BOECs的生成与表征
建立患者来源的内皮细胞模型,验证其内皮表型和功能。
从NAFLD患者和健康对照的PBMCs中分离培养BOECs,通过流式细胞术、免疫染色、增殖和血管生成实验进行表征。
Endothelial-immune crosstalk contributes to vasculopathy in nonalcoholic fatty liver disease.
包含患者来源BOECs转录组与功能实验、小鼠模型体内验证、单细胞免疫分型及临床样本CEC检测,多层级证据交叉验证。
人血液外出内皮细胞(BOECs) PBMC来源免疫细胞 饮食诱导NAFLD小鼠模型(LIDPAD和HFHC)
CXCL12中和抗体(25 μg/ml,MAB310) AMD3100(CXCR4拮抗剂,10 μM) LPS(100 ng/ml)和游离脂肪酸(100 μM棕榈酸和油酸)处理 CD8+ T细胞和CD8−细胞分选 BOECs与免疫细胞共培养条件
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立患者来源的内皮细胞模型,验证其内皮表型和功能。
从NAFLD患者和健康对照的PBMCs中分离培养BOECs,通过流式细胞术、免疫染色、增殖和血管生成实验进行表征。
识别NAFLD内皮细胞中差异表达基因和富集通路。
对NAFLD和健康BOECs进行RNA测序,分析差异表达基因、GO富集和蛋白互作网络。
在更大样本量和体内模型中验证候选趋化因子的表达变化。
通过qPCR和ELISA验证NAFLD BOECs中趋化因子表达,并在饮食诱导NAFLD小鼠模型中检测主动脉和肝脏血管内皮CXCL12表达。
分析NAFLD患者免疫细胞亚群及趋化因子受体表达,预测内皮-免疫互作。
使用单细胞RNA测序对PBMCs进行免疫分型,分析趋化因子受体表达,并通过流式细胞术验证关键受体。
验证CXCL12-CXCR4轴在内皮细胞招募免疫细胞和破坏屏障中的作用。
进行内皮-免疫细胞粘附、趋化和跨内皮迁移实验,并使用AMD3100和CXCL12中和抗体进行干预。
评估NAFLD患者循环内皮细胞水平,反映血管损伤程度。
通过流式细胞术检测NAFLD患者和健康对照PBMCs中CECs数量。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| BOECs培养 | 内皮生长培养基-2 | Lonza | -- |
| 胎牛血清 | Hyclone | -- | |
| Ficoll-Paque | GE Healthcare | -- | |
| 血管生成实验 | Cytodex 3微载体珠 | Sigma-Aldrich | -- |
| 纤维蛋白原 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 凝血酶 | Sigma-Aldrich | -- | |
| RNA提取 | RNeasy Micro试剂盒 | Qiagen | -- |
| RNA测序 | Illumina HiSeq测序仪 | Illumina | -- |
| 定量PCR | LunaScript RT SuperMix试剂盒 | New England Biolabs | -- |
| SYBR绿色基因表达检测 | New England Biolabs | -- | |
| QuantStudio 6实时荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems | -- | |
| 流式细胞术 | BD LSRFortessa X-20流式细胞仪 | Becton Dickinson | -- |
| FlowJo v10.7.1软件 | Becton Dickinson | -- | |
| 免疫细胞分选 | CD8微珠 | Miltenyi Biotec | 130-045-201 |
| 趋化实验 | 深红色细胞示踪染料 | Invitrogen | -- |
| Transwell板 | Cell BioLabs | CBA-105 | |
| AMD3100(普乐沙福) | MedChemExpress | HY-10046 | |
| CXCL12中和抗体 | R&D Systems | MAB310 | |
| 跨内皮迁移实验 | Transwell膜 | Corning | -- |
| 免疫组织化学 | R-Universal抗原修复缓冲液 | Aptum Biologics | AP0530-500 |
| 抗CDH5抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-6458 | |
| 抗SDF-1抗体 | Bioss | bs-4938R | |
| 抗CD45抗体 | Tonbo | 70-0452 | |
| 抗CD3抗体 | Invitrogen | PA5-102404 | |
| Fluoromount水溶性封片剂 | Sigma-Aldrich | F-4680 | |
| 单细胞测序 | 10x Genomics Chromium控制器 | 10x Genomics | -- |
| Chromium单细胞3' v3试剂盒 | 10x Genomics | -- | |
| Agilent 2100生物分析仪 | Agilent Genomics | -- | |
| 细胞处理 | 脂多糖 | -- | -- |
| 棕榈酸 | -- | -- | |
| 油酸 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| BOECs生成 | PBMC分离方法、培养条件(EGM-2含16% FBS)、种植密度(2×10^6 cells/cm^2)、克隆出现时间(7-14天) 阅读提示:Materials and Methods: Derivation and maintenance of blood outgrowth endothelial cells |
| RNA-seq分析 | 样本量(每组3个供体)、测序深度、差异表达阈值、分析软件版本 阅读提示:Materials and Methods: BOEC RNA-sequencing and analysis |
| 趋化因子表达验证 | qPCR引物、归一化基因、ELISA试剂盒、样本量 阅读提示:Materials and Methods: Quantitative PCR, ELISA of chemokines in BOEC-conditioned media |
| 动物模型 | 小鼠品系、年龄、饮食类型和持续时间、组内样本量 阅读提示:Materials and Methods: Diet-induced NAFLD murine models, Humanized NAFLD murine models |
| 单细胞测序 | PBMC池构成、细胞数量、文库制备试剂盒、测序平台、分析参数 阅读提示:Materials and Methods: Immunoprofiling by single-cell RNA-sequencing |
| 共培养功能实验 | 细胞系或原代细胞、处理条件(LPS+FFA浓度)、AMD3100和CXCL12抗体浓度、处理时间、检测指标 阅读提示:Materials and Methods: Endothelial-leukocyte adhesion/chemotaxis/transendothelial migration assays, Inhibition of CXCL12-CXCR4 axis |