临床样本中ERCC6L表达及预后分析
评估ERCC6L在HCC组织中的表达及其与临床病理特征和预后的关系。
利用包含90对HCC及癌旁组织的组织芯片进行IHC染色,评分后分组,并进行卡方检验和Kaplan-Meier生存分析。
ERCC6L promotes the progression of hepatocellular carcinoma through activating PI3K/AKT and NF-κB signaling pathway.
包含组织芯片IHC、细胞增殖/迁移/周期/凋亡实验及裸鼠异种移植模型,并有通路蛋白验证和抑制剂回复实验。
HCC组织芯片(90对肿瘤及癌旁组织) SMMC7721和HuH-7肝细胞癌细胞系 裸鼠异种移植模型
ERCC6L表达水平(IHC评分及shRNA敲低效率) shRNA靶序列及转染条件(2nM,Lipofectamine 3000) 细胞功能实验(MTT、克隆形成、Transwell、周期、凋亡)的处理时间与剂量 体内实验中细胞接种量(1×10^7)及分组(每组7只) 通路验证中deguelin处理浓度与时间(5μM/L,4h)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估ERCC6L在HCC组织中的表达及其与临床病理特征和预后的关系。
利用包含90对HCC及癌旁组织的组织芯片进行IHC染色,评分后分组,并进行卡方检验和Kaplan-Meier生存分析。
验证ERCC6L在HCC细胞系中的表达水平,并选择后续实验细胞系。
通过RT-qPCR检测三种HCC细胞系(SMMC7721、HuH-7、Hep3B)和正常肝细胞系HL-7702中ERCC6L mRNA表达。
评估敲低ERCC6L对HCC细胞增殖、迁移、周期和凋亡的影响。
在SMMC7721和HuH-7细胞中转染shERCC6L或NC,进行MTT、克隆形成、Transwell、流式周期和凋亡及caspase-3/7活性检测。
探究ERCC6L对PI3K/AKT和NF-κB信号通路的调控。
在SMMC7721和HuH-7细胞中敲低或过表达ERCC6L,Western blot检测PI3K、AKT、NF-κB及磷酸化水平;使用deguelin抑制AKT进行回复实验。
评估敲低ERCC6L对体内肿瘤生长的影响。
使用稳定表达shERCC6L或NC的SMMC7721细胞皮下接种裸鼠,监测肿瘤体积和重量。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养与转染 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| RNA提取与qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| Superscript第一链合成系统 | Invitrogen | -- | |
| SYBR Premix Ex Tag II | Takara Bio Inc. | -- | |
| 罗氏4800实时荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems | -- | |
| Western blotting | PVDF膜 | Millipore | -- |
| ERCC6L抗体 | Proteintech | 15,688–1-AP | |
| PI3K抗体 | Bioss | bs-0128R | |
| p-PI3K抗体 | Bioss | bs-6417R | |
| AKT1抗体 | Bioss | bs-0115R | |
| p-AKT1抗体 | Bioss | bs-5194R | |
| NF-κB抗体 | Bioss | bs-0465R | |
| p-NF-κB抗体 | Bioss | bs-5663R | |
| β-actin抗体 | Bioss | bs-0061R | |
| 化学发光试剂盒 | -- | -- | |
| QuantityOne软件 | Bio-Rad | -- | |
| Transwell迁移实验 | Transwell小室 | BD Biosciences | 8.0μm, 24well |
| MTT实验 | MTT溶液 | Sigma | -- |
| 流式细胞术 | 碘化丙啶 | -- | -- |
| Annexin V/FITC-PI凋亡检测试剂盒 | Millipore | -- | |
| Caspase活性检测 | Caspase-Glo® 3/7检测试剂盒 | Promega | -- |
| 免疫组织化学 | HCC组织芯片(HLivH180Su18) | Outdo Biotech | HLivH180Su18 |
| ERCC6L抗体 | Bioss | bs-6380R | |
| 辣根过氧化物酶标记的山羊抗兔IgG | Beyotime | A0208 | |
| DAB溶液 | -- | -- | |
| 徕卡DM4000B显微镜 | Leica | DM4000B | |
| 动物实验 | BALB/c裸鼠 | -- | -- |
| 通路抑制实验 | 鱼藤素 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与转染 | 细胞系来源、培养条件(DMEM+10%FBS)、转染试剂(Lipofectamine 3000)及shRNA浓度(2nM) 阅读提示:Methods: Cell culture and transfection |
| 体外功能实验 | MTT接种密度(2×10^3细胞/孔)及检测时间点(24,48,72h);克隆形成接种密度(500细胞/孔)及培养时间(14天);Transwell迁移细胞数(1×10^5)及培养时间(24h);周期和凋亡检测的转染时间(24h) 阅读提示:Methods: MTT assays, Cell colony formation, Migration assays, Cell cycle analysis, Apoptosis assay |
| Caspase活性检测 | Caspase-Glo® 3/7试剂盒使用步骤及转染时间(24h) 阅读提示:Methods: Caspase-3/7 activity |
| 免疫组织化学 | 组织芯片来源(HLivH180Su18, Outdo Biotech)、ERCC6L抗体稀释比(1:100)、染色评分标准 阅读提示:Methods: Immunohistochemistry (IHC) |
| 体内实验 | 动物品系(BALB/c裸鼠)、性别(雄性)、周龄(6周)、体重(18-20g)、细胞接种量(1×10^7/只)及分组(每组7只) 阅读提示:Methods: Xenografts tumor growth |
| 通路验证 | Western blot抗体种类及稀释比、deguelin处理浓度(5μM/L)和时间(4h) 阅读提示:Methods: Western blotting; Results: ERCC6L modulates HCC growth through PI3K/AKT and NF-κB signaling pathway |