建立PA诱导心肌细胞损伤模型
确定棕榈酸(PA)诱导心肌细胞损伤的浓度和时间,并验证内质网应激的发生。
使用AC16人心肌细胞系,以不同浓度PA处理,检测细胞活力(CCK-8)、LDH释放及内质网应激标志物(Bip、ATF4、ATF6)的蛋白表达。
GSK-J4, a Specific Histone Lysine Demethylase 6A Inhibitor, Ameliorates Lipotoxicity to Cardiomyocytes via Preserving H3K27 Methylation and Reducing Ferroptosis.
包含细胞实验(AC16、NRCM)、动物模型(DB/DB小鼠)、分子机制验证(ChIP、siRNA、过表达)等多个独立证据层级,并明确功能与机制验证。
AC16人心肌细胞系 新生大鼠原代心肌细胞(NRCM) DB/DB小鼠2型糖尿病模型
AC16细胞和NRCM进行PA刺激,浓度400 μM,时间24小时 GSK-J4预处理浓度为2.5 μM和10 μM,预处理时间2小时 动物模型中GSK-J4给药剂量10 mg/kg,腹腔注射,每2天一次,持续16周 铁死亡诱导剂erastin处理以评估细胞对铁死亡的敏感性
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定棕榈酸(PA)诱导心肌细胞损伤的浓度和时间,并验证内质网应激的发生。
使用AC16人心肌细胞系,以不同浓度PA处理,检测细胞活力(CCK-8)、LDH释放及内质网应激标志物(Bip、ATF4、ATF6)的蛋白表达。
筛选能减轻PA诱导心肌细胞损伤的化合物,并验证GSK-J4的效果。
使用内质网应激相关小分子药物库(ERS Library)处理细胞,通过CCK-8筛选出候选药物GSK-J4,进一步在AC16细胞和原代心肌细胞中验证其对细胞活力、LDH释放及内质网应激的影响。
明确GSK-J4的分子靶点及其对H3K27me3水平的作用。
通过实时PCR和Western blot检测KDM6A、KDM6B及H3K27me3的表达,利用免疫荧光观察H3K27me3的细胞定位和水平变化。
验证GSK-J4是否能减少脂质积累。
在体内(DB/DB小鼠)和体外(AC16细胞、NRCM)检测甘油三酯和胆固醇水平,并用BODIPY染色观察脂滴数量。
探究GSK-J4是否通过抑制铁死亡保护心肌细胞。
检测ROS水平(DHE、DCFH探针)、脂质过氧化(C11-BODIPY、MDA)、线粒体形态(透射电镜)以及铁死亡相关指标。
证明GSK-J4通过抑制KDM6A、上调H3K27me3并下调ACSL4来发挥保护作用。
通过过表达KDM6A或ACSL4、siRNA敲低KDM6A、ChIP-PCR检测ACSL4转录起始位点的H3K27me3水平,以及检测ACSL4的mRNA和蛋白水平变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Servicebio | G4610 |
| 胎牛血清 | CellMax | SA311.02 | |
| 青霉素/链霉素溶液 | Gibco | 151540-122 | |
| 胶原酶 | Worthington | LS004176 | |
| 胰蛋白酶 | BioFroxx | 1004GR025 | |
| 苯甲酸酶 | Yeasan | 20125ES25 | |
| 细胞过滤器 | BIOFIL | CSS013070 | |
| 红细胞裂解液 | Servicebio | G2015 | |
| 明胶 | Sigma | G9382 | |
| 药物处理 | GSK-J4 | MCE | HY-15648B |
| 棕榈酸 | -- | -- | |
| 艾拉斯汀 | -- | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Meilunbio | MA0218 |
| LDH检测 | LDH检测试剂盒 | Beyotime | C0016 |
| 凋亡分析 | Annexin V/PI凋亡检测试剂盒 | Vazyme | A211-01 |
| Western blot | RIPA裂解液 | Servicebio | G2002 |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | APEXBio | K1007 | |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | APEXBio | K1015 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0009 | |
| 5X蛋白上样缓冲液 | Beyotime | P0015L | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| ECL化学发光试剂盒 | Abclonal | RM00021 | |
| H3K27me3抗体 | Abclonal | A2363 | |
| KDM6A抗体 | CST | 33510S | |
| KDM6B抗体 | Abclonal | A17382 | |
| Flag抗体 | Abclonal | AE005 | |
| GAPDH抗体 | Abclonal | AC033 | |
