患者样本分析
评估AF患者与SR患者之间H2S水平、Warburg效应、ERS和心房纤维化的差异
收集风湿性心脏病患者左心耳组织,分为AF组和SR组,检测H2S水平、CSE/3-MST/CBS表达、Warburg效应标志物、ERS标志物、纤维化程度和左心房功能。
Hydrogen Sulfide Ameliorates Angiotensin II-Induced Atrial Fibrosis Progression to Atrial Fibrillation Through Inhibition of the Warburg Effect and Endoplasmic Reticulum Stress.
包含患者样本、大鼠模型和细胞模型三个独立证据层级,并进行了功能验证(AF诱导、凋亡检测)和机制验证(Warburg效应、ERS、线粒体功能)。
患者左心耳组织样本(风湿性心脏病伴AF或无AF) SD大鼠AngII诱导心房纤维化模型 HL-1细胞AngII处理模型
H2S水平及CSE/3-MST/CBS表达变化 Warburg效应标志物(PDK-4、LDHA、乳酸、ATP、葡萄糖消耗) ERS标志物(p-PERK、p-eIF2α、ATF4、CHOP、caspase-12) 心房纤维化程度(Masson染色、胶原Iα/IIIα、MMP-9) AF易感性(AF诱发次数、持续时间、AERP、AERPd)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估AF患者与SR患者之间H2S水平、Warburg效应、ERS和心房纤维化的差异
收集风湿性心脏病患者左心耳组织,分为AF组和SR组,检测H2S水平、CSE/3-MST/CBS表达、Warburg效应标志物、ERS标志物、纤维化程度和左心房功能。
验证AngII诱导的大鼠心房纤维化和AF易感性,并测试NaHS、DCA和4-PBA的影响
雄性SD大鼠皮下植入微泵持续输注AngII(200 ng/kg/min)4周,同时腹腔注射NaHS(56 μM/kg qd)、DCA(50 mg/kg qd)或4-PBA(20 mg/kg qd),通过经食管刺激诱导AF,评估心房纤维化、Warburg效应、ERS和电生理参数。
验证AngII对HL-1细胞CSE表达、凋亡、Warburg效应和ERS的影响,并测试NaHS、DCA和4-PBA的保护作用
HL-1细胞用AngII(200 nM)处理24小时,或预先用NaHS(100 μM)、DCA(1.5 mM)或4-PBA(500 μM)处理24小时后再加AngII。检测细胞活力、凋亡、ROS、氧化损伤、线粒体功能、Warburg效应和ERS标志物。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 蛋白质印迹 | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013F |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0012S | |
| PVDF膜 | Beyotime | FFP33 | |
| 抗PDK-4抗体 | Abcam | ab89295 | |
| 抗PDH抗体 | Abcam | ab172617 | |
| 抗LDHA抗体 | Abcam | ab222910 | |
| 抗MMP-9抗体 | Abcam | ab58803 | |
| 抗p-PERK抗体 | Affinity | DF7576 | |
| 抗PERK抗体 | Affinity | AF5304 | |
| 抗p-eIF2α抗体 | Cell Signaling | 9721 | |
| 抗eIF2α抗体 | Cell Signaling | 9722 | |
| 抗Caspase-12抗体 | Abcam | ab8117 | |
| 抗ATF4抗体 | Abcam | ab23760 | |
| 抗CHOP抗体 | Abcam | ab11419 | |
| 抗CBS抗体 | Abnova | H00000875-M01 | |
| 抗CSE抗体 | BIOSS | bs-9515R | |
| 抗3-MST抗体 | Abcam | ab224043 | |
| 抗GAPDH抗体 | Abcam | ab9484 | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG(H+L) | Beyotime | A0208 | |
| HRP标记的山羊抗小鼠IgG(H+L) | Beyotime | A0216 | |
| 凝胶成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| Quantity One软件 | Bio-Rad | -- | |
| Super Signal West Pico化学发光底物 | Thermo | -- | |
| Masson染色 | 奥林巴斯显微镜 | Olympus | IX-70 |
| 代谢检测 | 乳酸试剂盒 | 南京建成 | A019-2 |
| 葡萄糖消耗试剂盒 | Sigma | MAK083 | |
| ATP检测试剂盒 | Cloud Clone Corp | CEA349Ge | |
| 线粒体功能 | Clark型氧电极 | Hansatech Instruments | -- |
| PCR | TRIzol试剂 | Tiangen Biotech | -- |
| M-MLV逆转录酶 | Promega | -- | |
| SYBR Premix Ex Taq | Takara | -- | |
| 动物模型 | 微型泵(型号2004) | Alzet | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本收集 | 心房颤动组和窦性心律组各6例,年龄、性别、血压、BMI等基线数据匹配 阅读提示:Materials and Methods: Human Left Atrial Appendage; Table 1 |
| 动物模型 | 雄性SD大鼠,200-250g,AngII剂量200 ng/kg/min,皮下微泵连续4周;NaHS 56 μM/kg qd,DCA 50 mg/kg qd,4-PBA 20 mg/kg qd,腹腔注射4周 阅读提示:Materials and Methods: Animal Models and Animal Experimental Design |
| 电生理检测 | 经食管刺激诱导AF,AF定义为心电图出现不规律RR间期持续至少1秒;记录AF发作次数和持续时间 阅读提示:Materials and Methods: Animal Models; Figure 4N-R legend |
| 细胞模型 | HL-1细胞,AngII 200 nM处理24小时;NaHS 100 μM、DCA 1.5 mM、4-PBA 500 μM预处理24小时 阅读提示:Materials and Methods: HL-1 Experimental Design |
| Western blotting | 抗体稀释比例和品牌:anti-PDK-4 (1:500, Abcam), anti-PDH (1:5000), anti-LDHA (1:1500)等 阅读提示:Materials and Methods: Western Blotting |