建立IL-3依赖性细胞模型
创建一个依赖EGFR和ErbB3配体增殖的纯环境,以便评估单一配体对细胞增殖的影响。
从BALB/c小鼠骨髓分离细胞,获得IL-3依赖性细胞(BM-IL-3),并培养FDC-P1细胞。通过慢病毒感染稳定表达EGFRwt或EGFRmut以及ErbB3。
ErbB3 Ligand Heregulin1 Is a Major Mitogenic Factor for Uncontrolled Lung Cancer Cell Proliferation.
本研究包含细胞模型(FDC-P1、BM-IL-3)及NSCLC细胞系功能验证、信号通路机制验证(Western blot、Co-IP、STORM)、患者样本IHC分析及补充体内外实验,证据层级独立。
FDC-P1细胞(EGFR-ErbB3过表达) BM-IL-3细胞(EGFR-ErbB3过表达) NSCLC细胞系HCC827和H1975(含EGFR突变) 肺腺癌患者肿瘤组织样本(16例)
IL-3依赖性细胞株(FDC-P1和BM-IL-3)需在去除IL-3后饥饿,再以20 ng/ml的配体处理。 细胞增殖实验采用96孔板,每孔4000个细胞,处理72小时,使用CCK8检测OD450。 EGFR-ErbB3异源二聚体相互作用通过STORM成像和共免疫沉淀(Co-IP)验证,关键抗体为anti-EGFR和anti-ErbB3。 临床样本IHC染色用于评估EGFR、ErbB3、HRG1和EGFR配体的表达。 Western blot分析中,细胞先饥饿24小时,再用配体处理15分钟,检测ErbB3磷酸化。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
创建一个依赖EGFR和ErbB3配体增殖的纯环境,以便评估单一配体对细胞增殖的影响。
从BALB/c小鼠骨髓分离细胞,获得IL-3依赖性细胞(BM-IL-3),并培养FDC-P1细胞。通过慢病毒感染稳定表达EGFRwt或EGFRmut以及ErbB3。
确定哪种配体是细胞增殖的最强刺激因子,并比较EGFRwt-ErbB3与EGFRmut-ErbB3的差异。
去除IL-3后,用不同配体(EGF、TGFα、HB-EGF、BTC、AREG、EREG、EPGN、HRG1、HRG2)处理细胞,通过CCK8检测细胞数量。
探究HRG1与EGFR配体同时结合EGFR-ErbB3异源二聚体时对细胞增殖的影响。
将HRG1与各EGFR配体单独或组合处理细胞,比较EGFRwt-ErbB3和EGFRmut-ErbB3细胞的增殖反应。
阐明EGF抑制HRG1诱导的ErbB3磷酸化的分子机制。
血清饥饿后,用不同配体处理细胞,裂解后通过SDS-PAGE和Western blot检测ErbB3磷酸化、Erk1/2磷酸化。
确定EGF是否通过促进EGFR同源二聚体形成来阻止EGFR-ErbB3异源二聚体的形成。
使用免疫荧光染色和STORM超分辨率成像观察EGFR和ErbB3的定位和共定位;使用共免疫沉淀(Co-IP)检测EGFR-ErbB3异源二聚体的存在。
评估EGFR、ErbB3及其配体在肺腺癌患者肿瘤组织中的表达。
对16例肺腺癌患者的肿瘤组织进行IHC染色,分析EGFR、ErbB3、HRG1及EGFR配体的表达水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Invitrogen Life Technologies | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 白细胞介素-3 | PeproTech | -- | |
| 细胞增殖检测 | 细胞计数试剂盒-8 | Dojindo | -- |
| iMark酶标仪 | Bio-Rad | -- | |
| 蛋白质检测 | 抗磷酸化AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 |
| 抗磷酸化ERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 9101 | |
| 抗ERK抗体 | Cell Signaling Technology | 9102 | |
| 抗HER3/ErbB3抗体 | Cell Signaling Technology | 12708 | |
| 抗兔IgG (H+L), F(ab')2片段 (Alexa Fluor 488) | Cell Signaling Technology | 4412 | |
| 蛋白A琼脂糖珠 | Cell Signaling Technology | 9863 | |
| 兔多克隆抗EGFR抗体 | Cell Signaling Technology | 2232 | |
| 抗EGFR抗体 | Abcam | ab52894 | |
| 抗ErbB3抗体 | Abcam | ab20161 | |
| 抗ErbB3抗体 | Abcam | ab93739 | |
| 免疫荧光 | 抗小鼠IgG H&L (Alexa Fluor 647) | Abcam | ab150115 |
| 免疫组化 | 抗EGF抗体 | Abcam | ab9695 |
| 蛋白质检测 | 抗Betacellulin抗体 | Bioss | bs-12864R |
| 抗Epigen抗体 | Bioss | bs-5767R | |
| 抗HB-EGF抗体 | R&D | AF-259-NA | |
| 抗epiregulin抗体 | R&D | AF1195 | |
| 抗HRG1-β1抗体 | R&D | AF-396-NA | |
| 抗amphiregulin抗体 | R&D | AF262 | |
