样本与细胞中circ_0020123表达检测
验证circ_0020123在NSCLC组织和细胞中的表达水平。
通过qRT-PCR检测30对NSCLC肿瘤组织和正常非癌组织,及NSCLC细胞(H1299、H1581、A549)和16HBE细胞中circ_0020123的表达。
Circ_0020123 Increases ZFX Expression to Facilitate Non-Small Cell Lung Cancer Progression by Sponging miR-142-3p.
包含qRT-PCR、CCK8、Transwell、双荧光素酶、RIP等体外功能实验,以及裸鼠移植瘤模型体内验证,并涉及机制验证(circ_0020123/miR-142-3p/ZFX轴)。
NSCLC细胞系H1299 NSCLC细胞系A549 NSCLC细胞系H1581 支气管上皮细胞16HBE BALB/c裸鼠皮下移植瘤模型
si-circ_0020123#1和si-circ_0020123#2有效敲低circ_0020123而不影响线性PDZD8表达 miR-142-3p inhibitor逆转si-circ_0020123对细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭的影响 miR-142-3p mimic和inhibitor的转染效率验证 si-ZFX#1和si-ZFX#2有效敲低ZFX 裸鼠皮下注射2×10^6 H1299细胞,4周后评估肿瘤体积和重量
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证circ_0020123在NSCLC组织和细胞中的表达水平。
通过qRT-PCR检测30对NSCLC肿瘤组织和正常非癌组织,及NSCLC细胞(H1299、H1581、A549)和16HBE细胞中circ_0020123的表达。
评估敲低circ_0020123对NSCLC细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭的影响。
使用si-circ_0020123#1/#2转染H1299和A549细胞,通过CCK8、集落形成、流式细胞术、Transwell实验及WB检测环蛋白D1、Bax、MMP-9蛋白水平。
验证circ_0020123是否直接结合并海绵吸附miR-142-3p。
通过双荧光素酶报告基因实验和RIP实验验证circ_0020123与miR-142-3p的结合,并检测NSCLC组织和细胞中miR-142-3p表达。
验证circ_0020123的功能是否依赖于miR-142-3p。
共转染si-circ_0020123#1和miR-142-3p抑制剂到H1299和A549细胞,检测细胞功能变化及miR-142-3p和蛋白表达。
验证miR-142-3p是否直接靶向ZFX。
使用双荧光素酶报告基因实验验证结合,检测NSCLC组织和细胞中ZFX表达,及miR-142-3p mimic/inhibitor对ZFX蛋白的影响。
评估ZFX在NSCLC细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭中的作用。
使用si-ZFX#1/#2转染H1299和A549细胞,通过CCK8、集落形成、流式细胞术、Transwell实验及WB检测相关蛋白。
验证miR-142-3p是否通过ZFX调控NSCLC进展。
共转染in-miR-142-3p和si-ZFX#1到H1299和A549细胞,检测细胞功能及ZFX表达。
验证circ_0020123对ZFX的调控依赖于miR-142-3p。
共转染si-circ_0020123#1和in-miR-142-3p,检测ZFX mRNA和蛋白表达。
在体内验证circ_0020123敲低对NSCLC肿瘤生长的影响。
将转染sh-circ_0020123或sh-NC的H1299细胞皮下注射到裸鼠,每周测量肿瘤体积,4周后取瘤称重,并检测肿瘤组织中circ_0020123、miR-142-3p和ZFX表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 3000试剂 | Invitrogen | -- |
| RNA提取 | RNeasy Mini试剂盒 | Qiagen | -- |
| 逆转录 | M-MLV逆转录酶试剂盒 | Invitrogen | -- |
| qRT-PCR | SYBR GreenER qPCR SuperMix Universal | Invitrogen | -- |
| 集落形成实验 | 结晶紫溶液 | Beyotime | -- |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC凋亡检测试剂盒 | Sigma-Aldrich | -- |
| 迁移和侵袭实验 | Transwell小室 | Millipore | -- |
| 侵袭实验 | 基质胶 | -- | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| 抗Cyclin D1抗体 | Bioss | bs-20596R | |
| 抗Bax抗体 | Bioss | bs-28034R | |
| 抗MMP-9抗体 | Bioss | bs-4593R | |
| 抗ZFX抗体 | Bioss | bs-12306R | |
| 抗GAPDH抗体 | Bioss | bs-2188R | |
| 羊抗兔IgG | Bioss | bs-0295G | |
| BeyoECL Star ECL化学发光试剂盒 | Beyotime | -- | |
| 双荧光素酶报告基因实验 | pmirGLO载体 | Promega | -- |
| 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | -- | |
| RIP实验 | Magna RIP RNA结合蛋白免疫沉淀试剂盒 | Millipore | -- |
| 磁珠蛋白A/G | -- | -- | |
| 统计分析 | Graphpad Prism软件 | GraphPad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 样本收集 | 配对肿瘤和正常组织数量:30对;组织来源:惠州市中心人民医院手术患者;伦理批准。 阅读提示:见Materials and Methods中的Samples Collection |
| 细胞培养 | 细胞系:H1299、H1581、A549(ATCC),16HBE(Procell);培养基:RPMI-1640(Gibco)含10% FBS和1%青霉素-链霉素;培养条件:37°C,5% CO2。 阅读提示:见Materials and Methods中的Cell Culture and Transfection |
| 细胞转染 | siRNA序列、miRNA mimics/inhibitors、转染试剂Lipofectamine 3000(Invitrogen)、转染浓度:50 nM。 阅读提示:见Materials and Methods中的Cell Culture and Transfection |
| qRT-PCR | 内参GAPDH和U6;引物序列;2^-ΔΔCT方法。 阅读提示:见Materials and Methods中的Quantitative Real-Time PCR |
| 细胞增殖分析 | CCK8实验:1000细胞/孔;集落形成实验:150细胞/孔,培养14天。 阅读提示:见Materials and Methods中的Cell Proliferation Analysis |
| 凋亡分析 | 凋亡试剂盒:Annexin V-FITC(Sigma-Aldrich);染色15分钟;流式细胞术。 阅读提示:见Materials and Methods中的Cell Apoptosis Analysis |
| 迁移和侵袭分析 | Transwell小室(Millipore);侵袭时预包被Matrigel;迁移不包被;迁移/侵袭时间:24小时。 阅读提示:见Materials and Methods中的Cell Migration and Invasion Analysis |
| Western blot | 抗体稀释比例:Cyclin D1 (1:2000),Bax (1:1000),MMP-9 (1:2000),ZFX (1:1000),GAPDH (1:1000);二抗稀释比例:1:20000。 阅读提示:见Materials and Methods中的Western Blot |
| 双荧光素酶报告基因实验 | 载体:pmirGLO;转染时间:48小时;转染组合:报道载体+miR-142-3p mimic或miR-NC。 阅读提示:见Materials and Methods中的Dual-Luciferase Reporter Assay |
| RIP实验 | 使用Magna RIP试剂盒;抗体:anti-Ago2或anti-IgG;随后qRT-PCR检测circ_0020123和miR-142-3p。 阅读提示:见Materials and Methods中的RNA Immunoprecipitation Assay |
| 动物实验 | 动物品系:BALB/c裸鼠(雄性);数量:10只,每组5只;注射细胞数:2×10^6 H1299细胞;观察时间:4周。 阅读提示:见Materials and Methods中的Mice Xenograft Models |