建立化学遗传学模型
验证DREADDs系统能有效激活或抑制体内谷氨酸能神经元活动
通过CamKIIα-tTA;TRE-hM3Dq和CamKIIα-tTA;TRE-hM4Di小鼠表达DREADD,注射CNO后记录皮层和海马的局部场电位(LFP)和多动行为。
Neuronal Activity Regulates Blood-Brain Barrier Efflux Transport through Endothelial Circadian Genes.
包含体外化学遗传学、行为学范式、RNA-seq、药理学转运实验、基因敲除小鼠模型和体内功能验证,涵盖转录、蛋白及功能多个层面的验证。
小鼠模型 原代脑内皮细胞 FACS纯化的脑内皮细胞
使用hM3Dq激活和hM4Di沉默谷氨酸能神经元的小鼠模型,通过CNO给药(0.5mg/kg或1.0mg/kg)验证神经元活动对脑内皮基因表达的影响。 背景为C57BL/6的小鼠,实验在ZT23-ZT24进行CNO注射,3小时后收集组织。 通过FACS纯化CD31阳性脑内皮细胞进行RNA-seq分析,每组n=4或n=3。 使用Pgp底物罗丹明123(25mg/kg)和柔红霉素检测外排功能,并用钠荧光素和伊文思蓝作对照。 使用EC特异性Bmal1敲除小鼠(VECadherin-CreERT2; Bmal1fl/fl)和PAR bZip三基因敲除小鼠验证昼夜节律和外排功能。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证DREADDs系统能有效激活或抑制体内谷氨酸能神经元活动
通过CamKIIα-tTA;TRE-hM3Dq和CamKIIα-tTA;TRE-hM4Di小鼠表达DREADD,注射CNO后记录皮层和海马的局部场电位(LFP)和多动行为。
鉴定神经元活动调节的脑内皮基因
在DREADD小鼠注射CNO后3小时,FACS分选CD31+内皮细胞,进行RNA-seq分析。
探究神经元活动对外排转运体功能的影响
在DREADD小鼠中,注射Pgp底物罗丹明123或柔红霉素,检测脑和血中的荧光强度,并检测非底物钠荧光素的渗透性。
确认BBB外排转运存在昼夜节律,并受内皮昼夜钟调控
检测野生型小鼠在一天中ZT0、ZT12等时间点Abcb1a mRNA和Rh123通透性的变化,并分析PAR bZip三敲和EC-Bmal1敲除小鼠的相应变化。
证明内皮Bmal1和PAR bZip因子是神经活动调控外排转运所必需
在EC-Bmal1 cKO和对照小鼠中注射红藻氨酸(kainic acid)以模拟过度兴奋,测量脑内皮中Abcb1a的表达变化。
确认生理性神经元活动变化也能调节脑内皮基因表达
采用胡须刺激范式,比较有胡须和无胡须小鼠的桶状皮层中cFos表达和RNA-seq结果,并与DREADD实验对比。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组化 | 兔抗HA抗体 | Cell Signaling Technology | Cat. # 3724S |
| 山羊抗兔Alexa 594抗体 | ThermoFisher | Cat. # R37117 | |
| 山羊抗cFos抗体 | Santa Cruz Biotechnology | Cat. # sc-52-G | |
| 驴抗山羊Alexa 594抗体 | ThermoFisher | Cat. # A-11058 | |
| FACS分选 | 大鼠抗CD31-Alexa 647抗体 | Molecular Probes | Cat. # A14716 |
| 小鼠抗CD45-FITC抗体 | eBioscience | Cat. # 11-0451-85 | |
| 大鼠抗CD13-FITC抗体 | BD Pharmingen | Cat. # 558744 | |
| 大鼠抗CD11b-FITC抗体 | eBioscience | Cat. # 11-0112-81 | |
| 兔抗NG2-Alexa 488抗体 | Bioss | Cat. # bs-11192R-A488 | |
| DAPI | -- | -- | |
| 木瓜蛋白酶 | Worthington Biochemical | Cat. # LK003176 | |
| II型胶原酶 | Worthington Biochemical | Cat. # LS004176 | |
| 中性蛋白酶 | Worthington Biochemical | Cat. # LS02104 | |
| 髓鞘去除磁珠 | MACS Miltenyi Biotec | Cat. # 130-096-433 | |
| LS分离柱 | MACS Miltenyi Biotec | Cat. # 130-042-401 | |
| MidiMACS分离器 | MACS Miltenyi Biotec | Cat. # 130-042-302 | |
| 大鼠IgG | Sigma Aldrich | Cat. # I8015 | |
| RNA-seq | RNeasy Micro试剂盒 | Qiagen | Cat. # 74004 |
