建立细胞模型
筛选卵巢癌细胞系用于后续实验,并构建HE4和ANXA2稳定敲低的细胞系。
培养CAOV3、SKOV3和OVCAR3细胞,检测HE4、ANXA2和P-gp的基础表达。构建pSilencer 4.1-CMV neo载体,转染CAOV3细胞,筛选稳定敲低细胞系CAOV3-HE4-L(HE4 shRNA)和CAOV3-A2-L(ANXA2 shRNA)。
Human epididymis protein 4 promotes P‑glycoprotein‑mediated chemoresistance in ovarian cancer cells through interactions with Annexin II.
包括体外细胞模型、稳定转染敲低、抗体/活性蛋白干预、患者组织IHC和TCGA/GSEA分析,并含功能验证和机制探索。
卵巢癌细胞系CAOV3、SKOV3和OVCAR3 稳定转染敲低细胞系CAOV3-HE4-L和CAOV3-A2-L 临床卵巢癌组织样本(52例) TCGA卵巢癌数据队列(374例)
HE4、ANXA2和P-gp在三株卵巢癌细胞系中的本底表达水平 稳定转染细胞系CAOV3-HE4-L和CAOV3-A2-L的敲低效率及P-gp表达变化 HE4、ANXA2和P-gp之间的物理相互作用和共定位 外源性HE4/ANXA2活性蛋白或抗体处理对P-gp表达的影响 hsa-miR-129-5p在敲低细胞和不同处理中的表达变化
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
筛选卵巢癌细胞系用于后续实验,并构建HE4和ANXA2稳定敲低的细胞系。
培养CAOV3、SKOV3和OVCAR3细胞,检测HE4、ANXA2和P-gp的基础表达。构建pSilencer 4.1-CMV neo载体,转染CAOV3细胞,筛选稳定敲低细胞系CAOV3-HE4-L(HE4 shRNA)和CAOV3-A2-L(ANXA2 shRNA)。
确认HE4、ANXA2和P-gp在卵巢癌细胞中的表达情况及其相互作用。
用Western blot检测三株细胞中HE4、ANXA2、P-gp的表达;免疫细胞化学检测P-gp表达;通过免疫共沉淀(co-IP)和免疫荧光共定位分析HE4与ANXA2、ANXA2与P-gp的相互作用。
探讨敲低HE4或ANXA2对卵巢癌细胞药物敏感性和P-gp功能的影响。
对CAOV3、CAOV3-Mock、CAOV3-HE4-L和CAOV3-A2-L细胞进行MTT实验检测阿霉素的IC50,流式细胞术检测细胞膜P-gp表达和阿霉素蓄积,并用P-gp抑制剂维拉帕米(VER)验证P-gp活性。
验证HE4和ANXA2对P-gp表达的直接调控作用及ANXA2的必要性。
用HE4或ANXA2活性蛋白、相应抗体、IgG对照处理CAOV3细胞,并用HE4活性蛋白处理CAOV3-A2-L细胞,检测P-gp蛋白和mRNA表达。
评估HE4和P-gp在化疗耐药和敏感卵巢癌组织中的表达及其与预后的关系。
对52例卵巢癌患者的组织进行IHC检测HE4和P-gp表达,分组为化疗耐药组和敏感组,分析表达差异、与临床病理参数的关系,并进行生存分析。
探索HE4/ANXA2调控P-gp的可能机制,寻找靶向ABCB1的miRNA。
使用miRanda、TargetScan、DIANA和miRDB预测靶向ABCB1的miRNA,取交集;用RT-qPCR检测五个候选miRNA在敲低细胞中的表达,以及不同处理下hsa-miR-129-5p的表达变化。
鉴定HE4、ANXA2和P-gp共同参与的信号通路,提示耐药相关机制。
利用TCGA数据库下载卵巢癌数据,按HE4、ANXA2、ABCB1表达分组,进行GSEA分析,寻找共同富集的信号通路。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | McCoy's 5A改良培养基 | Gibco; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| 胎牛血清 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| 细胞培养与转染 | pSilencer 4.1-CMV neo载体 | Ambion; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| 细胞转染 | Lipofectamine LTX与Plus试剂 | Invitrogen; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| 细胞培养与转染 | Opti-MEM培养基 | Invitrogen; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| 稳定转染筛选 | G418 | Invitrogen; Thermo Fisher Scientific, Inc. | cat. no. 11811023 |
| Western blot | 兔抗人HE4抗体 | Abcam | ab109298 |
| 小鼠抗人ANXA2抗体 | ProteinTech Group, Inc. | 66035-1-Ig | |
| 兔抗人P-gp抗体 | Santa Cruz Biotechnology, Inc. | sc-8313 | |
| 小鼠抗人β-肌动蛋白抗体 | Beijing Biosynthesis Biotechnology Co., Ltd. | bsm-33036M | |
| 山羊抗兔二抗 | ZSGB-BIO | ZB-2301 | |
| 山羊抗小鼠二抗 | ZSGB-BIO | ZB-2305 | |
| 免疫细胞化学 | 兔抗人P-gp抗体 | Santa Cruz Biotechnology, Inc. | sc-8313 |
| 细胞培养(co-IP) | McCoy's 5A培养基 | Hyclone; Cytvia | SH30270.01 |
| 免疫共沉淀 | 兔抗人HE4抗体 | Abcam | ab109298 |
| 兔抗人ANXA2抗体 | Abcam | ab235939 | |
| 山羊抗人HE4抗体 | Santa Cruz Biotechnology, Inc. | sc27570 | |
| 小鼠抗人P-gp抗体 | Santa Cruz Biotechnology, Inc. | sc13131 | |
| 小鼠抗人ANXA2抗体 | ProteinTech Group, Inc. | 66035-1-Ig | |
| 兔IgG | BIOSS | bs-0295P | |
| Amersham ECL Prime Western印迹检测试剂 | Cytvia | RPN2232 | |
