建立寒冷暴露模型并评估AF易感性
验证寒冷暴露是否增加大鼠AF易感性并导致肠道菌群失调
将大鼠分为RT和Cold两组,Cold组在4±1°C暴露2周,通过burst pacing电生理刺激评估AF诱发率和持续时间,收集粪便进行16S rRNA测序。
Akkermansia muciniphila prevents cold-related atrial fibrillation in rats by modulation of TMAO induced cardiac pyroptosis.
包含动物模型(大鼠、条件性基因敲除小鼠)、细胞共培养、临床样本分析,并进行了功能验证和机制验证。
SD大鼠寒冷暴露模型 Mef2c-Cre驱动的条件性caspase1敲除小鼠 原代大鼠心房肌细胞和成纤维细胞 大鼠骨髓来源巨噬细胞
模型:雄性SD大鼠(200-250g)随机分为RT(25±1°C)和Cold(4±1°C)处理2周 菌株:A. muciniphila(ATCC BAA-835)每天口服1×10^9 CFU/200 µL,持续2周 抑制剂:NSA(cat#480073)通过腹腔注射(2g/kg/day)持续2周 TMAO浓度:10 μmol/L处理48小时 FMT:每周一次灌胃2mL,持续4周
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证寒冷暴露是否增加大鼠AF易感性并导致肠道菌群失调
将大鼠分为RT和Cold两组,Cold组在4±1°C暴露2周,通过burst pacing电生理刺激评估AF诱发率和持续时间,收集粪便进行16S rRNA测序。
确认冷暴露后失调的肠道菌群是否足以促进AF
将Cold或RT大鼠的粪便移植给正常大鼠,每周一次灌胃,持续4周,然后进行电生理检查。
验证口服补充A. muciniphila是否能逆转冷诱导的AF
给Cold大鼠口服活菌或巴氏灭活的A. muciniphila,持续2周,然后评估AF易感性和纤维化。
检测寒冷暴露和A. muciniphila补充对TMA/TMAO水平及TMA合成酶的影响
使用靶向和非靶向代谢组学分析血浆TMAO、TMA及前体,并检测粪便中TMA合成相关酶的表达。
探究TMAO是否直接损伤心肌细胞和成纤维细胞,以及通过巨噬细胞间接作用
用TMAO(10 μM)处理心肌细胞和成纤维细胞,或用TFMAO处理与巨噬细胞共培养,检测细胞活力、焦亡和纤维化相关蛋白表达。
验证抑制焦亡是否能减轻冷诱导的AF
给Cold大鼠腹腔注射NSA,或使用条件性敲除caspase1的小鼠进行冷暴露,评估AF易感性和焦亡标志物。
验证A. muciniphila丰度与人类寒冷相关性AF的关联
收集冬夏两季AF和SR患者粪便和血浆样本,进行16S rRNA测序、qRT-PCR和TMAO测量。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | SD大鼠 | 北京维通利华实验动物技术有限公司 | -- |
| 药物处理 | 3,3-二甲基-1-丁醇 | Sigma-Aldrich | 183105 |
| 坏死磺酰胺 | Sigma-Aldrich | 480073 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Sigma-Aldrich | D6429 |
| 胎牛血清 | Hyclone | sv30087.02 | |
| 粪便DNA提取 | TIANamp粪便DNA提取试剂盒 | TIANGEN | DP328-02 |
| 细胞活力检测 | MTT细胞增殖检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| 免疫荧光染色 | 山羊血清 | Bioss | -- |
| 兔抗CD163抗体 | Bioss | bs-2527R | |
| 小鼠抗CD86抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-28347 | |
| FITC标记山羊抗兔IgG(H+L)抗体 | ABclonal | AS011 | |
| TRITC标记山羊抗小鼠IgG(H+L)抗体 | ABclonal | AS026 | |
| 4',6-二脒基-2-苯基吲哚 | Beyotime | -- | |
| 微生物培养 | 嗜黏蛋白阿克曼菌 | ATCC | BAA-835 |
| 定量PCR | SYBR Green试剂盒 | Roche | -- |
| 流式细胞术 | 抗CD11b/c-APC抗体 | Thermo Fisher Scientific | MA5-17507 |
| 抗CD86-PE抗体 | BD Biosciences | 551396 | |
| 抗CD163-Percp抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-78961 | |
| 抗caspase1 p20抗体 | Bioss | bs-10743R | |
| 山羊抗兔IgG(H+L)二抗,PE-Cyanine5.5 | Thermo Fisher Scientific | L42018 | |
| 组织病理学 | Masson三色染色 | Solarbio | G1340 |
| 蛋白质印迹 | 抗TGF-β1抗体 | Bioss | bs-0103R |
| 抗α-SMA抗体 | Bioss | bsm-52396R | |
| 抗BAX抗体 | Proteintech | 60267-1-Ig | |
| 抗Bcl2抗体 | Abcam | ab196495 | |
| 抗GAPDH抗体 | ZSGB-Bio | TA-08 | |
| 抗β-actin抗体 | ZSGB-Bio | TA-09 | |
| 抗ZO-1抗体 | Proteintech | 21773-1-AP | |
| 抗Occludin抗体 | Abcam | ab167161 | |
| 抗Claudin-4抗体 | Proteintech | 16195-1-AP | |
| 抗FMO3抗体 | Proteintech | 17469-1-AP | |
| 抗Caspase1-p20抗体 | Proteintech | 22915-1-AP | |
| 抗N-GSDMD抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-393581 | |
| HRP标记山羊抗小鼠IgG(H+L) | ZSGB-Bio | ZB-2305 | |
| HRP标记山羊抗兔IgG(H+L) | ZSGB-Bio | ZB-2301 | |
| 电生理仪器 | 八极导管 | Transonic Systems Inc | -- |
| 细胞共培养 | Trans-well小室 | Corning | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 大鼠品系、体重、性别、环境温度、冷暴露持续时间 阅读提示:Methods: Animals |
| A. muciniphila补充 | 菌株来源、培养条件、剂量、给药方式、持续时间、对照组处理 阅读提示:Methods: Culture and pasteurisation of A. muciniphila, Results: Oral administration of A. muciniphila |
| 电生理检查 | 麻醉方式、导管型号、起搏参数、AF定义及持续时间计算 阅读提示:Methods: Electrophysiology |
| 粪菌移植 | 供体粪便来源、制备方法、移植频率和剂量、受体预处理 阅读提示:Methods: Fecal microbiota transplantation |
| 体外细胞处理 | 细胞类型、TMAO浓度、处理时间、共培养条件 阅读提示:Methods: Culture of primary rat cardiomyocytes and fibroblasts, Preparation of rat bone marrow-derived macrophages, Cell co-culture model |
| 体内干预 | DMB浓度、NSA剂量和给药途径、Caspase1敲除小鼠模型 阅读提示:Methods: Animals, Results: NSA treatment, Caspase1 knockout |
| 临床样本收集 | 纳入排除标准、样本量、季节定义、A. muciniphila丰度测定、TMAO测量 阅读提示:Methods: Human studies |