| 抗TGFα抗体 | R&D | AF-239-NA | |
| 免疫荧光 | 抗兔IgG F(ab')2片段-Atto488 | Sigma-Aldrich | 36098 |
| 细胞核染色 | 4',6-二脒基-2-苯基吲哚 | Sigma-Aldrich | 28718-90-3 |
| 细胞培养 | 嘌呤霉素 | Sigma-Aldrich | P8833 |
| 聚凝胺 | Sigma-Aldrich | 107689 | |
| Western blot | 二抗 | HuaAn BIO | HA1001 |
| 细胞处理 | 表皮生长因子 | PeproTech | AF-100-15 |
| 转化生长因子-α | PeproTech | 100-16A | |
| 双调蛋白 | PeproTech | 200-55B | |
| 表皮调节素 | PeproTech | 100-04 | |
| β细胞素 | PeproTech | 100-50 | |
| 上皮调节蛋白 | PeproTech | 100-51 | |
| 肝素结合EGF样生长因子 | PeproTech | 100-47 | |
| 调蛋白β1 | PeproTech | 100-03 | |
| 小鼠白细胞介素-3 | PeproTech | 213-13 | |
| 调蛋白β2 | Prospec | CYT-407 | |
| RNA提取 | RNeasy小提试剂盒 | QIAGEN | 74104 |
| PCR产物纯化 | PCR纯化试剂盒 | QIAGEN | 28104 |
| 凝胶回收 | 凝胶回收试剂盒 | QIAGEN | 28706 |
| 质粒提取 | 质粒大提试剂盒 | QIAGEN | 12162 |
| cDNA合成 | Superscript III第一链合成系统 | Invitrogen Life Technologies | 18080-051 |
| 分子克隆 | 限制性内切酶 | New England Biolabs | -- |
| ErbB3全长cDNA | Sino Biological | HG10201-M | |
| 细胞培养 | 新霉素 | Gibco | 10131-055 |
| OPTI-MEM培养基 | Gibco | 31985-062 | |
| 细胞转染 | X-treme GENE HP DNA转染试剂 | Roche | 06366236001 |
| 慢病毒包装 | 慢病毒表达载体pL-tdTomato-Luc-Neo和FUW-Luc-mCH-puro | -- | -- |
| 测序平台 | 尼康A1激光扫描共聚焦显微镜 | Nikon | -- |
| STORM成像 | N-STORM系统 | Nikon | -- |
| HP Apo 100× TIRF物镜 | Nikon | -- | |
| 滨松ORCA-Flash4.0 V2相机 | HAMAMATSU | -- | |
| 尼康NIS Elements图像分析软件 | Nikon | -- | |
| RT-qPCR | CFX-Connect实时荧光定量PCR检测系统 | Bio-Rad | -- |
| iTaq通用SYBR一步法试剂盒 | Bio-Rad | -- | |
| 免疫组化 | TissueFAXS Plus系统 | TissueGnostics | -- |
| StrataQuest | TissueGnostics | -- | |
| 细胞培养 | Mycoalert支原体检测试剂盒 | Lonza | LT07-218 |
| PCR支原体检测试剂盒 | HuaAn | K0103 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞增殖实验 | 细胞类型、配体浓度(20 ng/ml)、处理时间(72小时)、血清浓度(0.1% FBS for NSCLC,5% FBS for FDC-P1)、CCK8检测步骤 阅读提示:阅读Materials and Methods中的"Cell Proliferation Assays"和Figure legends 1和2 |
| Western blot | 细胞处理(配体及浓度20 ng/ml,处理时间15分钟)、抗体(anti-pErbB3, anti-ErbB3, anti-pErk1/2, anti-Erk1/2) 阅读提示:阅读Materials and Methods中的"Immunoprecipitation"和Figure legend 3 |
| STORM成像 | 细胞准备(玻璃底培养皿)、配体浓度(20 ng/ml)、处理时间(15分钟)、固定和透化条件、抗体浓度、STORM成像参数 阅读提示:阅读Materials and Methods中的"STORM Imaging Analysis"和Figure legend 4 |
| 免疫共沉淀 | 细胞饥饿处理(24小时)、配体浓度(20 ng/ml)、处理时间(15分钟)、IP抗体(anti-EGFR或anti-ErbB3)、蛋白A琼脂糖珠的使用 阅读提示:阅读Materials and Methods中的"Immunoprecipitation"和Figure legend 4F |
| 患者样本IHC | 样本类型(16例肺腺癌)、固定方法(4%多聚甲醛)、切片厚度(3μm)、抗原修复条件(EDTA pH9煮沸20分钟)、抗体和稀释度 阅读提示:阅读Materials and Methods中的"Immunohistochemistry (IHC)"和Supplemental Data 4 |