| 免疫荧光 | 异硫氰酸荧光素(FITC)绿色荧光标记兔IgG | Beijing Zhongshan Jinqiao Biotechnology Co., Ltd. | ZF-0314 |
| 四甲基罗丹明(TRITC)红色荧光标记小鼠IgG | Beijing Zhongshan Jinqiao Biotechnology Co., Ltd. | ZF-0316 | |
| 4′,6-二脒基-2-苯基吲哚(DAPI) | Beyotime Institute of Biotechnology | C1002 | |
| RT-qPCR | RNAiso Plus试剂 | Takara Biotechnology Co., Ltd. | -- |
| PrimeScript RT试剂盒 | Takara Biotechnology Co., Ltd. | -- | |
| SYBR Premix Ex Taq™ | -- | -- | |
| 罗氏LightCycler系统 | Roche | -- | |
| MTT实验 | 阿霉素 | Meilun Biotechnology Co., Ltd. | MB1087-S |
| MTT(噻唑蓝四氮唑溴化物) | Beijing Solarbio Science & Technology Co., Ltd. | -- | |
| 二甲基亚砜 | Beyotime Institute of Biotechnology | ST038 | |
| 流式细胞术(细胞表面P-gp检测) | 胰蛋白酶(0.25%) | Gibco; Thermo Fisher Scientific, Inc. | 25200-072 |
| 牛血清白蛋白(BSA) | Biological Industries | 04-011-1A/B | |
| PE标记的抗人P-gp单克隆抗体(克隆UIC2) | eBioscience; Thermo Fisher Scientific, Inc. | 12-2439 | |
| 流式细胞术(阿霉素蓄积) | 维拉帕米 | Nanjing SenBeiJia Biological Technology Co., Ltd. | 100223 |
| 外源蛋白和抗体阻断实验 | HE4外源活性蛋白 | Novoprotein | C550A |
| ANXA2外源活性蛋白 | Novoprotein | C205A | |
| HE4抗体 | Abcam | ab109298 | |
| ANXA2抗体 | ProteinTech Group, Inc. | 66035-1-Ig | |
| 免疫组织化学 | 兔抗人HE4抗体 | Abcam | ab109298 |
| 兔抗人P-gp抗体 | Santa Cruz Biotechnology, Inc. | sc-8313 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系:CAOV3、SKOV3、OVCAR3;培养基:McCoy's 5A改良培养基,10%FBS;培养条件:37°C、5% CO2 阅读提示:Materials and methods, Cell culture and transfection |
| 稳定转染细胞系的构建 | 载体:pSilencer 4.1-CMV neo;转染试剂:Lipofectamine LTX with Plus;质粒用量:3.0 µg;筛选抗生素:G418(800 µg/ml),筛选时间:14天 阅读提示:Materials and methods, Cell culture and transfection |
| 蛋白间相互作用分析 | 抗体:抗HE4(ab109298)、抗ANXA2(66035-1-Ig)、抗P-gp(sc-8313、sc13131)、抗ANXA2(ab235939);阴性对照:兔IgG;方法:co-IP和免疫荧光共定位 阅读提示:Materials and methods, Co-immunoprecipitation 和 Confocal laser scanning microscopy |
| 药物敏感性检测 | 药物:阿霉素(0-10 µg/ml),处理时间:24 h;MTT法:细胞数2000/孔,孵育4 h;IC50计算;平行复孔:3个,重复次数:3次 阅读提示:Materials and methods, MTT assay |
| P-gp表达和功能检测 | 细胞数量:0.2 × 10^6(表面染色)、5 × 10^5(蓄积);抗体:PE标记抗P-gp(UIC2);抑制剂:维拉帕米(50 µM,预处理1 h);阿霉素浓度:10 µM,孵育60 min;流式细胞仪 阅读提示:Materials and methods, Assessment of P-gp expression on the cell surface 和 Measurement of adriamycin accumulation by flow cytometry |
| 外源蛋白和抗体干预 | 蛋白浓度:HE4活性蛋白100 ng/ml,ANXA2活性蛋白10 ng/ml;抗体浓度:10 µg/ml;处理时间:0、12、24 h;细胞系:CAOV3和CAOV3-A2-L 阅读提示:Materials and methods, Antibody blocking and exogenous active protein supplementation tests |
| 临床组织样本分析 | 样本量:52例卵巢癌组织,包括不同组织学类型;分组:化疗耐药组(23例)和化疗敏感组(29例);IHC抗体:抗HE4(1:40)、抗P-gp(1:50);判读标准:高表达(++/+++)和低表达(−/+) 阅读提示:Materials and methods, IHC |
| miRNA表达分析 | 候选miRNA:hsa-miR-129-5p、hsa-miR-4282、hsa-miR-4778-5p、hsa-miR-4708-3p、hsa-miR-4432;RT-qPCR内参:RNU6-2;数据处理:2^−ΔΔCq方法 阅读提示:Materials and methods, RT-qPCR 和 Results, Inhibitory regulation of hsa-miR-129-5p |
| TCGA数据获取与GSEA | 数据来源:TCGA卵巢癌数据(GDC API),纳入样本数:374例;分组:按表达分组,前25%为低表达,后25%为高表达;GSEA软件:GSEA 3.0;基因集:C2.cp.kegg.v6.1.symbols.gmt;显著性阈值:FDR<0.25,P<0.05 阅读提示:Materials and methods, Data collection from TCGA database and GSEA |