生成Color-Switch PER2::LUCIFERASE报告小鼠
开发一种能够同时观察不同细胞类型昼夜节律的遗传工具。
构建了Cre依赖的双色荧光素酶报告基因小鼠,将PER2与CBR或CBG荧光素酶融合,通过Cre重组切换颜色。
Dual-Color Single-Cell Imaging of the Suprachiasmatic Nucleus Reveals a Circadian Role in Network Synchrony.
包含基因敲入小鼠构建、离体SCN培养、双色生物发光成像、TTX解耦联、行为学实验、免疫组化和计算建模等多层级验证。
VIP-Cre转基因小鼠 AVP-Cre转基因小鼠 VIP-Bmal1条件敲除小鼠 AVP-Bmal1条件敲除小鼠
Cre驱动系的特异性:VIP-Cre和AVP-Cre在SCN中的表达模式 TTX处理浓度1 μM及处理时间一周 Bmal1条件敲除的效率及对昼夜节律的影响 SCN离体培养的条件:小鼠年龄(2-6个月)、切片厚度(250-300 μm)及培养时间 生物发光成像中的温度控制:36.5°C ± 0.2°C
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
开发一种能够同时观察不同细胞类型昼夜节律的遗传工具。
构建了Cre依赖的双色荧光素酶报告基因小鼠,将PER2与CBR或CBG荧光素酶融合,通过Cre重组切换颜色。
监测SCN中VIP和AVP神经元的单细胞昼夜节律。
从VIP-Cre或AVP-Cre与Color-Switch小鼠杂交的后代中制备SCN切片,使用定制双色成像系统连续记录7天。
评估网络耦合对VIP和AVP神经元昼夜节律的影响。
在VIP-Cre和VIP-Bmal1-/-或AVP-Cre和AVP-Bmal1-/- SCN切片中,使用1 μM TTX处理一周以阻断神经元放电,随后洗脱以恢复耦合。
检验VIP或AVP神经元中Bmal1缺失对昼夜行为的影响。
对VIP-Cre、AVP-Cre对照及条件敲除小鼠进行轮转活动记录,经历LD、DD、LL等光照条件。
检测Bmal1敲除对VIP和AVP信号通路组分表达的影响。
对野生型、VIP-Bmal1-/-、AVP-Bmal1-/-和VIP/AVP-Bmal1-/-小鼠的SCN切片进行免疫染色,检测AVP、VIP、V1a和VPAC2的表达。
模拟不同耦合强度和细胞比例对网络同步的影响。
构建包含AVP、VIP和非AVP/VIP细胞三室的随机模型,改变耦合强度和细胞数量比例,模拟实验结果。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清(ES级) | Gemini | -- | |
| β-巯基乙醇 | Gibco | -- | |
| MEM非必需氨基酸 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 纯化小鼠白血病抑制因子 | -- | -- | |
| 基因靶向 | G418 | -- | -- |
| 携带Cre重组酶的慢病毒载体 | -- | -- | |
| 基因验证 | LA Taq DNA聚合酶 | Takara | -- |
| SCN培养 | HBSS缓冲液 | -- | -- |
| 培养插入(0.4 μm孔径) | Millipore | -- | |
| 无酚红DMEM | Corning | -- | |
| B27补充剂 | Gibco | -- | |
| 成像 | DV2双发射图像分光器 | Photometrics | -- |
| OptoSplit II双发射图像分光器 | Cairn Research | -- | |
| 二向色镜T565lpxr-UF2 | Chroma | -- | |
| 550 nm短通滤光片 | Edmund Optics | #84-708 | |
| 625 nm长通滤光片 | Edmund Optics | #84-746 | |
| 20x 0.75 NA空气物镜 | Nikon | CFI Plan APO VC 20x | |
| 20x 1.00 NA水浸物镜 | Olympus | XLUMPLFLN-W 20x | |
| 制冷CCD相机 | Spectral Instruments | 850S | |
| 增强CCD相机 | Stanford Photonics | XR/MEGA-10Z | |
| 免疫荧光 | 吐温20 | -- | -- |
| Triton X-100 | -- | -- | |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| 正常山羊血清 | Abcam | ab7481 | |
| VIP抗体 | ImmunoStar | 20077 | |
| AVP抗体 | ImmunoStar | 20069 | |
| AVP受体V1a抗体 | Bioss | bs-11598R | |
| VIP受体VPAC2抗体 | Abcam | ab28624 | |
| Alexa Fluor 488标记的山羊抗兔IgG | Life tech | A-11034 | |
| Hoechst 33258 | Molecular Probes | -- | |
| 抗荧光淬灭封片剂 | ThermoFisher | Prolong Glass | |
| 行为学 | 跑轮 | Actimetrics | -- |
| 数据分析 | ClockLab分析软件 | Actimetrics | -- |
| Oriana | Kovach Computing Services | -- | |
| Prism | GraphPad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型生成 | Color-Switch PER2::LUC小鼠的基因型(纯合背景)、Cre驱动系(VIP-Cre和AVP-Cre)的杂合状态、Bmal1条件敲除等位基因的存在 阅读提示:STAR Methods中的'Experimental Model and Subject Details'和'Knock-in Construct'部分 |
| SCN离体培养 | 小鼠年龄(2-6个月)、切片厚度(250-300 μm)、培养基成分(phenol red-free DMEM, B27等)、培养温度(36.5°C) 阅读提示:STAR Methods中的'Ex vivo culture of SCN'部分 |
| TTX处理 | TTX浓度(1 μM)、处理时间(一周)、洗脱步骤(四次转移至新鲜培养基) 阅读提示:STAR Methods中的'Ex vivo culture of SCN'部分及图2和图3图注 |
| 生物发光成像 | 成像系统配置(双色分光器、滤光片、CCD相机)、温度控制(36.5 ± 0.2°C)、曝光时间(15分钟) 阅读提示:STAR Methods中的'Bioluminescence imaging'部分及图1图注 |
| 行为学分析 | 光照条件序列(LD1, DD1, LL, DD2, LD2, DD3)及持续时间、活动记录设备(ClockLab) 阅读提示:STAR Methods中的'Experimental Model and Subject Details'部分及图S5图注 |
| 免疫荧光 | 切片厚度(50 μm)、一抗和二抗稀释比例、封片剂和成像设备(Leica LSM710) 阅读提示:STAR Methods中的'Immunocytochemistry'部分及图5图注 |