机械刺激模型的构建与细胞处理
建立模拟肿瘤微环境中拉伸力的体外模型,并施加瞬时机械刺激以观察其对细胞侵袭的影响。
利用I型胶原、纤连蛋白和顺磁性微珠构建基质,将HT1080细胞接种后置于旋转磁场上施加刺激或无刺激处理。
Transient mechanical strain promotes the maturation of invadopodia and enhances cancer cell invasion in vitro.
包含qPCR/ PCR array筛选、Western blot验证、基因过表达及siRNA敲低功能实验、共聚焦显微镜形态学分析及酶活性检测等多个独立证据层级。
HT1080人纤维肉瘤细胞系 I型胶原-纤连蛋白基质体外机械-侵袭模型
HT1080细胞系的培养条件及代数 机械刺激装置参数(磁铁强度、转速、距离) 细胞接种密度 刺激时间48小时 整合素β3过表达及cofilin敲低处理
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立模拟肿瘤微环境中拉伸力的体外模型,并施加瞬时机械刺激以观察其对细胞侵袭的影响。
利用I型胶原、纤连蛋白和顺磁性微珠构建基质,将HT1080细胞接种后置于旋转磁场上施加刺激或无刺激处理。
识别机械刺激下与侵袭和机械传导相关的差异表达基因,并验证其表达变化。
提取RNA进行PCR array分析,筛选差异表达基因,并利用qPCR验证候选基因的表达水平。
验证机械刺激诱导的整合素β3下调对细胞侵袭的功能意义。
通过质粒转染过表达ITGB3,在机械刺激条件下检测细胞侵袭能力、整合素β3蛋白水平及cofilin磷酸化变化。
探究机械刺激对cofilin活性和侵袭足结构(长度和数量)的影响,并验证cofilin的介导作用。
通过Western blot检测cofilin磷酸化水平;使用共聚焦显微镜观察固定细胞中cortactin和肌动蛋白共定位的侵袭足,测量其长度和数量;并通过siRNA敲低cofilin观察刺激后侵袭足长度的变化。
验证机械刺激是否通过影响MMP-2的表达和分泌来促进侵袭足成熟。
收集细胞裂解液和条件培养基,通过Western blot和明胶酶谱法检测MMP-2两种亚型的表达及酶活,并使用DQ胶原降解实验评估基质降解活性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Eagle最低必需培养基 | ATCC | -- |
| 胎牛血清 | Hyclone | -- | |
| 青霉素-链霉素溶液 | Life Technologies | -- | |
| 胰蛋白酶 | Sigma | -- | |
| 机械刺激与侵袭实验 | I型胶原蛋白 | -- | -- |
| 纤连蛋白 | -- | -- | |
| 顺磁性微珠 | -- | -- | |
| 稀土磁铁 | -- | -- | |
| 轨道摇床 | Barnstead Thermolyne | -- | |
| Western blot | 蛋白酶抑制剂混合物 | Sigma | -- |
| Halt™磷酸酶抑制剂混合物 | ThermoScientific | -- | |
| 6× Laemmli缓冲液 | Boston BioProducts | -- | |
| PVDF膜 | Bio-Rad | -- | |
| Amersham ECL Prime Western印迹检测试剂 | Amersham | -- | |
| ImageJ | NIH | -- | |
| 抗整合素β3抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-14009 | |
| 抗活化整合素β1抗体 | BD Pharmingen | 553715 | |
| 抗cofilin抗体 | Abcam | ab54532 | |
| 抗磷酸化cofilin (Ser3)抗体 | Cell Signaling Technology | 3313 | |
| 抗MMP-2抗体 | Bioss | bs-4599R | |
| 抗GAPDH抗体 | Millipore | MAB374 | |
| HRP标记的抗鼠IgG | Fisher | -- | |
| HRP标记的抗大鼠IgG | Abcam | -- | |
| HRP标记的抗兔IgG | Amersham | -- | |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | -- | -- |
| 抗cortactin抗体 | Abcam | ab33333 | |
| Alexa Fluor 647偶联的二抗 | Life Technologies | -- | |
| Alexa Fluor 546偶联的鬼笔环肽 | Life Technologies | -- | |
| 基因表达分析 | RT²第一链合成试剂盒 | SA Biosciences | -- |
| GoScript™逆转录酶 | Promega | -- | |
| RT² qPCR SYBR Green/ROX MasterMix-12 | SA Biosciences | -- | |
| Stratagene Mx3000P仪器 | Stratagene | -- | |
| GAPDH引物 | -- | -- | |
| ACTN3引物 | -- | -- | |
| CTTN引物 | -- | -- | |
| MYL9引物 | -- | -- | |
| PTK2B引物 | -- | -- | |
| ITGB3引物 | -- | -- | |
| MTSS1引物 | -- | -- | |
| RNA提取 | Qiagen RNeasy小型试剂盒 | Qiagen | -- |
| NanoDrop分光光度计 | ThermoScientific | -- | |
| 整合素β3过表达 | pcDNA3.1-beta-3质粒 | Addgene | 27289 |
| Amaxa Nucleofector 2设备 | Lonza | -- | |
| Nucleofector T试剂盒 | Lonza | -- | |
| 条件培养基收集 | 分子量截留10 kDa的蛋白浓缩器 | ThermoFisher | -- |
| DC蛋白定量试剂盒 | Bio-Rad | -- | |
| 明胶酶谱法 | 明胶 | Sigma | -- |
| 基质降解分析 | DQ I型胶原蛋白 | ThermoFisher | -- |
| 共聚焦显微镜 | Zeiss LSM 550 META NLO共聚焦显微镜 | Zeiss | -- |
| Zeiss LSM 880显微镜 | Zeiss | -- | |
| Zeiss Zen软件(2012版) | Zeiss | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | HT1080细胞系来源、培养基组成(EMEM+10% FBS+1% P/S)、培养条件(37°C,5% CO2)、传代代数(不超过第8代)、支原体检测 阅读提示:Materials and Methods - Cell culture |
| 机械刺激模型构建 | 基质成分(I型胶原、纤连蛋白)、微珠大小和浓度、磁铁强度、放置距离、转速、刺激时间 阅读提示:Materials and Methods - In vitro mechano-invasion assay |
| 侵袭效率检测 | 细胞接种密度、培养时间、固定及计数方法(z轴每100 μm分层计数)、侵袭百分率计算公式 阅读提示:Materials and Methods - In vitro mechano-invasion assay |
| 基因表达分析 | RNA提取方法、RNA质量标准(260/280≥2.0, 260/230≥1.7, 浓度≥40 μg/ml)、PCR array产品型号、qPCR内参基因(GAPDH)、最少生物学和技术重复数 阅读提示:Materials and Methods - RNA extraction, PCR array and qPCR analysis |
| Western blot | 蛋白提取方法(TDLB缓冲液)、上样量(30 μg)、一抗稀释比例及孵育条件、二抗稀释比例及孵育时间、内参(GAPDH) 阅读提示:Materials and Methods - Protein extraction, Western blotting |