临床样本关联分析
验证ZG16表达与结直肠癌临床病理特征及PD-L1表达的相关性
对56例结直肠癌患者肿瘤组织进行IHC和qPCR分析,评估ZG16表达与远处转移、淋巴管浸润及PD-L1表达的关系。
ZG16 regulates PD-L1 expression and promotes local immunity in colon cancer.
包含患者样本IHC/qPCR分析、细胞系功能验证(PD-L1蛋白检测)、NK细胞共培养及ELISA、动物移植瘤模型,且有体内外相互验证。
SW480细胞 HCT116细胞 NK细胞共培养体系 SW480异种移植瘤裸鼠模型
ZG16与PD-L1在患者CRC组织中的表达相关性(IHC/qPCR) ZG16过表达对SW480和HCT116细胞中PD-L1蛋白水平的影响(Western blot) ZG16过表达对NK细胞存活和增殖的影响(CCK8、CellTrace) NK细胞增殖对NKG2D表达的依赖性(ELISA) ZG16过表达对SW480异种移植瘤生长的抑制效果(体内实验)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证ZG16表达与结直肠癌临床病理特征及PD-L1表达的相关性
对56例结直肠癌患者肿瘤组织进行IHC和qPCR分析,评估ZG16表达与远处转移、淋巴管浸润及PD-L1表达的关系。
验证ZG16过表达对PD-L1表达的调控作用
在SW480和HCT116细胞中过表达ZG16,检测PD-L1蛋白和mRNA水平。
验证ZG16过表达对NK细胞存活和增殖的影响
将NK细胞与ZG16过表达的SW480细胞或其培养基共培养,检测NK细胞增殖。
验证ZG16诱导的NK细胞增殖是否依赖于NKG2D
通过ELISA检测共培养后NK细胞中NKG2D蛋白水平。
验证ZG16过表达对体内肿瘤生长的抑制作用
将SW480-ZG16或对照细胞皮下接种裸鼠,监测肿瘤生长。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 慢病毒包装 | pVSVg质粒 | Addgene | 8584 |
| psPAX2质粒 | Addgene | 12260 | |
| 慢病毒转染 | 嘌呤霉素 | Sigma-Aldrich | -- |
| Western blot | 抗PD-L1抗体 | Proteintech | 17952-1-AP |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | 100242-MM05 | |
| Immobilon-P硝酸纤维素膜 | Millipore | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK8试剂 | Dojindo Molecular Technologies | -- |
| NK细胞扩增 | Ficoll-Paque分离液 | GE Healthcare Life Sciences | -- |
| BINKIT试剂盒 | Biotherapy Institute of Japan | -- | |
| OK-432 | Chugai Pharmaceutical Co., Ltd. | -- | |
| 重组人白细胞介素-2 | Kexin biotechnology Corp | -- | |
| 流式细胞术 | CellTrace紫荧光染料 | -- | -- |
| ELISA | NKG2D ELISA试剂盒 | Cusabio | -- |
| qPCR | RNeasy FFPE试剂盒 | QIAGEN | -- |
| SuperScript VILO预混液 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| Power SYBR Green PCR预混液 | Applied Biosystems | -- | |
| IHC | PD-L1抗体(SP142) | Spring Bio-science | -- |
| NKG2D抗体 | Bioss | bs-0938R | |
| 动物实验 | BD Matrigel基底膜基质 | Corning | 356231 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本分析 | ZG16表达与PD-L1表达的相关性,样本量56例,MSI状态,临床分期 阅读提示:见Methods中的Patients和Results部分,以及Figure 1 |
| 细胞培养与ZG16过表达 | SW480和HCT116细胞系来源,过表达载体构建,转染剂量和时间,筛选浓度 阅读提示:见Methods中的Cell culture和Vectors and lentivirus production |
| Western blot | 蛋白上样量,抗体稀释比例,封闭条件 阅读提示:见Methods中的Western blot analysis |
| NK细胞共培养 | NK细胞来源,共培养比例,时间点,检测方法(CCK8,CellTrace) 阅读提示:见Methods中的NK cell co-culture and proliferation和Flow cytometry |
| 动物实验 | 动物品系(裸鼠),每组数量,接种细胞数,观察时间 阅读提示:见Methods中的In vivo mouse study和Results部分 |