建立急性与慢性肾损伤模型并分析肾外泌体miRNA谱
探索肾损伤状态下肾外泌体miRNA表达变化,寻找关键候选miRNA。
通过LPS腹腔注射建立AKI模型,通过ADR静脉注射建立慢性蛋白尿肾病模型,利用miRNA芯片筛选差异表达miRNA,并用qRT-PCR验证。
Exosomal miRNA-19b-3p of tubular epithelial cells promotes M1 macrophage activation in kidney injury.
包含LPS诱导AKI和ADR诱导慢性肾损伤模型、体外细胞共培养与外泌体追踪、双荧光素酶报告基因验证、体内外泌体过继转移及临床患者尿液外泌体分析等多层级证据。
LPS诱导的急性肾损伤(AKI)小鼠模型(BALB/c) 阿霉素(ADR)诱导的慢性蛋白尿肾病小鼠模型(C57BL/6J) 小鼠肾小管上皮细胞(mTECs) 巨噬细胞(Raw264.7和骨髓来源巨噬细胞BMMs)
LPS剂量10mg/kg腹腔注射,24小时后检测 ADR剂量18mg/kg静脉注射,23天后检测 TECs用20mg/ml BSA处理24小时 miR-19b-3p mimic/inhibitor转染浓度100nM 肾内注射外泌体(8×10^6 TECs来源)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探索肾损伤状态下肾外泌体miRNA表达变化,寻找关键候选miRNA。
通过LPS腹腔注射建立AKI模型,通过ADR静脉注射建立慢性蛋白尿肾病模型,利用miRNA芯片筛选差异表达miRNA,并用qRT-PCR验证。
检验TEC来源外泌体是否能被巨噬细胞内化并诱导M1极化。
用BSA刺激TECs,分离外泌体,通过共培养或直接加外泌体处理Raw264.7和BMMs,检测炎症因子和iNOS表达。
确认外泌体miR-19b-3p是巨噬细胞活化的关键分子,并揭示其靶基因。
转染miR-19b-3p mimic/inhibitor,敲低Rab27a,双荧光素酶报告基因验证SOCS-1为直接靶标,并检测NF-κB通路变化。
在动物水平证明TEC来源外泌体miR-19b-3p能诱导肾小管间质炎症。
将BSA处理的TEC外泌体(经miR-19b-3p抑制剂或对照处理)通过肾内注射到小鼠,24小时后分析肾组织损伤和炎症。
评估尿外泌体miR-19b-3p与人类糖尿病肾病肾小管间质炎症的相关性。
从T2DM和DN患者尿液中分离外泌体,检测miR-19b-3p表达水平及与临床指标相关性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型 | 脂多糖 | Sigma Aldrich | L2630 |
| 阿霉素 | Sigma Aldrich | D1515 | |
| 细胞培养 | DMEM-F12培养基 | Hyclone | -- |
| RPMI 1640培养基 | Hyclone | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| 重组小鼠M-CSF | R&D System | 416-ML | |
| 牛血清白蛋白 | Sigma Aldrich | -- | |
| 外泌体分离 | miRNeasy Micro 试剂盒 | QIAGEN | 217084 |
| miRNA表达谱 | miRCURY LNA 芯片(版本11.0) | Exiqon | -- |
| 细胞转染 | miR-19b-3p模拟物 | GenePharma | -- |
| miR-19b-3p抑制剂 | GenePharma | -- | |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668019 | |
| 荧光素酶报告基因 | 双荧光素酶检测试剂盒 | Promega | E1910 |
| 荧光标记 | DiO染料 | Beyotime | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | TAKARA | -- |
| 逆转录与qPCR | All-in-One miRNA第一链cDNA合成试剂盒 | GeneCopoeia | -- |
| All-in-One miRNA qPCR试剂盒 | GeneCopoeia | QP015 | |
| PrimeScript RT试剂盒 | TAKARA | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Thermo Scientific | 89901 |
| BCA蛋白浓度测定试剂盒 | KeyGEN BioTECH | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| anti-Alix抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-53540 | |
| anti-CD9抗体 | Abcam | ab92726 | |
| anti-CD63抗体 | Abcam | ab213090 | |
| anti-SOCS-1抗体 | Abcam | ab62584 | |
| anti-P-p65抗体 | Cell Signaling Technology | 3033S | |
| anti-p65抗体 | Cell Signaling Technology | 8242S | |
| anti-β-actin抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-47778 | |
| anti-iNOS抗体 | Abcam | ab15323 | |
| 免疫荧光 | FITC标记二抗 | Bioss | bs-0295D |
| DAPI染色液 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | LPS剂量10mg/kg腹腔注射,ADR剂量18mg/kg静脉注射;小鼠品系(BALB/c vs C57BL/6J)及性别年龄(6-8周雄性) 阅读提示:Materials and methods: Animal models |
| 细胞培养与外泌体提取 | TECs培养条件,BSA浓度20mg/ml处理时间24h;外泌体提取方法(超速离心) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture, Isolation and characterization of exosomes |
| 外泌体功能验证 | 外泌体处理浓度(文中未明确说明)、共培养系统(Transwell 0.4μm)、检测时间点 阅读提示:Materials and methods: Co-culture experiments, Figure 3 legend |
| miR-19b-3p操纵 | mimic/inhibitor浓度100nM,转染试剂Lipofectamine 2000,转染时间 阅读提示:Materials and methods: Cell transfection, Figure 4 legend |
| 体内注射实验 | 外泌体来源(8×10^6 TECs)、注射途径(肾内)、注射后时间(24h)、每组小鼠数量(6) 阅读提示:Materials and methods: Animal models, Figure 6 legend |
| 临床样本检测 | 患者分组(T2DM n=15, DN n=28),尿外泌体提取方法,miR-19b-3p检测方法 阅读提示:Materials and methods: Isolation and characterization of exosomes, Results: Figure 7 |