临床样本检测
检测SAH患者CSF中AIM2水平,评估其与SAH的关系。
收集SAH患者(n=24)和对照(n=10)CSF样本,通过Western blot检测AIM2水平,并按Hunt-Hess分级比较。
Inhibition of AIM2 inflammasome activation alleviates GSDMD-induced pyroptosis in early brain injury after subarachnoid haemorrhage.
包含患者CSF样本分析、小鼠SAH模型、原代皮层神经元体外模型、慢病毒敲低功能验证及焦亡形态学检测,多层级证据且含机制验证。
C57BL/6J小鼠SAH模型 原代皮层神经元oxyHb刺激模型 SAH患者CSF样本
SAH模型:雄性C57BL/6J小鼠,8-10周龄,采用视交叉前池注射60 μl自体动脉血建立,假手术注射生理盐水 体外刺激:原代皮层神经元使用20 mM oxyHb处理24小时模拟SAH 慢病毒敲低:LV-AIM2、LV-CAS1及LV-NC,病毒滴度1.0×10^8 Tu/ml,体内侧脑室注射3 μl,体外MOI=30 分组:体内实验每组n=18或n=24,体外实验随机分为sham、SAH等组别 检测时间点:体内SAH后6、12、24、72小时,体外oxyHb刺激后6、12、24小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测SAH患者CSF中AIM2水平,评估其与SAH的关系。
收集SAH患者(n=24)和对照(n=10)CSF样本,通过Western blot检测AIM2水平,并按Hunt-Hess分级比较。
建立小鼠SAH模型,观察AIM2炎性小体通路在脑组织中的表达变化。
C57BL/6J小鼠行视交叉前池注射自体动脉血诱导SAH,在多个时间点取脑组织进行Nissl染色、免疫组化和Western blot检测AIM2、GSDMD、caspase-1等蛋白表达。
在体外用oxyHb刺激原代皮层神经元模拟SAH,验证AIM2炎性小体介导的焦亡。
培养原代皮层神经元,用oxyHb刺激,通过Western blot、ELISA、流式细胞术和扫描电镜检测焦亡相关蛋白、IL-1β/IL-18分泌、细胞焦亡及膜孔形成。
验证抑制AIM2炎性小体激活能否减轻SAH后的GSDMD诱导的焦亡。
小鼠侧脑室注射LV-AIM2、LV-CAS1或LV-NC,72小时后建立SAH模型,24小时后检测焦亡相关蛋白、组织学变化和TUNEL染色。
在体外验证敲低AIM2或caspase-1对oxyHb诱导的神经元焦亡的影响。
原代皮层神经元用LV-AIM2、LV-CAS1或LV-NC转染,48小时后用oxyHb刺激,检测焦亡相关蛋白、IL-1β/IL-18分泌和流式细胞术。
探讨caspase-1敲低是否影响细胞凋亡。
在体内和体外caspase-1敲低模型中,通过Western blot检测caspase-3和cleaved caspase-3,并用TUNEL染色评估凋亡。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 临床样本检测 | PVDF膜 | MilliporeSigma | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Roche | -- | |
| 膜蛋白和胞浆蛋白提取试剂盒 | Beyotime | -- | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- | |
| 增强化学发光Western blot检测试剂 | MilliporeSigma | -- | |
| Western blot (CSF) | 增强化学发光Western blot检测试剂 | Amersham | -- |
| Western blot | X射线胶片 | -- | -- |
| UN-Scan-It 6.1软件 | Silk Scientific | -- | |
| 免疫荧光染色 | Alexa Fluor 488二抗 | Jackson ImmunoResearch | -- |
| DAPI | MilliporeSigma | -- | |
| TUNEL染色 | TUNEL反应混合物 | Roche | -- |
| ELISA | IL-1β ELISA试剂盒 | eBioscience | -- |
| IL-18 ELISA试剂盒 | eBioscience | -- | |
| 流式细胞术 | Annexin V-FITC凋亡检测试剂盒 | KeyGEN BioTECH | -- |
| 流式细胞仪 | Becton-Dickinson | -- | |
| 扫描电镜 | 锇酸(OsO4) | -- | -- |
| 临界点干燥仪 | -- | -- | |
| 扫描电子显微镜 | HITACHI | SU8100 | |
| 免疫组化 | DAB | -- | -- |
