卒中模型建立及PARP14表达分析
探究卒中后PARP14的表达变化及其与ADP-核糖基化的关系
建立光血栓性卒中(PT)小鼠模型,在术后第1、3、7、14天检测梗死周围区PAR水平和PARP14表达(Western blot、qPCR、免疫荧光)。
PARP14 inhibits microglial activation via LPAR5 to promote post-stroke functional recovery.
包含体内PT小鼠模型(基因敲低、药理抑制、过表达)和体外OGD处理的小胶质细胞模型,结合行为学、梗死体积、免疫印迹、ELISA、免疫荧光、RNA测序及自噬通量检测,进行功能与机制验证。
光血栓性卒中(PT)小鼠模型 原代小鼠小胶质细胞 BV-2小胶质细胞系
PARP14表达水平在PT后梗死周围区升高 PARP14敲低或抑制加重功能损伤和梗死体积 PARP14过表达改善功能恢复和减小梗死体积 PARP14调节小胶质细胞自噬(MAP1LC3B-II和SQSTM1水平) PARP14通过下调LPAR5抑制小胶质细胞活化
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究卒中后PARP14的表达变化及其与ADP-核糖基化的关系
建立光血栓性卒中(PT)小鼠模型,在术后第1、3、7、14天检测梗死周围区PAR水平和PARP14表达(Western blot、qPCR、免疫荧光)。
验证PARP14在卒中后功能恢复和梗死体积中的作用
通过立体定位注射慢病毒(shRNA-Parp14或LV-Parp14)到小鼠皮层,在术前指定时间点注射,然后进行行为学测试和梗死体积测量。
验证PARP14抑制剂H10对功能恢复和炎症的影响
在PT术后2小时向梗死周围皮层注射H10(1 μmol/L或10 μmol/L),进行行为学测试、梗死体积测量和炎症相关蛋白/细胞因子检测。
确认PARP14调节小胶质细胞活化的直接作用
使用原代小鼠小胶质细胞和BV-2细胞,进行OGD处理,并通过敲低或过表达PARP14检测NOS2等活化标志物的表达。
探究PARP14是否通过调节自噬影响小胶质细胞活化
检测OGD处理下MAP1LC3B-II和SQSTM1水平变化,使用mRFP-GFP-MAP1LC3B腺病毒评估自噬流,并用雷帕霉素和3-MA验证自噬对NOS2表达的影响。
鉴定PARP14调控的下游基因,揭示其抑制小胶质细胞活化的机制
对PARP14过表达的原代小胶质细胞进行RNA测序(OGD处理),筛选差异表达基因,并进行qPCR验证。
验证LPAR5是否为PARP14的关键下游靶点,影响小胶质细胞活化
在OGD处理的原代小胶质细胞中,通过siRNA敲低Lpar5,检测NOS2表达;同时检测PT小鼠中H10对LPAR5表达的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 玫瑰红 | Sigma Aldrich | 330000 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 胰蛋白酶-EDTA | Gibco | 25200056 | |
| Neurobasal培养基 | Gibco | 21103049 | |
| GlutaMAX添加剂 | Gibco | 35050061 | |
| B27添加剂 | Gibco | 17504044 | |
| 粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子 | -- | -- | |
| 免疫染色 | 曲拉通X-100 | Aladdin | T109027 |
| 山羊血清 | ZSGB-BIO | ZLI-0956 | |
| 抗PARP14抗体 | Sigma Aldrich | HPA012063 | |
| 抗GFAP抗体 | Sigma Aldrich | G3893 | |
| 抗RBFOX3抗体 | Abcam | AB104224 | |
| 抗AIF1抗体 | Wako | 019-19741 | |
| 抗MAP1LC3B抗体 | Sigma Aldrich | L7543 | |
| Alexa Fluor 594山羊抗兔IgG | Invitrogen | A-11037 | |
| Alexa Fluor 488山羊抗兔IgG | Invitrogen | A-11034 | |
| Alexa Fluor 594山羊抗小鼠IgG | Invitrogen | A-11005 | |
| Alexa Fluor 488山羊抗小鼠IgG | Invitrogen | A-11029 | |
| Alexa Fluor 488偶联亲和纯化F(ab)片段山羊抗兔IgG(H+L) | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 111-547-003 | |
