构建PtenΔTKV小鼠模型
验证PDZ-BD在体内的作用
通过基因打靶删除Pten基因中编码PDZ-BD的9个核苷酸,生成PtenΔTKV小鼠,并与HPRT-Cre杂交去除neo cassette。
Pten regulates spindle pole movement through Dlg1-mediated recruitment of Eg5 to centrosomes.
包含体外细胞实验(MEF、HT1299、HeLa)、基因敲除小鼠模型(PtenΔTKV)、自发肿瘤和诱导肿瘤模型(Eμ-Myc、KrasLA1、DMBA),并进行功能验证和机制验证。
PtenΔTKV/ΔTKV小鼠来源的MEF和脾细胞 Dlg1−/− MEF HT1299非小细胞肺癌细胞系 PtenΔTKV/ΔTKV小鼠自发肿瘤模型
PtenΔTKV/ΔTKV小鼠的构建及Dlg1−/− MEF的基因型确认 Pten-Dlg1-Eg5复合物的免疫共沉淀及中心体共定位分析 Plk1、Nek9-Nek6、Cdk1对Eg5磷酸化及中心体招募的调控 PtenΔTKV/ΔTKV小鼠肿瘤发生率及与Eμ-Myc、KrasLA1、DMBA模型的肿瘤易感性
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证PDZ-BD在体内的作用
通过基因打靶删除Pten基因中编码PDZ-BD的9个核苷酸,生成PtenΔTKV小鼠,并与HPRT-Cre杂交去除neo cassette。
评估PDZ-BD缺失对染色体分离的影响
对PtenΔTKV/ΔTKV、Pten+/ΔTKV和Dlg1−/− MEFs及脾细胞进行染色体计数、活细胞成像和FISH分析。
确定PDZ-BD缺失是否导致中心体运动缺陷和纺锤体不对称
免疫染色γ-tubulin和α-tubulin,测量前中期中心体距离和纺锤体角度,并利用活细胞成像测量中心体运动速度。
验证Pten通过Dlg1招募Eg5至中心体
通过免疫沉淀和免疫共定位分析Pten、Dlg1和Eg5之间的相互作用;使用shRNA敲低PTEN、DLG1、NEK9、NEK6、CCNB1等。
确定Plk1、Nek9-Nek6、Cdk1对Eg5磷酸化和中心体招募的贡献
使用Plk1抑制剂BI2536、Aurora A抑制剂MLN8054、shRNA敲低CCNB2、NEK9、NEK6,检测中心体PTEN、DLG1、Eg5水平;用Western blot检测Eg5磷酸化。
验证PDZ-BD缺失对自发及诱导肿瘤的影响
对16个月龄WT、Pten+/ΔTKV、PtenΔTKV/ΔTKV小鼠进行肿瘤筛查;与Eμ-Myc、KrasLA1、DMBA模型杂交或处理,统计肿瘤发生率和种类。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| 药物处理 | 莫纳斯罗 | -- | -- |
| BI2536 | Selleck Chemicals | -- | |
| MLN8054 | Selleck Chemicals | -- | |
| 免疫印迹 | 抗Eg5抗体 | Origene | TA301478 |
| 抗Dlg1抗体 | Abcam | ab69737 | |
| 抗Pten抗体 | Cascade BioScience | ABM-2052 | |
| 抗γ-微管蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | T6557 | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | T9026 | |
| 抗HA抗体 | Cell Signaling Technology | 3724 | |
| 抗Myc标签抗体 | Cell Signaling Technology | 2276S | |
| 抗磷酸化Eg5T927抗体 | BioLegend | 620502 | |
| 抗磷酸化Eg5S1033抗体 | -- | -- | |
| 抗AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 9272 | |
| 抗磷酸化AKT T308抗体 | Cell Signaling Technology | 2965 | |
| 抗磷酸化AKT S473抗体 | Cell Signaling Technology | 9271 | |
| 抗Cdh1抗体 | Abcam | ab3242 | |
| 抗Cdc27抗体 | BD Biosciences | 610455 | |
| 抗p53抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-6243 | |
| 抗Plk1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-8358 | |
| 抗Aurora B抗体 | BD Biosciences | 611083 | |
| 抗磷酸化Aurora T232抗体 | Cell Signaling Technology | 2914 | |
| 抗细胞周期蛋白B1抗体 | Cell Signaling Technology | 4138 | |
| 抗细胞周期蛋白B2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-22776 | |
| 抗4E-BP1抗体 | Cell Signaling Technology | 9451 | |
| 抗S6K抗体 | Cell Signaling Technology | 9234 | |
| 抗NEK6抗体 | Abcam | 133494 | |
| 抗NEK9抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-100401 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | A5441 | |
| 抗磷酸化组蛋白H3Ser10抗体 | Millipore | 06-570 | |
| 抗B220抗体 | BD Biosciences | 550286 | |
| 抗CD3抗体 | Abcam | ab5690 | |
| DNA纤维分析 | CIdU | Sigma-Aldrich | C6891 |
| IdU | Sigma-Aldrich | I7125 | |
| 免疫荧光 | 抗磷酸化组蛋白H2AX抗体 | Millipore | 05-636 |
| 抗53BP1抗体 | Novus Biologicals | NB100-305 | |
| 抗磷酸化CenpA抗体 | Millipore | 04-792 | |
| 抗着丝粒抗体 | Antibodies Incorporated | 15-234-0001 | |
| 抗磷酸化Knl1抗体 | -- | -- | |
| AlexaFluor 488标记的山羊抗大鼠IgG | Molecular Probes | -- | |
| AlexaFluor 594标记的山羊抗小鼠IgG | Molecular Probes | -- | |
| 显微镜成像 | LSM 510激光扫描共聚焦显微镜 | Carl Zeiss | -- |
| LSM 780激光扫描共聚焦显微镜 | Carl Zeiss | -- | |
| Axiovert 100 M倒置显微镜 | Zeiss | -- | |
| 统计分析 | GraphPad Prism 6.0 | GraphPad | -- |
| Microsoft Excel | Microsoft | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型 | PtenΔTKV/ΔTKV小鼠的遗传背景(129Sv/E × C57BL/6);小鼠饲养环境(无特定病原体屏障);伦理审查(IACUC) 阅读提示:Methods: Mouse strains |
| 细胞培养 | HT1299细胞培养条件(RPMI培养基+10% FCS);MEFs原代培养方法;细胞系身份验证(STR分析) 阅读提示:Methods: Cell culture |
| 染色体分离分析 | MEFs解冻时间和代数(P5);秋水仙胺处理浓度和时间;活细胞成像的细胞密度和拍摄频率;染色体计数标准(50个中期分裂相) 阅读提示:Methods: Aneuploidy analyses; Live-cell imaging |
| 中心体运动分析 | 细胞固定和透化条件(PTEN/DLG1染色需先用PHEM透化);γ-tubulin和α-tubulin抗体稀释倍数;中心体距离和纺锤体角度测量标准 阅读提示:Methods: Centrosome separation and spindle geometry measurements |
| 蛋白相互作用分析 | 免疫沉淀所用抗体(anti-Pten, anti-Dlg1, anti-Eg5);裂解液成分和洗涤条件;免疫印迹检测的磷酸化修饰位点(Thr926, Ser1033) 阅读提示:Methods: Western blot analysis, immunoprecipitations |
| 肿瘤发生分析 | 自发肿瘤观察时间(16个月);DMBA剂量和处理方案;肿瘤类型和组织病理学分析;Eμ-Myc和KrasLA1杂交策略 阅读提示:Methods: Mouse strains |