临床样本收集与病理特征分析
评估EOC组织中Gli1、Gli2和NANOG的表达,并分析其与临床病理特征(分期、耐药、预后)的关联。
收集61例EOC患者肿瘤组织,通过免疫组化检测蛋白表达,结合临床数据统计分析。
Gli affects the stemness and prognosis of epithelial ovarian cancer via homeobox protein NANOG.
包含临床组织样本免疫组化分析、SKOV3细胞系体外功能实验(增殖、集落形成、顺铂敏感性)及药物处理后的分子检测,但缺少体内动物模型和类器官验证。
上皮性卵巢癌肿瘤组织(61例) SKOV3细胞系
临床样本中Gli1、Gli2和NANOG表达与铂耐药及分期的关联 GANT61(50 μmol/l)处理对SKOV3细胞增殖、集落形成和顺铂敏感性的影响 GANT61处理后Gli1、Gli2、NANOG和MDR1表达变化 SHH(1000 ng/ml)处理对SKOV3细胞基因表达和功能的影响 细胞培养条件:RPMI-1640、10% FBS、37°C、5% CO2
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估EOC组织中Gli1、Gli2和NANOG的表达,并分析其与临床病理特征(分期、耐药、预后)的关联。
收集61例EOC患者肿瘤组织,通过免疫组化检测蛋白表达,结合临床数据统计分析。
建立体外细胞模型,通过激动或抑制HH信号通路,观察Gli、NANOG表达变化。
SKOV3细胞用SHH(1000 ng/ml)激活HH通路,或用GANT61(50 μmol/l)抑制Gli,处理24小时后检测基因和蛋白表达。
观察抑制Gli对卵巢癌细胞增殖能力的影响。
通过CCK-8实验检测不同浓度GANT61处理下SKOV3细胞在24、48、72小时的增殖情况。
评估抑制Gli对卵巢癌细胞集落形成能力(干性特征之一)的影响。
SKOV3细胞经GANT61处理后,以1000细胞/孔接种于6孔板,培养1-2周,染色计数集落。
评估抑制Gli对卵巢癌细胞铂耐药的影响。
经GANT61或SHH处理后的SKOV3细胞分别加入不同浓度顺铂,用CCK-8法测定IC50。
评估Gli和NANOG表达对患者生存预后的影响。
利用Kaplan-Meier和Cox回归分析比较不同表达组患者的生存时间。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| 胎牛血清 | Zeta-Life, Inc. | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 0.25%胰蛋白酶 | -- | -- | |
| 药物处理 | 重组人Sonic Hedgehog蛋白 | PeproTech, Inc. | -- |
| GANT61 | Selleck Chemicals | -- | |
| RNA提取与RT-qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen; Thermo Fisher Scientific, Inc. | 15596026 |
| PrimeScript RT试剂盒(含gDNA Eraser) | Takara Bio, Inc. | -- | |
| TB Green Premix Ex Taq II | Takara Bio, Inc. | -- | |
| Western blotting | RIPA裂解液 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | 89900 |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Pierce; Thermo Fisher Scientific, Inc. | 23225 | |
| 硝酸纤维素膜 | EMD Millipore | IPVH00010 | |
| X光胶片 | Kodak | -- | |
| 爱普生扫描仪(Epson V300 Photo) | Epson America, Inc. | -- | |
| 免疫组织化学 | 10%福尔马林 | -- | -- |
| 柠檬酸盐缓冲液(pH 6.0) | -- | -- | |
| 磷酸盐缓冲液(pH 7.4) | -- | -- | |
| 3%过氧化氢溶液 | -- | -- | |
| 5%山羊血清 | Wuhan Servicebio Technology Co., Ltd. | -- | |
| 抗Gli1抗体 | Abcam | ab151796 | |
| 抗Gli2抗体 | ProteinTech Group, Inc. | 18989-1-AP | |
| 抗NANOG抗体 | Abcam | ab109250 | |
| 辣根过氧化物酶标记的山羊抗兔二抗 | Wuhan Servicebio Technology Co., Ltd. | GB23303 | |
| 辣根标记的链霉亲和素-亲和素工作液 | -- | -- | |
| Western blotting | 抗MDR1抗体 | BIOSS | BS-1468R |
| 小鼠单克隆抗β肌动蛋白抗体 | Wuhan Servicebio Technology Co., Ltd. | GB12001 | |
| 辣根过氧化物酶标记的抗小鼠二抗 | Wuhan Servicebio Technology Co., Ltd. | GB23301 | |
| 细胞增殖检测 | CCK-8试剂盒 | Zeta-Life, Inc. | -- |
| 集落形成实验 | 10%吉姆萨染液 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本分析 | 样本数量(61例)、铂耐药定义(6个月内复发)、由两名独立观察者进行免疫组化评分(Remmele和Stegner法)。 阅读提示:Materials and methods: Specimen and clinical data collection, Immunohistochemistry; Table I-III |
| 细胞培养 | SKOV3细胞密度(2-5×10^5/ml)、培养基(RPMI-1640+10% FBS)、培养条件(37°C、5% CO2)、传代方法(0.25%胰蛋白酶-EDTA)。 阅读提示:Materials and methods: Cell culture |
| 药物处理 | SHH浓度(1000 ng/ml)、GANT61浓度(50 μmol/l)、处理时间(24小时)。 阅读提示:Materials and methods: Cell culture |
| 细胞增殖检测 | 细胞密度(2-5×10^4/ml)、GANT61浓度(20、50、100 μmol/l)、检测时间点(24、48、72小时)。 阅读提示:Materials and methods: Proliferation assay; Figure 4 |
| 集落形成实验 | 细胞密度(2-5×10^5/ml)、GANT61浓度(50 μmol/l)、接种密度(1×10^3细胞/孔)、培养时间(1-2周)。 阅读提示:Materials and methods: Colony formation assay; Figure 5 |
| 顺铂敏感性检测 | 预处理条件(1,000 ng/ml SHH或50 μmol/l GANT61处理24小时)、顺铂浓度梯度(0.1-4.0 μg/ml)、检测时间点(24、48、72小时)。 阅读提示:Materials and methods: Determination of the IC50 of cisplatin in SKOV3 cells; Figure 6 |
| 基因表达检测 | RNA提取(TRIzol)、RT-qPCR引物序列(Gli1、Gli2、NANOG、MDR1、GAPDH)、Western blot抗体(Gli1、Gli2、NANOG、MDR1、β-actin)及稀释比例。 阅读提示:Materials and methods: RT-qPCR, Western blotting; Figure 3 |