| BIP抗体 | Abclonal | A0241 | |
| ATF4抗体 | Abclonal | A0201 | |
| ATF6抗体 | Abcam | Ab203119 | |
| Caspase-3抗体 | CST | 9662S | |
| Caspase-9抗体 | CST | 9508S | |
| Caspase-12抗体 | CST | 2202S | |
| ACSL4抗体 | Abclonal | A6826 | |
| β-actin抗体 | Abclonal | AC026 | |
| 免疫荧光 | cTnI抗体 | ProteinTech | 66376-1-Ig |
| 免疫组化 | 4-HNE抗体 | Bioss | bs-6313R |
| 免疫荧光 | Cy3标记山羊抗兔二抗 | ServiceBio | GB21303 |
| Alexa Fluor 488标记山羊抗小鼠二抗 | ServiceBio | GB25301 | |
| RNA提取与PCR | Trizol试剂 | Vazyme | R401-01 |
| 逆转录试剂盒 | Yeasan | 11141ES60 | |
| RT-qPCR | SYBR green PCR预混液 | Yeasan | 11201ES03 |
| CFX96实时荧光定量PCR仪 | Bio-Rad | -- | |
| 生化检测 | 甘油三酯检测试剂盒 | 南京建成生物工程研究所 | A110 |
| 胆固醇检测试剂盒 | 南京建成生物工程研究所 | A111 | |
| 血糖检测试剂盒 | 南京建成生物工程研究所 | F006 | |
| MDA检测试剂盒 | 南京建成生物工程研究所 | A003 | |
| ROS检测 | DHE探针 | Beyotime | S0063 |
| DCFH探针 | Beyotime | S0033S | |
| 脂质过氧化检测 | C11-BODIPY探针 | Abclonal | RM02821 |
| 透射电镜 | HT7700透射电子显微镜 | HITACHI | -- |
| 质粒构建 | Oligo-dT逆转录试剂盒 | Vazyme | R211-01 |
| DNA凝胶回收试剂盒 | Yeasan | 19101ES50 | |
| 同源重组试剂盒 | Vazyme | C112-01 | |
| 质粒提取试剂盒 | Vazyme | DC201-01 | |
| 转染 | HighGene转染试剂 | Abclonal | RM09014 |
| siRNA转染试剂 | Yeasan | 40806ES01 | |
| ChIP | ChIP检测试剂盒 | Beyotime | P2078 |
| 微球菌核酸酶 | Thermo | EN0181 | |
| H3K27me3抗体 | Abclonal | A2363 | |
| IgG同型对照 | Abclonal | AC005 | |
| DNA回收试剂盒 | Beyotime | D0033 | |
| 动物实验 | 二甲基亚砜 | MCE | HY-Y0320 |
| 聚乙二醇300 | MCE | HY-Y0873 | |
| 吐温80 | MCE | HY-Y1891 | |
| 磷酸盐缓冲液 | Servicebio | G4200 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | AC16细胞和NRCM的培养基成分,PA浓度(400 μM)及处理时间(24小时),GSK-J4预处理浓度(2.5 μM、10 μM)及时间(2小时) 阅读提示:Materials and Methods 中的 Cell Culture and Treatment |
| 动物模型 | DB/DB小鼠周龄(8周),GSK-J4给药剂量(10 mg/kg)、方式(腹腔注射)、频率(每2天一次)及持续时间(16周) 阅读提示:Materials and Methods 中的 Animal Model and GSK-J4 Administration |
| 细胞活力与损伤检测 | CCK-8实验细胞密度(1×10^4细胞/孔)、处理时间、检测波长(450 nm);LDH释放检测方法 阅读提示:Materials and Methods 中的 Cell Viability Assay and Drug Screen 和 Lactate Dehydratase Assay |
| 铁死亡检测 | C11-BODIPY工作浓度(10 μM)及孵育时间(30分钟);MDA检测样本处理;透射电镜样本固定(2.5%戊二醛,4°C 30分钟) 阅读提示:Materials and Methods 中的 C11-BODIPY Staining and Fluorescence Microscopy、Malondialdehyde Measurement、Transmission Electrical Microscopy |
| 机制验证 | ChIP实验细胞数量(5×10^6)、甲醛固定浓度(3%)、H3K27me3抗体用量(2.5 μg)、PCR引物及产物位置;siRNA序列靶向KDM6A 阅读提示:Materials and Methods 中的 ChIP 和 Plasmid Construction and Transfection of Plasmid or siRNA |