临床样本分析
评估衰老过程中MACF1、OCN、OSTERIX的表达变化及其相关性。
收集60-79岁和80-95岁绝经后女性股骨样本,通过RT-PCR、Western blot和免疫组化检测MACF1、OCN、OSTERIX的mRNA和蛋白水平,并进行相关性分析。
MACF1 alleviates aging-related osteoporosis via HES1.
包含人类样本、衰老小鼠模型、OVX小鼠模型、细胞实验、RNA-seq、功能验证及机制验证,证据层级多且独立。
MC3T3‐E1细胞系 小鼠原代骨髓间充质干细胞(BMSCs) 老化小鼠模型(21月龄C57BL/6) 卵巢切除(OVX)小鼠模型
人类股骨样本:绝经后女性,60-95岁,髋部骨折后一周内手术 老化小鼠模型:雄性C57BL/6,21月龄,雌性C57BL/6,21月龄 OVX小鼠模型:雌性C57BL/6,3月龄手术,术后35天处死 MACF1过表达质粒:PEGFP-C1A-ACF7,老化小鼠股骨骨膜注射,每次40μL,在第1、15、29天注射 MACF1过表达质粒:OVX小鼠颅骨皮下注射,每次40μL,每日两次,在OVX后第6、8、10天进行
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估衰老过程中MACF1、OCN、OSTERIX的表达变化及其相关性。
收集60-79岁和80-95岁绝经后女性股骨样本,通过RT-PCR、Western blot和免疫组化检测MACF1、OCN、OSTERIX的mRNA和蛋白水平,并进行相关性分析。
评估衰老小鼠骨组织和BMSCs中MACF1、OCN、OSTERIX的表达及成骨分化能力的变化。
收集6月龄和21月龄C57BL/6小鼠股骨和BMSCs,通过RT-PCR、Western blot、IHC、双钙黄绿素标记、ALP染色、茜素红染色检测相关指标。
鉴定衰老小鼠骨组织中差异表达的基因,特别是HES1的表达变化。
对6月龄和21月龄雄性和雌性C57BL/6小鼠股骨进行RNA-seq分析,鉴定差异表达基因。
验证MACF1对HES1表达和活性的调控作用。
在MC3T3‐E1细胞和原代BMSCs中,通过过表达或敲低MACF1,检测HES1的mRNA和蛋白水平,并使用荧光素酶报告基因检测HES1活性。
评估MACF1过表达质粒对衰老小鼠骨形成的挽救效果。
对21月龄C57BL/6小鼠进行股骨骨膜注射MACF1过表达质粒或对照质粒,通过RT-PCR、IHC、双钙黄绿素标记、micro-CT、TRAP染色等检测骨形成和骨吸收指标。
评估MACF1过表达质粒对绝经后骨质疏松小鼠骨形成的挽救效果。
对OVX小鼠进行颅骨皮下注射MACF1过表达质粒或对照质粒,通过组织形态计量学、双钙黄绿素标记、IHC检测骨形成指标。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | α-MEM培养基 | Gibco | 11900-024 |
| 胎牛血清 | Biological Industries | 04-001-1A | |
| L-谷氨酰胺 | Sigma | G8540 | |
| 青霉素 | Amresco | 0242 | |
| 链霉素 | Amresco | 0382 | |
| 培养箱 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 成骨分化诱导 | 地塞米松 | Sigma | D4902 |
| β-甘油磷酸 | Sigma | G9422 | |
| 抗坏血酸 | Sigma | A7631 | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15 |
| RNAlater溶液 | Qiagen | 76 | |
| RT-PCR | 一步法PrimeScript RT试剂盒 | Takara | RR037A |
| SYBR Premix Ex Taq II试剂盒 | Takara | RR820A | |
| Western blot | 蛋白酶抑制剂混合物 | Calbiochem | 539 |
| 细胞裂解液 | Beyotime | P0013 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23 | |
| 硝酸纤维素滤膜 | Pall | 66 | |
| 脱脂牛奶 | BD Biosciences | 232 | |
| MACF1抗体 | Abcam | ab117418 | |
| OCN抗体 | Proteintech | 23418-1-AP | |
