细胞模型建立与特征验证
验证TSC2缺陷细胞中EGFR/HER2及pS6高表达,作为疾病模型。
使用TSC2−/−和TSC2+/+ MEF细胞,LAM患者来源细胞和ELT3细胞,免疫印迹检测相关蛋白。
Pyrotinib Targeted EGFR-STAT3/CD24 Loop-Mediated Cell Viability in TSC.
体外细胞活力、凋亡、迁移实验,体内异种移植模型,免疫印迹、qPCR、ChIP、Co-IP、流式、免疫组化等多层级验证。
TSC2缺陷小鼠胚胎成纤维细胞(TSC2−/− MEF) LAM患者来源细胞(621-101和621-103) Eker大鼠子宫平滑肌瘤来源细胞(ELT3) Balb/c裸鼠异种移植瘤模型
TSC2−/− MEF细胞与TSC2+/+细胞对照 吡咯替尼处理浓度1 μM和5 μM,处理时间48小时 siCD24敲低序列CCACGCAGATTTACTGCAA 动物实验吡咯替尼灌胃剂量40 mg/kg,每周两次 体内实验每组5只小鼠,皮下注射细胞数2×10^6
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证TSC2缺陷细胞中EGFR/HER2及pS6高表达,作为疾病模型。
使用TSC2−/−和TSC2+/+ MEF细胞,LAM患者来源细胞和ELT3细胞,免疫印迹检测相关蛋白。
评估吡咯替尼对TSC2缺陷细胞活力、周期、迁移和凋亡的影响。
CCK-8法测细胞活力,流式检测细胞周期和凋亡,伤口愈合实验检测迁移,免疫印迹检测相关蛋白。
验证CD24高表达促进细胞活力,并介导巨噬细胞Siglec-10免疫逃逸。
RNA-seq筛选差异基因,IHC验证肿瘤组织中CD24表达,siRNA敲低CD24检测周期和凋亡蛋白,与RAW264.7共培养检测Siglec-10。
验证pSTAT3直接结合CD24启动子区域并促进其转录。
使用STAT1抑制剂氟达拉滨和STAT3抑制剂隐丹参酮处理细胞,qPCR检测CD24 mRNA,ChIP-PCR验证pSTAT3结合CD24启动子。
验证pEGFR与CD24直接结合,并影响pEGFR核转位及下游信号。
免疫荧光和核质分离观察pEGFR核转位,Co-IP验证pEGFR-CD24结合,siCD24敲低后检测pSTAT1/pSTAT3变化。
验证吡咯替尼在体内抑制TSC2缺陷肿瘤生长及机制。
皮下注射TSC2−/− MEF细胞构建异种移植瘤,给予吡咯替尼灌胃,BLI监测肿瘤,测量体积重量,TUNEL检测凋亡,IHC和免疫印迹检测标志物。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Solarbio | P7630 | |
| 1640培养基 | -- | -- | |
| 转染 | Lipo2000转染试剂 | Invitrogen | 11668027 |
| siCD24小干扰RNA | Guangzhou RiboBioCo., LTD | -- | |
| 药物处理 | 氟达拉滨 | MedChemExpress | HY-B0069 |
| 隐丹参酮 | MedChemExpress | HY-N0174 | |
| 吉非替尼 | MedChemExpress | HY-50895 | |
| 细胞活力检测 | CCK-8细胞活力检测试剂盒 | MeilunBio | MA0218 |
| 细胞死亡检测 | 碘化丙啶 | Solarbio | C0080 |
| 免疫印迹 | 硝酸纤维素膜 | Millipore | HATF00010 |
| 抗Tuberin/TSC2抗体 | CST | #4308 | |
| 抗EGFR抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-03 | |
| 抗pS6抗体 | CST | #4858 | |
| 抗α-tubulin抗体 | Neomarker | ms581-P0 | |
| 抗pEGFR抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-57545 | |
| 抗HER2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-33684 | |
| 抗CDK4抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-23896 | |
| 抗CDK2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-6248 | |
| 抗CD24抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-19585 | |
| 抗STAT1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-464 | |
| 抗STAT3抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-8019 | |
| 抗pSTAT1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-51700 | |
| 抗pSTAT3抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-8059 | |
| 抗β-actin抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-47778 | |
| 抗cl-PARP抗体 | CST | #9544S | |
| 抗bcl2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-7382 | |
| 抗Siglec-10抗体 | Bioss | bs-2706R | |
| 抗Lamin B1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-377000 | |
