LIF对细胞增殖和凋亡的影响
评估LIF对狨猴iPSCs增殖和凋亡的总体影响。
在LIF存在或缺失条件下培养狨猴iPSCs,观察形态和克隆效率,用MTT法检测细胞活力,用流式细胞术检测细胞凋亡。
Leukemia inhibitory factor regulates marmoset induced pluripotent stem cell proliferation via a PI3K/Akt‑dependent Tbx‑3 activation pathway.
包含细胞增殖、凋亡、DGE、RT-qPCR、Western blot及PI3K抑制剂验证等多层级实验,并明确功能与机制验证。
狨猴iPSCs细胞系
LIF浓度:1000 U/ml 细胞接种密度:96孔板5×10^3 LY294002浓度:20 µM,处理24 h Western blot抗体:抗Tbx-3 (1:1000)、抗p-AKT (1:1000) 统计学:t检验,P<0.05,n=3
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估LIF对狨猴iPSCs增殖和凋亡的总体影响。
在LIF存在或缺失条件下培养狨猴iPSCs,观察形态和克隆效率,用MTT法检测细胞活力,用流式细胞术检测细胞凋亡。
鉴定LIF处理后狨猴iPSCs中差异表达的基因。
构建DGE文库并进行Solexa测序,比较LIF处理组和对照组的基因表达谱。
验证DGE数据中关键基因的表达变化。
通过RT-qPCR检测Tbx-3、PI3K等基因的mRNA表达水平。
验证LIF是否通过PI3K/Akt通路调节Tbx-3表达。
用Western blot检测STAT3、PI3K、AKT、p-AKT、Tbx-3和NANOG的蛋白水平,并使用PI3K抑制剂LY294002处理细胞。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | TeSR-E8培养基 | StemCell Technologies, Inc. | 05840 |
| 胎牛血清 | Hyclone; GE Healthcare Life Sciences | SH30406.02E | |
| 青霉素/链霉素 | Invitrogen; Thermo Fisher Scientific, Inc. | 15070-063 | |
| 碱性成纤维细胞生长因子 | Sigma-Aldrich; Merck KGaA | F0291 | |
| ROCK抑制剂Y-27632 | Sigma-Aldrich; Merck KGaA | Y0503-1MG | |
| 细胞传代 | Accutase | StemCell Technologies, Inc. | 07920 |
| 细胞培养 | 小鼠白血病抑制因子 | EMD Millipore | ESG1106 |
| 细胞增殖 | MTT试剂 | Sigma-Aldrich; Merck KGaA | -- |
| 细胞凋亡 | FITC Annexin V凋亡检测试剂盒 | BD Biosciences | -- |
| 流式分析 | FACSAria流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| RNA分析 | Agilent 2100生物分析仪 | Agilent | -- |
| cDNA合成 | SuperScript双链cDNA合成试剂盒 | Invitrogen; Thermo Fisher Scientific, Inc. | 11917-010 |
| PCR纯化 | QiaQuick PCR提取试剂盒 | Qiagen GmbH | 28104 |
| PCR扩增 | Platinum Pfx DNA聚合酶 | Invitrogen; Thermo Fisher Scientific, Inc. | 11708013 |
| RT-qPCR | Prime Script试剂盒 | Takara Bio, Inc. | -- |
| SYBR Premix Ex Taq | Takara Bio, Inc. | -- | |
| 7500实时PCR系统 | Applied Biosystems; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| 蛋白定量 | Quick Start Bradford蛋白定量试剂盒 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | -- |
| Western blot | 硝酸纤维素膜 | EMD Millipore | -- |
| 抗β-actin抗体 | BIOSS | bs-0061R | |
| 抗PI3K (85α)抗体 | Full | 60225-1-Ig | |
| 抗AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 9272 | |
| 抗磷酸化AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 9271 | |
| 抗STAT3抗体 | ProteinTech | 10253-2-AP | |
| 抗Tbx-3抗体 | ProteinTech | 16741-1-AP | |
| 抗NANOG抗体 | ProteinTech | 14295-1-AP | |
| HRP标记二抗 | Beyotime Institute of Biotechnology | A0208 | |
| 增强化学发光试剂 | Amersham; GE Healthcare Life Sciences | -- | |
| Western blot成像 | ECL Tanon 5500成像系统 | Tanon Science and Technology Co., Ltd. | -- |
| 通路抑制 | LY294002 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 培养基成分、bFGF浓度、ROCK抑制剂浓度、基质胶、传代比例、LIF浓度(1000 U/ml) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture |
| 细胞增殖 | 细胞接种密度(5×10^3)、MTT浓度(0.5 mg/ml)、孵育时间(3 h)、测量波长(495 nm) 阅读提示:Materials and methods: Cell proliferation assay |
| 细胞凋亡 | 凋亡检测试剂盒(FITC Annexin V)、孵育时间(15 min)、流式细胞仪型号 阅读提示:Materials and methods: Flow cytometry |
| 基因表达分析 | RNA提取方法、DGE文库构建、测序平台(HiSeq 2000)、差异表达分析标准 阅读提示:Materials and methods: cDNA library construction, solexa sequencing and digital gene expression (DGE) analysis |
| 蛋白检测 | 抗体列表及稀释度(1:1000)、SDS-PAGE条件、转膜条件 阅读提示:Materials and methods: Western blot analysis |
| 通路抑制 | LY294002浓度(20 µM)、处理时间(24 h)、DMSO对照 阅读提示:Materials and methods: PI3K/Akt signaling inhibition |