多形性腺瘤候选生物标志物的识别:一项病例对照研究

Identifying Candidate Biomarkers for Pleomorphic Adenoma: A Case-Control Study.

作者信息Matthew D Morrison, Linda Jackson-Boeters, Zia A Khan, Michael S Shimizu, Jason H Franklin, Kevin Fung, John H J Yoo, Mark R Darling
PMID30120721
发布时间2019-09
DOI10.1007/s12105-018-0959-6

实验完整度

包含RT-qPCR和免疫组化两种检测方法,验证了mRNA和蛋白表达,并分析了临床病理关联,但缺乏功能实验和动物模型。

主要模型

多形性腺瘤组织标本 正常涎腺组织对照

重点核对

样本量:26对PA和NSGT,其中17对用于RT-qPCR KLK mRNA检测:RT-qPCR,使用β-actin作为内参 KLK蛋白检测:免疫组化,使用KLK1、KLK12、KLK13、KLK8抗体 统计分析:Wilcoxon符号秩检验和Mann-Whitney U检验,显著性水平P<0.05

摘要

多形性腺瘤(PA)是最常见的良性涎腺肿瘤。激肽释放酶相关肽酶已被确定为许多人类肿瘤的生物标志物,并可能影响肿瘤行为。我们研究了PA标本中的KLK1−15信使核糖核酸和蛋白质,以确定该肿瘤的KLK表达谱。新鲜冷冻的PA组织标本(n = 26)及匹配对照进行了定量实时逆转录聚合酶链反应以检测KLK1−15 mRNA。随后通过免疫染色技术评估KLK1、KLK12、KLK13和KLK8蛋白的表达。统计学分析以P < .05为显著性水平。我们观察到KLK1、KLK12和KLK13 mRNA表达下调,免疫染色研究显示相应蛋白下调。组织学证据显示包膜穿孔与KLK1蛋白表达增加相关。肿瘤大小与包膜侵犯和/或穿孔无关。这项研究首次在转录水平和蛋白质水平详细描述了PA的KLK表达谱。未来需要进一步研究以开发这些发现的临床应用。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
多形性腺瘤中KLK1–15的mRNA和蛋白表达谱是否异常,及其与临床病理特征的关系
核心机制
KLK1、KLK12和KLK13的下调可能涉及KLK级联反应,影响肿瘤的侵袭和恶性转化能力
主要证据
RT-qPCR显示KLK1、KLK12和KLK13 mRNA显著下调;免疫组化显示相应蛋白下调;KLK1蛋白表达在包膜穿孔病例中增加
研究意义
首次建立PA的KLK表达谱,为涎腺肿瘤的鉴别诊断、预后和术后监测提供潜在生物标志物

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

样本收集和RNA提取

获取PA和正常涎腺组织并提取RNA,以进行基因表达分析

从26对PA和NSGT标本中提取RNA,使用TRIzol和Aurum Total RNA mini kit,并用Qubit RNA BR Assay Kit定量

2

RT-qPCR检测KLK mRNA表达

定量比较PA和NSGT中KLK1–15的mRNA表达水平

使用iScript cDNA Synthesis Kit逆转录,CFX Connect Real-Time PCR Detection System进行RT-qPCR,使用SsoFast EvaGreen Supermix和定制引物板

3

免疫组化检测KLK蛋白表达

验证RT-qPCR发现的差异表达KLK在蛋白水平的表达情况

对26对PA和NSGT标本进行IHC,使用KLK1、KLK12、KLK13和KLK8抗体,采用半定量OSS评分

4

评估包膜侵犯和/或穿孔

分析KLK表达和肿瘤大小与包膜侵犯和/或穿孔的关系

检查原始组织学切片,定义包膜侵犯和穿孔,统计分析KLK mRNA和蛋白表达与这些现象的关系

5

分析肿瘤大小与包膜侵犯/穿孔的关系

探究肿瘤大小是否与包膜侵犯和/或穿孔相关

从手术病理报告中获取肿瘤大小,比较伴有或不伴有包膜侵犯/穿孔的PA大小

6

随访记录复发和恶性转化

评估PA患者的术后复发和恶性转化情况

审查医疗记录,记录10年随访期间的复发或恶性转化事件

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
TRIzol试剂Thermo Fisher Scientific15596026
Aurum总RNA小提试剂盒Bio-Rad Laboratories7326820
Qubit RNA BR检测试剂盒Thermo Fisher ScientificQ10210
iScript cDNA合成试剂盒Bio-Rad Laboratories1708890
CFX Connect实时PCR检测系统Bio-Rad Laboratories--
SsoFast EvaGreen超混合液Bio-Rad Laboratories1725201
KLK1抗体BiossBS-1963R
KLK12抗体Novus BiologicalsNB200-137
KLK13抗体AbcamAB113227
KLK8抗体AbgentAP6327B
ImmPRESS HRP抗兔IgG(过氧化物酶)聚合物检测试剂盒Vector LaboratoriesMP-7401
Cytoseal封片剂VWR48212154

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
样本收集
样本量26对,新鲜冷冻,RNA产量足够17对
阅读提示:Methods部分,Table 1
RT-qPCR
引物序列和浓度:KLK1–15和β-actin,来自Qiagen;反应体系:10μL SsoFast EvaGreen Supermix,2μL引物,1μL cDNA,7μL无核酸酶水;循环条件:95°C 10分钟,40个循环(95°C 15秒,60°C 1分钟)
阅读提示:Methods中的RT-qPCR部分
免疫组化
抗体稀释度:KLK1 1/1000,KLK12 1/100,KLK13 1/2000,KLK8 1/200;抗原修复条件
阅读提示:Methods中的Immunohistochemistry部分
包膜侵犯/穿孔评估
定义:包膜侵犯和穿孔;统计检验
阅读提示:Methods中的Assessment of Capsular Invasion and/or Perforation部分