| 辣根过氧化物酶标记二抗 | Proteintech | B900620 & B900610 | |
| 增强化学发光试剂 | Millipore | WBKlS0100 | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | CWBIO | CW0580S |
| cDNA合成 | EasyScript第一链cDNA合成预混液 | TransGen | AE301-02 |
| qPCR | UltraSYBR混合液 | CWBIO | CW0957C |
| 免疫荧光 | DAPI | Solarbio | S2110 |
| 共聚焦荧光显微镜 | Leica | TCS SP8 | |
| TUNEL检测 | TUNEL检测试剂盒 | Yeasen | 40306ES20 |
| ChIP | 染色质免疫沉淀试剂盒 | absin | abs50034 |
| Co-IP | 蛋白A/G琼脂糖 | Santa Cruz Biotechnology | sc-2003 |
| 核质分离 | 核质分离试剂盒 | Solarbio | SN0020 |
| 免疫组织化学 | DAB工作液 | Solarbio | DA1010 |
| 抗ki67抗体 | CST | #9449 | |
| 流式细胞术 | BD FACS Aria II流式细胞仪 | BD Biosciences | LSR Fortessa |
| 凋亡检测 | 凋亡检测试剂盒 | MULTI SCIENCES | AP105 |
| 细胞周期检测 | 细胞周期检测试剂盒 | MULTI SCIENCES | CCS012 |
| 动物实验 | D-荧光素 | PerkinElmer | #122799 |
| 生物发光成像系统 | PerkinElmer | IVIS Spectrum |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基类型(DMEM或1640)、FBS浓度(10%)、抗生素浓度(1% pen-strep)、传代次数(前20代)、培养条件(37°C、5% CO2) 阅读提示:Methods 2.1 Cell Culture and Treatment |
| 药物处理 | 吡咯替尼浓度(1或5 μM)、处理时间(48小时)、溶剂(DMSO)、血清条件(1% FBS)、STAT抑制剂浓度(0.5或1 μM)、吉非替尼浓度(50 μM) 阅读提示:Methods 2.1 Cell Culture and Treatment |
| 细胞活力检测 | 细胞接种密度(4000细胞/孔)、检测时间点(处理后48小时)、CCK-8试剂盒及货号(MeilunBio, MA0218) 阅读提示:Methods 2.2 Cell Viability Assay |
| 细胞周期分析 | 细胞处理条件(1 μM吡咯替尼)、染色试剂盒(MULTI SCIENCES CCS012)、流式细胞仪型号 阅读提示:Methods 2.10 Flow Cytometry Analysis |
| 凋亡检测 | 细胞处理条件(1 μM吡咯替尼,48小时)、凋亡检测试剂盒(MULTI SCIENCES AP105)、流式细胞仪 阅读提示:Methods 2.10 Flow Cytometry Analysis |
| 体外迁移实验 | 细胞密度(1×10^5/孔)、划痕工具(200 μL移液枪头)、处理浓度(1 μM)、观察时间点(0、8、24小时) 阅读提示:Methods 2.3 Wound-Healing Assays |
| qPCR | RNA提取试剂、cDNA合成试剂、SYBR Green混合物、cDNA用量(50 ng)、内参基因(β-actin)、引物序列 阅读提示:Methods 2.5 Real-Time qPCR and Primers |
| 免疫印迹 | 蛋白上样量(15 μg)、凝胶浓度(12% SDS-PAGE)、一抗稀释比(1:1000)、二抗稀释比(1:5000)、内参蛋白(β-actin、α-tubulin、Lamin B1) 阅读提示:Methods 2.4 Immunoblotting Analysis |
| ChIP | ChIP试剂盒(absin, abs50034)、抗体(anti-pSTAT3)、引物序列(扩增CD24启动子区域-1944至-1553)、PCR预期产物大小(392 bp) 阅读提示:Methods 2.7 Chromatin Immunoprecipitation (ChIP) and Co-IP Assay |
| Co-IP | 抗体(抗EGFR和抗pEGFR,1 μg)、蛋白A/G琼脂糖(Santa Cruz sc-2003)、洗脱和煮沸条件 阅读提示:Methods 2.7 Chromatin Immunoprecipitation (ChIP) and Co-IP Assay |
| 核质分离 | 核质分离试剂盒(Solarbio, SN0020)及操作步骤 阅读提示:Methods 2.8 Cytosolic and Nuclear Extractions |
| 免疫荧光 | 细胞接种密度(5000细胞/玻片)、固定(75%乙醇30分钟)、一抗稀释比(1:100)、二抗(FITC标记)、DAPI浓度(10 μg/mL)、显微镜(Leica TCS SP8) 阅读提示:Methods 2.6 Confocal Microscopy |
| 体内实验 | 动物品系(Balb/c裸鼠)、细胞接种量(2×10^6)、给药方式(灌胃)、剂量(40 mg/kg)、频率(每周两次)、治疗时间(4周)、肿瘤测量(卡尺)、成像(D-荧光素150 mg/kg i.p.) 阅读提示:Methods 2.11 Animal Experiments |
| 免疫组化 | 固定(4%甲醛)、脱水梯度(70%-100%酒精和二甲苯)、石蜡包埋、DAB工作液、苏木素、一抗稀释比(1:100) 阅读提示:Methods 2.9 Immunohistochemistry Staining |