| 细胞培养 | Hank's平衡盐溶液 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| DMEM培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Neurobasal培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| GlutaMAX-I | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| B27添加剂 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 胰蛋白酶 | -- | -- | |
| 多聚赖氨酸 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| SAH模型 | 氧合血红蛋白(oxyHb) | MilliporeSigma | -- |
| 慢病毒转染 | HBLV-GFP-shAIM2(LV-AIM2) | Hanbio | -- |
| HBLV-GFP-shCAS1(LV-CAS1) | Hanbio | -- | |
| HBLV-GFP-PURO(LV-NC) | Hanbio | -- | |
| 抗体 | 抗AIM2抗体 | eBioscience | 14-6008-93 |
| 抗GSDMD抗体 | Biorbyt | orb390052 | |
| 抗GSDMD-N抗体 | Biorbyt | orb593258 | |
| 抗ASC抗体 | Cell Signaling Technology | 67824 | |
| 抗caspase-1抗体 | Abcam | ab108362 | |
| 抗caspase-1 p20抗体 | MilliporeSigma | ab1871 | |
| 抗caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9665 | |
| 抗cleaved caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9664 | |
| 抗β-actin抗体 | Bioworld Technology | AP0060 | |
| 抗Na+-K+ ATPase抗体 | Abcam | ab76020 | |
| 抗AIM2抗体(IF) | Bioss | bs-5986R | |
| 抗GSDMD抗体(IF) | Biorbyt | orb390052 | |
| 抗NeuN抗体 | MilliporeSigma | MAB377X | |
| 抗ASC抗体(IF) | Cell Signaling Technology | 67824 | |
| 抗caspase-1 p20抗体(IF) | Santa Cruz Biotechnology | sc-398715 | |
| 抗MAP2抗体 | MilliporeSigma | MAB3148X | |
| 抗ASC抗体(IHC) | Santa Cruz Biotechnology | sc-514414 | |
| 抗caspase-1 p20抗体(流式) | Santa Cruz Biotechnology | sc-22163 | |
| 统计软件 | GraphPad Prism 6.0 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本检测 | CSF样本采集时间(SAH后72小时内)、对照组来源(脊髓麻醉前)、样本量(对照组n=10,SAH组n=24)、Hunt-Hess分级分组(I-II级n=15,III-V级n=9) 阅读提示:参见Materials and methods中Clinical sample collection and analysis及图1图注 |
| SAH模型 | 小鼠品系(C57BL/6J)、性别(雄性)、年龄(8-10周)、自体血注射量(60 μl)、注射部位(视交叉前池)、注射速度(10秒)、假手术对照(生理盐水) 阅读提示:参见Materials and methods中SAH model |
| 体外刺激模型 | oxyHb浓度(20 mM)、刺激时间(24小时)、原代神经元来源(E16-18胎鼠) 阅读提示:参见Materials and methods中SAH model和Primary neuron culture |
| 慢病毒敲低 | LV-AIM2、LV-CAS1、LV-NC的滴度(1.0×10^8 Tu/ml)、体内注射量(3 μl)及速率(0.2 μl/min)、体外MOI(30)、转染后处理时间(体内72小时,体外48小时) 阅读提示:参见Materials and methods中Lentivirus delivery in vivo and in vitro |
| Western blot | 抗体稀释比例(如AIM2 1:1000、GSDMD 1:1000等)、上样量(蛋白量未明确)、SDS-PAGE浓度(10%或12%) 阅读提示:参见Materials and methods中Western blot |
| 流式细胞术 | 细胞数量(~5×10^5)、caspase-1抗体稀释(1:100)、PI染色使用Annexin V-FITC凋亡检测试剂盒、重复次数(至少三次) 阅读提示:参见Materials and methods中Flow cytometry |