
| NOD2多克隆抗体 | Bioss | bs-7084R | |
| RIP2多克隆抗体 | Bioss | bs-3546R | |
| IRGM多克隆抗体 | Abcam | ab69494 | |
| IRE1多克隆抗体 | Abcam | ab37073 | |
| p62/SQSTM1多克隆抗体 | Proteintech | 18420-1-AP | |
| GAPDH单克隆抗体 | Proteintech | 60004-1-lg | |
| β-肌动蛋白单克隆抗体 | Proteintech | 60008-1-lg | |
| ATG16L1单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 8089 | |
| GRP78多克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 3177 | |
| EIF2S1单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 5324 | |
| LC3A/B多克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 4108 | |
| HRP标记亲和纯化山羊抗兔IgG (H+L) | Proteintech | SA00001-2 | |
| HRP标记亲和纯化山羊抗小鼠IgG (H+L) | Proteintech | HS201-01 | |
| RNA提取与RT-qPCR | EASYspin plus RNA提取试剂盒 | Aidlab Biotechnologies | -- |
| RT-qPCR | PrimeScript RT试剂盒 | TaKaRa | RR047A |
| SYBR Green PCR预混液 | Promega | LS2062 | |
| 引物 | Tsingke Biotechnology | -- | |
| 免疫荧光 | Triton-X 100 | Sigma-Aldrich | T8787 |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| Alexa Fluor 488山羊抗兔 | -- | -- | |
| Alexa Fluor 555驴抗兔 | -- | -- | |
| DAPI染色液 | -- | -- | |
| Hoechst 33342染料 | -- | -- | |
| 共聚焦显微镜 | Leica | -- | |
| 共聚焦激光扫描显微镜 | Nikon | -- | |
| 自噬抑制实验 | 氯喹 | -- | -- |
| ER应激诱导 | 毒胡萝卜素 | -- | -- |
| 衣霉素 | -- | -- | |
| 统计分析 | GraphPad Prism 8 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 仔猪分组与感染 | 仔猪分组、菌株和剂量、攻毒时间、死检时间 阅读提示:Materials and Methods Section 4.3 (Animals and Specimens) |
| 细菌准备 | 菌株来源和制备方法 阅读提示:Materials and Methods Section 4.2 (Bacterial Strains and Preparation) |
| Caco2细胞感染模型 | 细胞培养条件、MOI、预处理时间、感染时间、庆大霉素浓度和作用时间 阅读提示:Materials and Methods Section 4.5 (In Vitro Caco2 Cell Infection Model) |
| RNA干扰 | siRNA序列、转染试剂、细胞汇合度、转染时间、后续培养时间 阅读提示:Materials and Methods Section 4.6 (RNA Interference) |
| Western blot | 蛋白裂解液、抗体稀释比例、孵育时间和温度 阅读提示:Materials and Methods Section 4.7 (Western Blotting) |
| RT-qPCR | RNA提取试剂盒、反转录试剂盒、SYBR Green Master Mix、引物序列、内参基因 阅读提示:Materials and Methods Section 4.8 (Quantitative Real-Time PCR) 和 Table 1, Table 2 |
| 免疫荧光 | 固定液、通透液、封闭液、抗体稀释比例、孵育条件、核染色 阅读提示:Materials and Methods Section 4.10 (Immunofluorescence) |
| 自噬降解抑制实验 | CQ浓度、处理时间 阅读提示:Results Section 2.5 |