临床样本回顾性分析
评估MM患者红细胞数量与血清钙水平的关系,并检测红细胞内钙含量和氧化应激状态。
回顾性分析113例MM伴溶骨性病变患者临床数据,按肾功能分组,比较血清钙、红细胞计数;用流式细胞术检测游离钙,F-AAS检测总钙,试剂盒检测ROS和H2O2。
Exosomal MiR-4261 mediates calcium overload in RBCs by downregulating the expression of ATP2B4 in multiple myeloma.
包含临床样本回顾性分析、细胞共培养体外模型、双荧光素酶报告基因验证、氧化应激模型及药物抑制实验,涉及多层次功能性验证和机制验证。
HEK293T细胞 人骨髓瘤细胞系RPMI8226和NCI-H929 正常红细胞 多发性骨髓瘤患者外周血样本
113例新诊断MM伴溶骨性病变患者外周血样本,正常肾功能组71例,肾损伤组42例 RBC与RPMI8226或H929细胞在24mm Transwell小室(0.4μm孔径)共培养72小时 双荧光素酶报告基因验证miR-4261与ATP2B4 3'-UTR结合,使用psiCHECK-2载体和miR-4261 mimics RBC氧化应激模型使用t-BHP浓度0.10 mM和0.25 mM,处理0、1、2、4、8、10分钟 Omega-Agatoxin IVA浓度0.5、1.0、2.0、4.0、8.0 nM预处理RBC 10分钟
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估MM患者红细胞数量与血清钙水平的关系,并检测红细胞内钙含量和氧化应激状态。
回顾性分析113例MM伴溶骨性病变患者临床数据,按肾功能分组,比较血清钙、红细胞计数;用流式细胞术检测游离钙,F-AAS检测总钙,试剂盒检测ROS和H2O2。
比较MM患者与正常对照红细胞中PMCA4蛋白及ATP2B4 mRNA表达水平。
采用免疫荧光染色、Western blot、免疫细胞化学和qRT-PCR检测临床样本中PMCA4表达。
筛选在骨髓瘤细胞中表达、在正常红细胞中不表达且靶向ATP2B4的miRNA,并验证miR-4261在MM红细胞中的高表达。
结合GEO芯片数据和miRDB、TargetScan数据库,通过Venn图筛选候选miRNA,再用qRT-PCR检测临床样本中miR-4261水平。
验证MM细胞分泌的外泌体携带miR-4261并能将其转移至红细胞。
超速离心法提取血清外泌体,TEM和Western blot鉴定;将MM细胞系(RPMI8226、H929)与正常RBC共培养或使用条件培养基,检测RBC中miR-4261水平及外泌体标记物。
验证miR-4261是否直接靶向ATP2B4 mRNA的3'-UTR。
构建ATP2B4 3'-UTR野生型和突变型荧光素酶报告质粒,与miR-4261 mimics或阴性对照共转染HEK293T细胞,48小时后检测荧光素酶活性。
研究PMCA4在红细胞钙稳态和ROS调节中的作用,并模拟氧化应激条件。
使用t-BHP构建RBC氧化应激模型,评估剂量效应;使用Omega-Agatoxin IVA抑制PMCA4,在钙离子存在下检测细胞内游离钙和ROS水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco BRL | -- |
| 高糖DMEM培养基 | Gibco BRL | -- | |
| 胎牛血清 | BI | 04-001-1 | |
| 细胞共培养 | Transwell小室 | Corning | 3412 |
| 细胞培养 | AIM-V无血清培养基 | Gibco | -- |
| RNA提取 | RNAiso Plus总RNA提取试剂 | TaKaRa | -- |
| miRNeasy血清/血浆试剂盒 | Qiagen | 217184 | |
| RNA-EZ试剂K RNA-Be-Down | Sangon | -- | |
| 反转录 | Primer-Script RT Master Mix | TaKaRa | RR036A |
| Mir-X™ miRNA第一链合成试剂盒 | TaKaRa | 638315 | |
| qPCR | FastStart Universal SYBR Green Master Mix (ROX) | Roche | -- |
| 流式细胞术 | CD45-PE/Cy7抗体 | Beckman Coulter | IM3548 |
| CD36-PE/Cy5抗体 | BD Biosciences | -- | |
| CD138-PE抗体 | Beckman Coulter | A40316 | |
| Fluo-4 AM钙离子荧光探针 | Beyotime | S1060 | |
| CD15-PE/Cy5抗体 | Beckman Coulter | B49217 | |
| CD11b-PE抗体 | Beckman Coulter | IM2581U | |
| FC500流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- | |
| 细胞分选 | CD71-FITC抗体 | Beckman Coulter | -- |
| 原子吸收光谱 | 火焰原子吸收光谱仪Z-2000 | Hitachi | -- |
| Western blot | PVDF膜 | Roche | -- |
| Difco™脱脂奶粉 | BD | 232100 | |
| PMCA4抗体 | NOVUS | NB300-569 | |
| 小鼠抗β-微管蛋白单克隆抗体 | Abbkine | A01030 | |