| Western blot | 抗NOS2抗体 | Proteintech group | 18985-1-AP |
| 抗PAR抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-56198 | |
| 抗SQSTM1抗体 | Proteintech group | 18420-1-AP | |
| 抗LPAR5抗体 | Bioss | bs-15366R | |
| 抗Flag抗体 | Sigma Aldrich | F3165 | |
| 抗ACTB/β-肌动蛋白抗体 | Proteintech group | 60008-1-Ig | |
| 辣根过氧化物酶标记的山羊抗兔IgG | Cell Signaling Technology | 7074P2 | |
| 辣根过氧化物酶标记的山羊抗小鼠IgG | Cell Signaling Technology | 7076P2 | |
| qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596026 |
| HiScript Q Select RT SuperMix试剂盒 | Vazyme | R123-01 | |
| AceQ qPCR SYBR Green预混液 | Vazyme | R141-02 | |
| ELISA | 小鼠TNF ELISA试剂盒 | Nanjing Jin Yibai Biological Technology Co. Ltd. | JEB-12474 |
| 小鼠IL1B ELISA试剂盒 | Nanjing Jin Yibai Biological Technology Co. Ltd. | JEB-12787 | |
| 小鼠IL6 ELISA试剂盒 | Nanjing Jin Yibai Biological Technology Co. Ltd. | JEB-12267 | |
| 药理干预 | H10 | 中国药科大学江苏省药物设计与优化重点实验室合成 | -- |
| 雷帕霉素 | Sigma Aldrich | R0395 | |
| 3-甲基腺嘌呤 | Sigma Aldrich | M9281 | |
| 自噬流检测 | mRFP-GFP-MAP1LC3B腺病毒 | HanBio | HB-AP2100001 |
| 基因操作 | 慢病毒载体(shRNA-Parp14,shRNA-Con) | GeneChem Co, Ltd | -- |
| 慢病毒载体(LV-Parp14,LV-Con) | BrainVTA | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 卒中模型诱导 | 光血栓性卒中(PT)模型的具体参数:Rose Bengal剂量(30 mg/kg,i.v.)、光照强度(12,000 lux)和光照时间(5分钟) 阅读提示:Materials and Methods: Photothrombotic stroke (PT) |
| 慢病毒注射 | 慢病毒注射的时间点(shRNA-Parp14在术前3天,LV-Parp14在术前4天)和立体定位坐标(AP: 0 mm, ML: 1.5 mm, DV: 1.3 mm) 阅读提示:Materials and Methods: Lentiviral vector construction and stereotaxic injection |
| 药理抑制 | PARP14抑制剂H10的剂量(1 μmol/L或10 μmol/L)、给药时间(PT术后2小时)和给药途径(颅内注射) 阅读提示:Figure 3 legend 和 Materials and Methods: Reagents |
| 行为学测试 | 行为学测试的时间点(基线及术后第3、7、14天)和具体参数(网格大小、圆筒尺寸、粘纸面积等) 阅读提示:Materials and Methods: Grid-walking task, Cylinder task, Adhesive removal test |
| 体外OGD模型 | OGD处理时间(6小时或12小时)、氧气剥夺条件(5% CO2和95% N2)以及细胞类型(原代小胶质细胞或BV-2细胞) 阅读提示:Materials and Methods: OGD treatment |
| 自噬检测 | mRFP-GFP-MAP1LC3B腺病毒感染及氯喹(CQ)处理浓度和时间,自噬流定量方法 阅读提示:Figure 8 legend 和 Materials and Methods: Cell cultures |
| Western blot 分析 | 使用的抗体及其稀释比例(如anti-NOS2 1:1000等) 阅读提示:Materials and Methods: Western blot analysis |
| qPCR分析 | 引物序列(见表S1) 阅读提示:Supplemental Table S1 |