检测miR-449a-5p表达模式
观察miR-449a-5p在小鼠心脏发育和心肌细胞中的表达变化。
收集E16.5、P1、P7、P28、P56小鼠心室组织及P1、P4、P7分离的心肌细胞,用RT-qPCR检测miR-449a-5p表达,并用FISH检测其亚细胞定位。
miR‑449a‑5p suppresses CDK6 expression to inhibit cardiomyocyte proliferation.
包含体外细胞实验(过表达/敲低、靶基因验证、功能恢复)和相关性分析,但缺乏体内实验验证。
新生小鼠原代心肌细胞(P1) 小鼠心室组织(胚胎及出生后各阶段)
心肌细胞分离自C57BL/6J小鼠P1代,采用差速贴壁法纯化 miR-449a-5p mimic和inhibitor转染浓度为50 nM,转染后48小时检测 CDK6过表达质粒pcDNA-CDK6转染浓度为50 nM 用ki67和pH3免疫荧光染色评估心肌细胞增殖,每组至少3次独立重复 荧光素酶报告基因实验验证miR-449a-5p与CDK6 3'UTR直接结合
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
观察miR-449a-5p在小鼠心脏发育和心肌细胞中的表达变化。
收集E16.5、P1、P7、P28、P56小鼠心室组织及P1、P4、P7分离的心肌细胞,用RT-qPCR检测miR-449a-5p表达,并用FISH检测其亚细胞定位。
验证miR-449a-5p过表达对心肌细胞增殖的影响。
用miR-449a-5p mimic转染分离的P1心肌细胞,通过免疫荧光检测ki67和pH3阳性细胞比例,并计数细胞数。
验证miR-449a-5p敲低对心肌细胞增殖的影响。
用miR-449a-5p inhibitor转染P1心肌细胞,检测ki67和pH3阳性细胞比例及细胞数。
验证CDK6是否为miR-449a-5p的直接靶基因。
用miRmap和miRanda预测靶标,构建CDK6 3'UTR野生型和突变型荧光素酶报告载体,共转染心肌细胞,检测荧光素酶活性;并检测miR-449a-5p过表达或敲低后CDK6 mRNA和蛋白表达变化。
验证CDK6过表达对心肌细胞增殖的影响,并验证其介导miR-449a-5p的功能。
用pcDNA-CDK6转染P1心肌细胞,检测CDK6 mRNA和蛋白表达及ki67阳性细胞比例;并共转染miR-449a-5p mimic和pcDNA-CDK6,检测ki67阳性细胞比例。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12 1:1培养基 | HyClone, Cytiva | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 胰蛋白酶 | Gibco | -- | |
| II型胶原酶 | Gibco | -- | |
| 转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| Opti-MEM培养基 | Gibco | -- | |
| RNA提取 | E.Z.N.A.总RNA提取试剂盒II | Omega Bio-Tek | -- |
| RNeasy Midi试剂盒 | Qiagen | -- | |
| RT-qPCR | PrimeScript RT预混液 | Takara | -- |
| SYBR Premix Ex Taq试剂盒 | Takara | -- | |
| miRNA第一链cDNA合成和miRNA定量PCR试剂盒 | Sangon Biotech | -- | |
| 免疫荧光 | DAPI | Bestbio | -- |
| Hoechst 33342 | Bioworld Technology | -- | |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解液 | Beijing Dingguo Changsheng Biotechnology | -- |
| 蛋白质定量 | BCA蛋白定量分析试剂盒 | Fudebio-tech | -- |
| 免疫荧光 | 抗cTnT抗体 | Abcam | ab8295 |
| 抗ki67抗体 | Abcam | ab15580 | |
| 抗pH3抗体 | Abcam | ab47297 | |
| 山羊抗小鼠IgG/Alexa Fluor 488二抗 | Beijing Biosynthesis Biotechnology | bs-0296G-A488 | |
| 山羊抗兔IgG/Alexa Fluor 555二抗 | Beijing Biosynthesis Biotechnology | bs-0295G-A555 | |
| Western blotting | 抗CDK6抗体 | Cell Signaling Technology | 3136 |
| 抗β-actin抗体 | Beijing Biosynthesis Biotechnology | bs-0061R | |
| 驴抗小鼠IgG H&L二抗 | Abcam | ab6820 | |
| 驴抗兔IgG H&L二抗 | Abcam | ab16284 | |
| 荧光素酶报告实验 | psiCHECK-2载体 | SaichengBio | -- |
| 荧光素酶报告系统 | Promega | -- | |
| 动物实验 | C57BL/6J小鼠 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 心肌细胞分离和培养 | 心肌细胞分离自P1、P4、P7小鼠,采用0.25%胰蛋白酶4°C过夜消化,再用II型胶原酶和BSA消化;差速贴壁法纯化。 阅读提示:Materials and methods: Ventricular CM and cardiac fibroblast isolation |
| 转染条件 | mimic、inhibitor和质粒浓度为50 nM,使用Lipofectamine 2000,转染后6小时换液,48小时后检测。 阅读提示:Materials and methods: Transfection of plasmids, miRNA mimics and inhibitors |
| 增殖检测 | ki67和pH3免疫荧光染色,cTnT标记心肌细胞,Hoechst 33342染核,每组n=3,随机选择4个视野。 阅读提示:Materials and methods: Immunofluorescence analysis; Results 2 and 3 |
| 靶基因验证 | 荧光素酶报告实验使用psiCHECK-2载体包含CDK6 3'UTR野生型或突变体,共转染miR-449a-5p mimic和质粒,检测荧光素酶活性。 阅读提示:Materials and methods: Luciferase reporter assay; Results 4 |
| 蛋白检测 | Western blot使用30 µg蛋白,SDS-PAGE分离,CDK6抗体(CST, 1:2,000),β-actin内参。 阅读提示:Materials and methods: Western blotting |