生成肝细胞特异性CD36敲除小鼠及表型分析
验证肝细胞CD36缺失对HFD诱导的NAFLD的影响
使用Cre-Loxp系统生成CD36LKO小鼠,给予NCD或HFD喂养16周,检测体重、肝重、血清指标、肝脏脂质沉积、组织学和胰岛素敏感性
CD36 promotes de novo lipogenesis in hepatocytes through INSIG2-dependent SREBP1 processing.
研究包含体内动物模型(CD36LKO小鼠)、体外细胞模型(HepG2、原代肝细胞)、转录组学(RNA-seq)和机制验证(Co-IP、PLA、免疫荧光)等多个独立证据层级,并进行功能验证和机制验证。
CD36LKO小鼠 HepG2细胞 原代小鼠肝细胞 NAFLD患者肝脏样本(GEO数据集)
CD36LKO小鼠的构建及敲除效率验证(Cre-Loxp系统) HFD喂养诱导NAFLD模型(16周,60 kcal%脂肪) 胰岛素处理条件(100 nM, 12小时) siRNA敲低CD36和INSIG2(siCD36、siINSIG2) 25-HC和betulin处理浓度(5 μM和15 μM)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证肝细胞CD36缺失对HFD诱导的NAFLD的影响
使用Cre-Loxp系统生成CD36LKO小鼠,给予NCD或HFD喂养16周,检测体重、肝重、血清指标、肝脏脂质沉积、组织学和胰岛素敏感性
鉴定CD36缺失后肝脏中差异表达的基因及富集通路
对HFD喂养的fl/fl和CD36LKO小鼠肝脏进行RNA-seq,并进行GO分析和PPI网络分析,筛选核心基因
在无外源FFA条件下直接验证CD36对脂质合成的作用
在HepG2细胞中过表达或敲低CD36,或分离原代肝细胞,用胰岛素刺激,检测脂滴形成和脂肪生成酶表达
探究CD36是否影响SREBP1从ER到高尔基体的转位和蛋白水解
分离ER和Golgi组分,检测SREBP1分布;免疫荧光观察SREBP1(红色TRITC)与Golgi(绿色FITC)共定位;细胞质/核分离检测核内SREBP1
证实CD36与INSIG2的物理相互作用并探究其破坏INSIG2-SCAP结合的机制
免疫共沉淀(Co-IP)检测CD36与INSIG2的互作;PLA检测CD36-INSIG2和SCAP-INSIG2的邻近;免疫荧光检测SCAP与Golgi共定位
验证CD36对SREBP1加工的作用依赖于INSIG2
在HepG2细胞中敲低CD36和INSIG2,检测SREBP1加工和脂肪生成基因表达;另外用增强SCAP-INSIG相互作用的药物处理,观察对CD36作用的影响
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型构建 | 白蛋白-Cre转基因小鼠 | 上海模式生物中心 | -- |
| 动物饮食 | 正常饮食(D12450B) | Research Diets | -- |
| 高脂饮食(D12492) | Research Diets | -- | |
| 血糖测量 | ACCU-CHEK Advantage血糖仪 | Roche Diagnostics | -- |
| 组织学分析 | 自动全切片扫描仪 | 3DHISTECH | -- |
| 脂质测定 | 甘油三酯试剂盒 | Biosino | -- |
| 总胆固醇试剂盒 | Biosino | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 过表达构建 | 携带NC和CD36 cDNA的慢病毒(GV341)颗粒 | Genechem | -- |
| 带N端HA标签的人全长SREBP1表达载体 | GeneCopoeia | -- | |
| 药物处理 | 白桦脂醇 | MCE | HY-N0083 |
| 25-羟基胆固醇 | -- | HY-113134 | |
| siRNA转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Life Technologies | 13778030 |
| 原代肝细胞分离 | IV型胶原酶 | -- | -- |
| 原代肝细胞培养 | I型胶原包被的培养板 | -- | -- |
| 脂滴染色 | BODIPY493/503染料 | Invitrogen | D3922 |
| DAPI染液 | -- | -- | |
| 免疫印迹 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 兔抗CD36抗体 | Novus Biological | NB400-144 | |
| 小鼠抗CD36抗体 | Novus Biological | NB600-1423 | |
| 小鼠抗SREBP1抗体 | Novus Biological | NB600-582 | |
| 兔抗SREBP1抗体 | Proteintech Group | 14088-1-AP | |
| 兔抗SREBP2抗体 | Proteintech Group | 28212-1-AP | |
| 兔抗Golgin97抗体 | Proteintech Group | 12640-1-AP | |
| 小鼠抗GM130抗体 | Proteintech Group | 66662-1-Ig | |