| TruSeq RNA文库制备试剂盒v2 | Illumina | Cat. # RS-122-2001 | |
| RT-qPCR | iScript逆转录预混液 | Bio-Rad | Cat. # 1708841 |
| SYBR Green预混液 | Applied Biosystems | Cat. # 4367659 | |
| Primetime qPCR引物 | Integrated DNA Technologies | -- | |
| 渗透实验 | 罗丹明123 | Sigma Aldrich | Cat. # 83702 |
| 柔红霉素 | Sigma Aldrich | Cat. # 30450 | |
| 钠荧光素 | Sigma Aldrich | Cat. # F6377 | |
| 伊文思蓝 | Sigma Aldrich | Cat. # E2129 | |
| 他立喹达 | ThermoFisher | Cat. # 501365577 | |
| 硼酸盐缓冲液, pH 11 | Sigma Aldrich | Cat. # 33650 | |
| ACK裂解缓冲液 | Quality Biological | Cat. # 118-156-101 | |
| 药物处理 | 氯氮平-N-氧化物 | Enzo | Cat. # BML NS105-0005 |
| 红藻氨酸 | Santa Cruz Biotechnology | Cat. # sc-200454 | |
| 电生理记录 | 32通道数字数据采集系统 | Neuralynx, Inc. | -- |
| 质谱分析 | Pgp肽段 | New England Peptide | -- |
| 免疫沉淀 | Pierce蛋白G磁珠 | ThermoFisher | Cat. # 88847 |
| 基因鉴定 | DirectPCR裂解液 | Viagen | Cat. # 102-T |
| 蛋白酶K | Viagen | Cat. # 501-PK | |
| 灌注固定 | D-PBS | Gibco | Cat. # 14190-144 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| DREADDs介导的神经元活动调控 | 小鼠品系:CamKIIα-tTA;TRE-hM3Dq(激活)和CamKIIα-tTA;TRE-hM4Di(沉默);CNO剂量:激活0.5mg/kg,沉默1.0mg/kg;注射时间:ZT23-ZT24;处理后3小时取材。 阅读提示:STAR Methods: Experimental Models and Subject Details, Method Details: FACS-purification of Brain Endothelial Cells |
| RNA-seq | 每组小鼠数量:激活和沉默每组n=4;DREADD实验使用雄鼠;测序平台:Illumina HiSeq4000,100bp配对末端;FACS分选:CD31阳性细胞。 阅读提示:STAR Methods: RNA-sequencing; 图2图例 |
| 外排功能检测 | 底物:罗丹明123(Pgp底物)和柔红霉素(Pgp底物);剂量:Rh123 25mg/kg;注射时间:CNO后2小时;检测时间:注射底物后1.75小时;对照组:Pgp抑制剂Tariquidar(10mg/kg)作为阳性对照;检测区域:皮层和海马;荧光测量:Tecan Infinite plate reader,激发/发射波长:Rh123 (505/560),DNR (470/585)。 阅读提示:STAR Methods: Rhodamine123 Permeability Assay, Daunorubicin Permeability Assay; 图4图例 |
| 昼夜节律实验 | 小鼠品系:野生型C57/BL6或PAR bZip三敲(及对照);ZT时间点:ZT0、ZT12等;基因表达检测:RT-qPCR,内参GAPDH;通透性:Rh123,剂量25mg/kg;节律性分析方法:BIC模型选择。 阅读提示:STAR Methods: RT-qPCR, Rhythmicity Analysis; 图5图例 |
| EC特异性Bmal1敲除 | 基因型:VECadherin-CreERT2; Bmal1fl/fl;诱导方式:5周龄小鼠连续3天腹腔注射他莫昔芬(100μl,20mg/ml);实验时间:注射后至少5周;对照组:Bmal1fl/fl同窝仔。 阅读提示:STAR Methods: Mouse Strains, Validation of Endothelial-Specific Bmal1 Knockout; 图5C图例 |
| 行为学实验(胡须刺激) | 小鼠:C57/BL6;分组:+Whisker(胡须完整,环境丰富)和-Whisker(胡须剪除,环境空旷);适应时间:7天称重、监测、接触,5天每日在空笼中探索30分钟;实验时间:3小时;分析区域:桶状皮层;cFos定量:每mm2细胞数。 阅读提示:STAR Methods: Barrel Cortex Activity Behavior Experiment; 图6图例 |