评估TSN对MKN-45细胞增殖和细胞周期的影响
确定TSN是否抑制胃癌细胞增殖并影响细胞周期分布。
使用CCK-8 assay检测不同浓度TSN处理后细胞的存活率,使用流式细胞术分析细胞周期。
Toosendanin induces apoptosis of MKN‑45 human gastric cancer cells partly through miR‑23a‑3p‑mediated downregulation of BCL2.
包含细胞系模型(MKN-45、293T)的体外实验,涵盖增殖、凋亡、细胞周期、靶基因验证(双荧光素酶)和机制研究,但缺乏动物模型或患者样本等体内证据。
人胃癌细胞系MKN-45 人胚胎肾细胞系293T
TSN处理浓度:0、60、80、100 nmol/L,处理48小时 细胞转染:pcDNA3.1(+)-miR-23a-3p(2 µg/ml)或miR-23a-3p inhibitor(1.0×10^-4 mmol/L) 转染试剂:Lipofectamine 2000 双荧光素酶报告实验:293T细胞,共转染psiCHECK-2-BCL2-wt或mu 统计方法:one-way ANOVA followed by Tukey's post hoc test,P<0.05
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定TSN是否抑制胃癌细胞增殖并影响细胞周期分布。
使用CCK-8 assay检测不同浓度TSN处理后细胞的存活率,使用流式细胞术分析细胞周期。
确定TSN是否诱导细胞凋亡并改变凋亡相关基因的表达。
使用吖啶橙染色观察核形态变化,使用annexin V-FITC/PI双染流式细胞术检测早期凋亡率,RT-qPCR和Western blot检测凋亡相关基因表达。
验证miR-23a-3p是否直接靶向BCL2 3'-UTR。
通过TargetScan预测miRNAs,使用双荧光素酶报告实验验证miR-23a-3p与BCL2 3'-UTR的结合,并检测过表达或抑制miR-23a-3p后BCL2的表达。
确定miR-23a-3p是否诱导细胞凋亡和线粒体膜电位变化。
在MKN-45细胞中过表达或抑制miR-23a-3p,通过吖啶橙染色观察核形态,annexin V-FITC/PI染色检测凋亡,JC-1染色检测线粒体膜电位。
确定miR-23a-3p是否影响细胞周期分布。
在MKN-45细胞中过表达或抑制miR-23a-3p,通过PI单染流式细胞术分析细胞周期。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| DMEM培养基 | Gibco; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| 胎牛血清 | Biological Industries | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 药物处理 | 川楝素 | -- | -- |
| 氟尿嘧啶 | -- | -- | |
| 转染 | pcDNA3.1(+)载体 | Promega Corporation | -- |
| pcDNA3.1(+)-miR-23a-3p过表达质粒 | -- | -- | |
| miR-23a-3p抑制剂 | Guangzhou RiboBio Co., Ltd. | -- | |
| miR-23a-3p抑制剂阴性对照 | Guangzhou RiboBio Co., Ltd. | -- | |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| 细胞增殖检测 | CCK-8试剂盒 | Beyotime Institute of Biotechnology | -- |
| Spark 10M多功能酶标仪 | Tecan Group, Ltd. | -- | |
| 质粒构建 | 基因组DNA提取试剂盒 | BioTeke Corporation | -- |
| 快速PCR扩增试剂盒 | BioTeke Corporation | -- | |
| psiCHECK-2载体 | Promega Corporation | -- | |
| 细胞核染色 | 吖啶橙 | Beijing Dingguo Changsheng Biotechnology Co., Ltd. | -- |
| Leica TCS SP8共聚焦激光扫描显微镜 | Leica Microsystems GmbH | -- | |
| 细胞周期分析 | 碘化丙啶 | -- | -- |
| Cytomics FC 500流式细胞仪 | Beckman Coulter, Inc. | -- | |
| 凋亡检测 | 膜联蛋白V-FITC | -- | -- |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1染料 | Nanjing KGI Biological Technology Development Co., Ltd. | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| RNA定量 | NanoDrop 2000C分光光度计 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| cDNA合成 | TransScript一步法gDNA去除和cDNA合成预混液 | Beijing TransGen Biotech Co., Ltd | -- |
| qPCR | 2X Plus SYBR实时PCR预混液 | BioTeke Corporation | -- |
| Western blot | RIPA裂解缓冲液 | -- | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Beyotime Institute of Biotechnology | -- | |
| BCA蛋白检测试剂盒 | Beyotime Institute of Biotechnology | -- | |
| 聚偏二氟乙烯膜 | EMD Millipore | -- | |
| 抗BCL2多克隆抗体 | Abcam | ab196495 | |
| 抗Bax多克隆抗体 | Abcam | ab53154 | |
| 抗活化caspase-3单克隆抗体 | BIOSS | bsm-33284M | |
| 抗caspase-8多克隆抗体 | BIOSS | bs-0052R | |
| 抗caspase-9多克隆抗体 | BIOSS | bs-0049R | |
| 抗细胞色素c多克隆抗体 | BIOSS | bs-0013R | |
| 抗Fas多克隆抗体 | BIOSS | bs-6477R | |
| 抗凋亡蛋白酶激活因子1多克隆抗体 | Abcam | ab2000 | |
| 抗β-肌动蛋白多克隆抗体 | Abcam | ab8227 | |
| IRDye 800CW山羊抗兔二抗 | LI-COR Biosciences | 926-32211 | |
| IRDye 800CW山羊抗小鼠二抗 | LI-COR Biosciences | 32210 | |
| Li-COR Odyssey红外成像系统 | Li-COR Biosciences | -- | |
| 双荧光素酶报告实验 | 荧光素酶报告实验系统 | Promega Corporation | -- |
| 被动裂解缓冲液 | Promega Corporation | -- | |
| GloMax 20/20发光检测仪 | Promega Corporation | -- | |
| 细胞培养 | 24孔板 | Corning, Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | MKN-45细胞培养条件:RPMI-1640培养基,10%胎牛血清,100 µg/ml链霉素,100 U/ml青霉素,37°C,5% CO2;293T细胞培养条件:DMEM培养基,相同补充物。 阅读提示:Materials and methods, Cell culture |
| 药物处理 | TSN浓度(0, 60, 80, 100 nM)和5-FU浓度(80 nM)处理48小时;对照为0 nM TSN。 阅读提示:Materials and methods, Cell culture; Results |
| 转染实验 | 转染质粒或抑制剂浓度:pcDNA3.1(+)或pcDNA3.1(+)-miR-23a-3p(2 µg/ml),miR-23a-3p inhibitor或NC(1.0×10^-4 mmol/L),使用Lipofectamine 2000,转染后培养48小时。 阅读提示:Materials and methods, Cell culture |
| 细胞增殖检测 | CCK-8实验:1×10^5细胞/ml,96孔板,每组三个重复,处理24、48、72小时,检测波长450 nm。 阅读提示:Materials and methods, CCK-8 assay; Figure 1A |
| 细胞周期分析 | 细胞处理48小时,PI染色,流式细胞仪分析。 阅读提示:Materials and methods, Cell cycle analysis |
| 凋亡检测 | annexin V-FITC和PI双染,流式细胞仪检测早期凋亡率。 阅读提示:Materials and methods, Apoptosis assay |
| 双荧光素酶报告实验 | 293T细胞共转染psiCHECK-2-BCL2-wt或mu与miR-23a-3p过表达或抑制载体,转染48小时后检测荧光素酶活性。 阅读提示:Materials and methods, Dual-luciferase reporter assay; Results |