高通量筛选
鉴定能增强奥希替尼诱导的生长抑制的化合物。
使用约1000种化合物的定制文库,在H1975和HCC827细胞中进行,检测化合物±奥希替尼处理后的细胞活力。
Targeting Aurora B kinase prevents and overcomes resistance to EGFR inhibitors in lung cancer by enhancing BIM- and PUMA-mediated apoptosis.
包含体外细胞实验、基因敲除/敲除、异种移植模型及患者来源异种移植模型,并进行机制研究(如激酶实验、免疫沉淀)和功能验证。
H1975细胞系(EGFR L858R/T790M) ECLC26患者来源细胞系(EGFR L858R) H1975异种移植模型 患者来源异种移植模型(ECLC26、Ru813c、Lx1114)
Aurora B激酶抑制剂(如PF03814735)浓度及处理时间 奥希替尼浓度及处理时间 BIM和PUMA表达水平 EMT状态(E-cadherin、vimentin表达) ATR-CHK1-AURKB通路激活状态
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定能增强奥希替尼诱导的生长抑制的化合物。
使用约1000种化合物的定制文库,在H1975和HCC827细胞中进行,检测化合物±奥希替尼处理后的细胞活力。
验证候选化合物是否能增强奥希替尼诱导的凋亡。
在多个EGFR突变NSCLC细胞系中,用膜联蛋白V染色检测细胞死亡。
阐明Aurora B抑制如何增强凋亡。
通过免疫印迹、qRT-PCR、基因敲除等研究BIM和PUMA的调控。
建立奥希替尼耐药细胞系并表征其特性。
通过逐步增加奥希替尼浓度建立耐药细胞系,并分析其EMT标志物和信号通路。
评估奥希替尼和PF联合治疗的体内疗效。
在异种移植模型(包括PDX)中,用载体、奥希替尼、PF或联合治疗,监测肿瘤生长。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 高通量筛选 | 高通量筛选化学文库 | Selleck Chemicals | -- |
| 药物处理 | 奥希替尼 | Selleck Chemicals | S7297 |
| PF03814735 | Selleck Chemicals | S2725 | |
| 帕博西尼 | Selleck Chemicals | S1116 | |
| 诺考达唑 | Selleck Chemicals | S2775 | |
| 细胞培养 | 基质胶 | BD Biosciences | -- |
| 免疫印迹 | BIM抗体 | EMD Biosciences | 202000 |
| 磷酸化BIM(Ser87)抗体 | Bioss Inc | bs-3012R | |
| 流式细胞术 | 膜联蛋白V-FITC | BioVision | 1001-1000 |
| 细胞活力检测 | alamarBlue活力检测 | Thermo Fisher Scientific | DAL1100 |
| CellTiter-Glo发光细胞活力检测 | Promega | G7572 | |
| RNA-seq | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RNeasy Mini试剂盒 | Qiagen | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源和培养基,如H1975、HCC827、PC9、ECLC26的培养条件 阅读提示:STAR Methods的Cell Line Authentication部分 |
| 药物处理 | 奥希替尼和PF03814735的浓度、处理时间 阅读提示:图例和图2A、图4A、图5C等 |
| 凋亡检测 | 膜联蛋白V染色的细胞处理时间和浓度 阅读提示:STAR Methods的Cell Viability Assays部分 |
| 机制研究 | 用于siRNA转染的浓度和试剂 阅读提示:STAR Methods的Plasmid Construction等部分 |
| 体内实验 | 动物品系、细胞注射数量、给药剂量和频率 阅读提示:STAR Methods的Animal Models部分 |