抗原表位定位
确定TR1单抗在TRAIL-R1胞外域上的结合位点
将TRAIL-R1胞外域分为8个重叠片段,通过细菌展示和流式筛选TR1-mAbs结合片段;进一步细分P5片段并构建丙氨酸突变体以确定关键氨基酸。
Identification of Novel Epitopes with Agonistic Activity for the Development of Tumor Immunotherapy Targeting TRAIL-R1.
包含表位定位(细菌展示和流式)、细胞凋亡检测(MTT、Annexin V/PI)、Western blot通路分析以及体内异种移植瘤模型,多层级且含机制验证。
HeLa细胞 SW480细胞 BALB/cA-nude小鼠皮下移植瘤模型
TR1-419和TR1-422抗体的IgG和IgM形式 表位序列TR1-419e(15aa)和TR1-422e(5aa) 关键氨基酸残基(G153等)对结合特异性的影响 抗体浓度和孵育时间(如1μg/ml, 6-48h) 体内给药剂量(12.5 mg/kg, i.v.)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定TR1单抗在TRAIL-R1胞外域上的结合位点
将TRAIL-R1胞外域分为8个重叠片段,通过细菌展示和流式筛选TR1-mAbs结合片段;进一步细分P5片段并构建丙氨酸突变体以确定关键氨基酸。
评估IgG和IgM型TR1抗体与肿瘤细胞表面TRAIL-R1的结合能力
用流式细胞术检测TR1-IgGs和TR1-IgMs与HeLa和SW480细胞的结合,并比较其荧光强度。
比较IgG和IgM型TR1抗体的细胞毒性
用MTT法检测TR1-IgGs(有无交联抗体)和TR1-IgMs单独处理后的细胞活力;用Annexin V/PI染色检测早期凋亡。
考察TR1抗体是否干扰TRAIL与TRAIL-R1的结合及凋亡诱导
用不同浓度sTRAIL预处理细胞,检测TR1-IgMs结合的变化;用MTT法检测TR1-IgMs与TRAIL联合处理后的细胞活力。
阐明TR1抗体激活凋亡的分子机制
用Western blot检测凋亡相关蛋白的表达和切割情况。
评估TR1-IgMs在异种移植模型中的肿瘤抑制作用
在裸鼠皮下接种HeLa细胞形成移植瘤,当肿瘤体积达100 mm3时静脉注射TR1-IgGs或IgMs,观察肿瘤生长和肿瘤组织学变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Applichem | -- |
| 流式细胞术 | FITC标记的山羊抗人IgG抗体 | -- | -- |
| APC标记的抗人IgM抗体 | Biolegend | -- | |
| 凋亡检测 | Annexin-V结合缓冲液 | BD Pharmingen | -- |
| Western blot | 抗caspase-8抗体 | Cell Signaling Technology | 9746S |
| 抗caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9662S | |
| 抗caspase-7抗体 | Cell Signaling Technology | 9494S | |
| 抗PARP抗体 | Cell Signaling Technology | 9532S | |
| 抗Smac抗体 | Cell Signaling Technology | 15108S | |
| 抗Bid抗体 | Cell Signaling Technology | 2002S | |
| 抗Bax抗体 | Cell Signaling Technology | 2774S | |
| 抗β-actin抗体 | Abcam | ab119716 | |
| HRP标记的山羊抗兔二抗 | Biosharp | -- | |
| 山羊抗小鼠二抗 | Bioss | -- | |
| 体内实验 | BALB/cA裸鼠 | SLAC Laboratory | -- |
| 免疫组化 | 抗TRAIL-R1抗体 | Abcam | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系、培养基、血清浓度、培养条件(37°C, 5% CO2) 阅读提示:Materials and Methods - Cells and cell culture |
| 表位鉴定 | TRAIL-R1 cDNA来源、肽段设计(P1-P8)、抗体浓度、孵育时间、流式细胞计数 阅读提示:Materials and Methods - Analysis of antigenic binding sites of mAbs to TRAIL-R1;Figure 1 legend |
| 结合活性检测 | 抗体浓度、二抗荧光标记、孵育时间 阅读提示:Materials and Methods - Flow cytometry analysis |
| 凋亡实验 | 细胞密度、抗体浓度、处理时间、MTT读数时间 阅读提示:Materials and Methods - Cell viability assays |
| Western blot | 抗体浓度、孵育时间、ECL检测 阅读提示:Materials and Methods - Western blot analysis |
| 体内实验 | 小鼠品系、性别、周龄、细胞接种数、给药剂量和途径、治疗时间 阅读提示:Materials and Methods - Analysis of tumoricidal activity in vivo;Figure 6 legend |