| OSTERIX抗体 | Proteintech | 12593-1-AP | |
| HES1抗体 | Bioss | bs-2972R-1 | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 10494-1-AP | |
| HRP标记二抗 | CWBIO | CW0103 | |
| 化学发光检测系统 | Thermo Fisher Scientific | NCI5080 | |
| X射线胶片 | Kodak | 6535876 | |
| 免疫组化 | 山羊血清 | CWBIO | CW0130 |
| HRP标记二抗 | CWBIO | CW0103 | |
| Aperio AT2数字病理扫描仪 | Leica | -- | |
| Image-Pro Plus 6.0软件 | -- | -- | |
| 细胞转染 | Neon转染系统 | Invitrogen | -- |
| 遗传霉素 | MP Biomedicals | 0215878291 | |
| ALP染色 | BCIP/NBT碱性磷酸酶显色试剂盒 | Beyotime Biotechnology | C3206 |
| 茜素红染色 | 茜素红S | Sigma | A5533 |
| 骨组织形态计量学 | 钙黄绿素 | Sigma | C0875 |
| OCT包埋剂 | Leica | 14020108926 | |
| 冷冻切片机 | Leica | CM1100 | |
| 荧光显微镜 | Nikon | -- | |
| TRAP试剂盒 | Sigma-Aldrich | -- | |
| micro-CT分析 | 显微CT系统 | Scando Medical | -- |
| 荧光素酶报告基因检测 | PNL1.1质粒 | Promega | N1351 |
| Engreen EntransterTM-H4000转染试剂 | Engreen | 4000-6 | |
| Nano-Glo®荧光素酶检测系统 | Promega | N1120 | |
| 动物实验 | PEGFP-C1A-ACF7质粒 | -- | -- |
| PEGFP-C1A质粒 | -- | -- | |
| EntransterTM体内转染试剂 | Engreen Biosystem Co. Ltd. | 18668-11-2 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 人类样本分析 | 样本纳入标准:绝经后女性,60-95岁,髋部骨折后一周内手术;排除标准;样本类型:股骨头骨折远端小梁骨;样本量需核对。 阅读提示:参见Materials and Methods 2.1节 |
| 衰老小鼠模型 | 小鼠品系、性别、年龄(6月龄 vs 21月龄)、饲养条件;每组样本量:n=5/组(BMSC分离),n=5/组(RT-PCR),n=3/组(Western blot),n=3/组(IHC),n=3/组(RNA-seq)。 阅读提示:参见Materials and Methods 2.1节 |
| BMSCs分离培养 | 小鼠年龄(6月龄 vs 21月龄);分离步骤;培养条件(α-MEM, 10% FBS, 1% L-谷氨酰胺, 1% 青霉素/链霉素);传代次数(第3代用于实验)。 阅读提示:参见Materials and Methods 2.2节 |
| 细胞培养与成骨分化 | 细胞系:MC3T3-E1,原代BMSCs;培养条件:37°C,5% CO2;成骨诱导培养基成分:α-MEM, 10% FBS, 1mM地塞米松, 1% β-甘油磷酸, 1% 抗坏血酸, 1% L-谷氨酰胺;诱导时间:MC3T3-E1 22天,BMSCs 26天;培养基每2天更换。 阅读提示:参见Materials and Methods 2.1节和2.8节 |
| MACF1过表达/敲低 | 过表达质粒:PEGFP-C1A-ACF7;对照质粒:PEGFP-C1A;转染方法:电穿孔(1800V, 30ms),MC3T3-E1 1×10^7/孔,BMSCs 5×10^6/孔;筛选:650μg/mL遗传霉素,培养两周;敲低:shRNA慢病毒载体。 阅读提示:参见Materials and Methods 2.7节 |
| 动物体内治疗实验 | 老化小鼠模型:21月龄雄性C57BL/6,骨膜注射,每次40μL,第1、15、29天注射,48天后处死;OVX模型:2月龄雌性C57BL/6,3月龄手术,术后第6、8、10天皮下注射,每日两次,每次40μL,不同时间点处死(15天或38天)。 阅读提示:参见Materials and Methods 2.12节 |