| 兔抗INSIG2抗体 | Proteintech Group | 24766-1-AP | |
| 兔抗lamin b1抗体 | Proteintech Group | 12987-1-AP | |
| 小鼠抗GAPDH抗体 | Proteintech Group | 60004-1-Ig | |
| 兔抗ACLY抗体 | Cell Signaling Technology | 4332 | |
| 兔抗HA标签抗体 | Cell Signaling Technology | 3724 | |
| 兔抗FLAG标签抗体 | Cell Signaling Technology | 14793 | |
| 小鼠抗FLAG标签抗体 | Cell Signaling Technology | 8146 | |
| 兔抗Calnexin抗体 | Cell Signaling Technology | 2433 | |
| 兔抗ACCα抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-30212 | |
| 小鼠抗FASN抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-48357 | |
| 小鼠抗SCAP抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-13553 | |
| 兔抗INSIG1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-25124-R | |
| 兔抗SCD1抗体 | Elabscience Biotechnology | E-AB-66816 | |
| 兔抗HMGCR抗体 | Bioss Biotechnology | bsm-52822R | |
| 兔抗β-肌动蛋白抗体 | Bioss Biotechnology | bs-0061R | |
| 核浆分离 | NE-PER核浆提取试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 78833 |
| PLA | Duolink邻位连接试剂盒 | Sigma | -- |
| RNA提取 | RNAiso Plus试剂 | TaKaRa | 9108 |
| cDNA合成 | PrimeScript RT试剂盒 | TaKaRa | DRR037A |
| Q-PCR | SYBR Green PCR Mix试剂盒 | TaKaRa | -- |
| CFX connect实时荧光定量PCR仪 | Bio-Rad | -- | |
| RNA-seq | Illumina Hiseq2000测序平台 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型构建与饲养 | 遗传背景(C57BL/6)、年龄(6-8周龄)、性别(雄性)、饮食类型(NCD或HFD)及喂养周期(16周) 阅读提示:Materials and methods 2.1 Animal model and diets |
| CD36LKO小鼠验证 | 敲除效率检测方法(免疫印迹和Q-PCR)、对照鼠(fl/fl) 阅读提示:Results 3.2 及 Figure S2 |
| GTT和ITT | 禁食时间(GTT:12h,ITT:4h)、葡萄糖剂量(1g/kg)、胰岛素剂量(0.7U/kg)、测量时间点(0-120min) 阅读提示:Materials and methods 2.2 Glucose tolerance tests (GTTs) and insulin tolerance tests (ITTs) |
| RNA-seq分析 | 每组样本量(n=3)、差异基因筛选阈值(|log2FC|>1且Padj<0.05) 阅读提示:Materials and methods 2.13 RNA isolation, real-time quantitative PCR (Q-PCR) analysis, and RNA sequence |
| 细胞实验 | HepG2细胞培养条件、胰岛素浓度(100nM)和处理时间(12h或不同时间点)、siRNA转染浓度(siCD36和siINSIG2序列)、药物浓度(25-HC 5μM、betulin 15μM)和溶剂对照(DMSO) 阅读提示:Materials and methods 2.6 Cell lines and cell treatment |
| 原代肝细胞分离 | 小鼠年龄(8-10周龄)、灌流缓冲液成分和浓度、胶原酶浓度(0.5mg/ml)、铺板条件(collagen I-coated plates) 阅读提示:Materials and methods 2.7 Primary hepatocytes culture |
| 分子检测 | 抗体信息(特异性和稀释度未明确)、PLA实验条件(Duolink试剂盒)、亚细胞提取试剂盒型号 阅读提示:Materials and methods 2.9 Co-immunoprecipitation and immunoblotting, 2.10 Nuclear and cytoplasmic extraction, 2.11 Isolation of ER and Golgi, 2.12 Immunofluorescence and PLA |