临床样本检测与相关分析
评估AIS患者循环中性粒细胞中miR-193a-5p的表达变化及其与临床结局的关系
收集AIS患者和健康对照的外周血中性粒细胞,通过miRNA测序和RT-qPCR检测miR-193a-5p水平,并分析与3个月mRS评分和sICH的相关性。
MicroRNA-193a-5p Rescues Ischemic Cerebral Injury by Restoring N2-Like Neutrophil Subsets.
包含临床患者样本、实验性卒中动物模型、人中性粒细胞样细胞系体外实验,并通过功能获得/缺失、靶点验证(FISH、RIP)及机制回复实验进行验证。
C57BL/6J小鼠MCAO模型 人中性粒细胞样HL-60细胞 急性缺血性卒中患者外周血中性粒细胞
小鼠品系(C57BL/6J)及体重(20±2g) MCAO手术:线栓插入右侧大脑中动脉45分钟 miR-193a-5p agomir/antagomir及UBE2V2 siRNA通过尾静脉注射 HL-60细胞分组处理:LPS(1 ng/ml)刺激,agomir/antagomir浓度20μM 样本量:体内外每组至少5只/个 统计方法:Shapiro-Wilk检验、ANOVA及Spearman相关分析
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估AIS患者循环中性粒细胞中miR-193a-5p的表达变化及其与临床结局的关系
收集AIS患者和健康对照的外周血中性粒细胞,通过miRNA测序和RT-qPCR检测miR-193a-5p水平,并分析与3个月mRS评分和sICH的相关性。
在实验性卒中模型中观察miR-193a-5p的作用
对C57BL/6J小鼠进行MCAO手术,术前经尾静脉注射agomiR-193a-5p、antagomiR-193a-5p及UBE2V2-siRNA,评估脑梗死体积和神经功能。
验证miR-193a-5p对中性粒细胞表型转化的直接影响
HL-60细胞转染agomiR-193a-5p/antagomiR-193a-5p/UBE2V2-siRNA,然后LPS刺激模拟炎症,检测表型标志物和细胞因子水平。
验证UBE2V2是miR-193a-5p的靶基因
通过生物信息学预测、FISH共定位和RIP实验验证miR-193a-5p与UBE2V2的相互作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 细胞处理 | 脂多糖 | -- | -- |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596026 |
| HiScript III第一链cDNA合成试剂盒 | Vazyme | -- | |
| miRNA第一链cDNA合成试剂盒 | Sangon Biotech | B532451 | |
| Taq Pro通用SYBR qPCR预混液 | Vazyme | -- | |
| StepOne Plus实时荧光定量PCR系统 | Roche | LightCycler | |
| 流式细胞术 | 红细胞裂解液 | eBioscience | -- |
| Ly6G-PE抗体 | BD Bioscience | -- | |
| CD11b-FITC抗体 | BD Bioscience | -- | |
| CD206-APC抗体 | BD Bioscience | -- | |
| LSRFortessa SORP流式细胞仪 | BD | -- | |
| ELISA | TGF-β ELISA试剂盒 | Neobioscience | -- |
| TNF-α ELISA试剂盒 | Neobioscience | -- | |
| IL-10 ELISA试剂盒 | Neobioscience | -- | |
| IL-1β ELISA试剂盒 | Neobioscience | -- | |
| 免疫荧光 | 抗PPARγ抗体 | Bioss | bsm-33436M |
| 抗UBE2V2抗体 | Proteintech | 10689-1-AP | |
| DAPI | SouthernBiotech | 0100-20 | |
| FISH | Cy3标记的miR-193a-5p探针 | Servicebio | -- |
| RIP | Magna RIP试剂盒 | Millipore | -- |
| 蛋白质印迹 | IP裂解液 | Beyotime | P0013 |
| Protein G-琼脂糖 | Sigma | P3296 | |
| 抗PPARγ抗体 | Proteintech | 16643-1-AP | |
| 抗IgG | Cell Signaling Technology | 2729S | |
| 增强化学发光试剂盒 | Millipore | -- | |
| MCAO手术 | 硅胶尼龙线栓 | Doccol Corporation | 701934PK5Re |
| PeriFlux System 5000激光多普勒 | Perimed | -- | |
| 脑梗死体积测量 | 2,3,5-三苯基氯化四氮唑 | Sigma-Aldrich | T8877 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本收集 | AIS患者纳入标准(发病6小时内、MRI/CT确诊)、排除标准、健康对照匹配、样本量 阅读提示:Methods: Human Samples |
| 动物模型建立 | 小鼠品系、体重、MCAO手术细节(线栓型号、阻塞时间45分钟)、缺血再灌注确认 阅读提示:Methods: Animals, Transient Middle Cerebral Artery Occlusion Surgery |
| 体内药物干预 | agomiR-193a-5p、antagomiR-193a-5p、UBE2V2-siRNA的剂量、给药途径(尾静脉注射)、给药时间(术前) 阅读提示:Methods: Transient Middle Cerebral Artery Occlusion Surgery and Groups |
| 细胞实验 | HL-60细胞培养条件、传代数、转染浓度(20μM)、LPS刺激条件(1ng/ml, 6h) 阅读提示:Methods: Human HL-60 Cells and Transfection |
| 靶点验证 | FISH和RIP实验的抗体、探针、试剂盒、样本处理步骤 阅读提示:Methods: Immunofluorescence and Fluorescence in Situ Hybridization, RNA Binding Protein Immunoprecipitation |