| 抗CD138抗体 | Wanleibio | WL04081 | |
| 抗CD36抗体 | Wanleibio | WL02390 | |
| GAPDH兔多克隆抗体 | ABclonal | AC027 | |
| CD9抗体 | Santa Cruz | sc-13118 | |
| CD63抗体 | Santa Cruz | sc-5275 | |
| CD81抗体 | Santa Cruz | sc-166028 | |
| 小鼠抗兔IgG-HRP | Santa Cruz | sc-2357 | |
| m-IgG κ BP-HRP | Santa Cruz | sc-516102 | |
| 免疫荧光 | 皂素 | Beyotime | P0095 |
| QuickBlock™封闭液 | Beyotime | P0260 | |
| DiD膜荧光探针 | US Everbright | D4019 | |
| TCS SP8 X共聚焦显微镜 | Leica | -- | |
| 山羊抗小鼠IgG (H+L) CF 405S抗体 | Sigma-Aldrich | SAB4600023 | |
| 免疫细胞化学 | 山羊抗小鼠IgG H&L/AP抗体 | Bioss | bs-0296G-AP |
| BCIP/NBT底物 | Beyotime | C3206 | |
| 外泌体分离 | 0.22 μm针头式过滤器 | -- | -- |
| 超速离心机CP70NE | Himac | -- | |
| 外泌体电镜 | 透射电子显微镜HT7800 | Hitachi | -- |
| 双荧光素酶实验 | psiCHECK-2载体 | Promega | -- |
| LipoD293™ DNA转染试剂 | SignaGen | SL100668 | |
| 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | E1910 | |
| 氧化应激检测 | 活性氧检测试剂盒 | Beyotime | S0033S |
| 过氧化氢含量检测试剂盒 | Solarbio | BC3595 | |
| 葡萄糖-6-磷酸脱氢酶活性检测试剂盒 | Sinobestbio | YX-W-A102 | |
| 乳酸脱氢酶活性检测试剂盒 | Wanleibio | WLA072 | |
| 人2,3-二磷酸甘油酸含量检测试剂盒 | Sinobestbio | YX-041607H | |
| 乳酸含量检测试剂盒 | Jiancheng Bioeng | A019-2-1 | |
| 丙二醛含量检测试剂盒 | Wanleibio | WLA048 | |
| 药物抑制实验 | D-葡萄糖酸钙 | Sigma-Aldrich | C8231 |
| ω-芋螺毒素IVA | Abcam | ab120210 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本收集 | 患者纳入标准:新诊断MM伴溶骨性病变;肾功能分组:正常肾功能(CCr ≥ 40 mL/min)和肾损伤(CCr < 40 mL/min);样本类型:废弃外周血;排除原发性肾病。 阅读提示:Materials and methods: Patient samples; Table 1 |
| 细胞培养和共培养 | 细胞系来源:HEK293T、RPMI8226、NCI-H929;培养基:RPMI-1640或高糖DMEM+10% FBS;共培养:24 mm Transwell(0.4 μm孔径),血清-free AIM-V培养基,共培养72小时;对照组:正常RBC单独培养。 阅读提示:Materials and methods: Cell culture |
| miR-4261检测 | RNA提取方法:RNAiso Plus用于总RNA,miRNeasy试剂盒用于血浆游离miRNA,外泌体RNA提取加入RNA-EZ试剂;内参:U6;RT-qPCR条件:使用FastStart Universal SYBR Green Master Mix。 阅读提示:Materials and methods: RNA isolation, RT-qPCR; Figure 3 legend |
| 双荧光素酶实验 | 载体:psiCHECK-2;转染:LipoD293;分组:psiCHECK-2WT+mimics、psiCHECK-2WT+NC、psiCHECK-2MUT+mimics、psiCHECK-2MUT+NC;每组3个复孔;检测时间:转染后48小时。 阅读提示:Materials and methods: Plasmid construction and dual-luciferase reporter assays |
| 红细胞功能实验 | 氧化应激模型:t-BHP浓度(0.10 mM和0.25 mM)处理0-10分钟;药物抑制:Omega-Agatoxin IVA浓度(0.5、1.0、2.0、4.0、8.0 nM)预处理10分钟;反应体系含1.25 mM D-葡萄糖酸钙;检测指标:Fluo-4 AM荧光(游离钙)、ROS水平。 阅读提示:Materials and methods: Cellular oxidative stress detection, Drug suppression experiment; Figure 7 legend |
| 统计方法 | 数据表示:mean ± SEM;两组比较:非参数检验;三组以上:one-way ANOVA;显著性标准:P < 0.05。 阅读提示:Materials and methods: Statistical analysis |