构建PDGFRβ+细胞特异性Lamc1敲除小鼠模型
研究PDGFRβ+细胞来源的层粘连蛋白在体内的功能。
通过将Lamc1 floxed小鼠与Pdgfrβ-Cre转基因小鼠杂交,获得条件性敲除小鼠(PKO),并验证敲除的特异性(PDGFRβ+细胞中laminin γ1表达缺失,而卫星细胞和FAPs保留)。
Laminin regulates PDGFRβ(+) cell stemness and muscle development.
包含条件性敲除小鼠模型、细胞增殖/分化实验、RNAseq分析、外源蛋白回补实验等多层级验证,明确功能与机制。
PDGFRβ+细胞条件性敲除小鼠(PKO) 原代PDGFRβ+细胞(含周细胞和PICs) 野生型卫星细胞共培养体系 dyW(Lama2缺陷)小鼠
PDGFRβ+细胞特异性敲除Lamc1的验证:Pdgfrβ-Cre与Ai14报告基因共定位,确认敲除靶向周细胞和PICs。 PKO小鼠肌肉病理表型:出生后约P10开始出现,与Lama2缺陷小鼠类似(肌肉坏死、纤维化、炎症细胞浸润)。 外源laminin-111的注射剂量和方式:100 μg/ml, 50 μl,每日肌内注射,持续14天或60天。 RNAseq分析条件:PDGFRβ+细胞来自15-20只小鼠,三个配对样本,FC>64且至少20个reads。 gpihbp1功能验证:使用shRNA敲低和过表达,检测perilipin和S-Myosin表达变化。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
研究PDGFRβ+细胞来源的层粘连蛋白在体内的功能。
通过将Lamc1 floxed小鼠与Pdgfrβ-Cre转基因小鼠杂交,获得条件性敲除小鼠(PKO),并验证敲除的特异性(PDGFRβ+细胞中laminin γ1表达缺失,而卫星细胞和FAPs保留)。
评估层粘连蛋白缺失对肌肉结构和功能的影响。
通过体重、存活率、肌肉重量、H&E染色、免疫组化(CD3、F4/80、CD31)、电镜等方法,观察PKO小鼠的肌肉病理变化。
探究层粘连蛋白对PDGFRβ+细胞增殖的影响。
体内外Edu掺入实验检测PDGFRβ+细胞增殖;使用CTX和氯化钡诱导肌肉损伤模型,观察外源laminin对增殖的抑制。
确定层粘连蛋白对PDGFRβ+细胞分化的调控。
体外诱导肌生成和脂肪生成,检测S-Myosin和perilipin表达;共培养实验验证融合能力。
寻找介导层粘连蛋白效应的下游靶基因。
对对照和PKO PDGFRβ+细胞进行RNAseq,筛选差异表达基因;验证gpihbp1表达变化,并通过敲低/过表达实验验证其功能。
评估层粘连蛋白对肌营养不良的治疗潜力。
对PKO小鼠进行laminin-111肌内注射,分析肌肉重量、组织学、分子标志物(gpihbp1、S-Myosin、E-Myosin、perilipin)和功能(BMS、悬挂测试)。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 周细胞培养基 | ScienCell | 1201 |
| 脂肪生成分化培养基 | STEMCELL | 05501, 05503 | |
| II型胶原酶 | Worthington | LS004176 | |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 胰蛋白酶/EDTA | -- | -- | |
| 细胞分离 | 红细胞裂解液 | -- | -- |
| 细胞分选 | PDGFRβ-PE抗体 | eBioscience | 12-1402 |
| CD45-FITC抗体 | eBioscience | 11-0451 | |
| CD31-FITC抗体 | eBioscience | 11-0311 | |
| 生物素标记SM/C-2.6抗体 | Dr So-ichiro Fukada | -- | |
| Sca1-FITC抗体 | eBioscience | 11-5981 | |
| 链霉亲和素-APC | eBioscience | 17-4317 | |
| PDGFRα-APC抗体 | eBioscience | 17-1401 | |
| CD34-生物素抗体 | eBioscience | 13-0341 | |
| Sca1-PE抗体 | eBioscience | 12-5981 | |
| Trizol试剂 | Life Technologies | 15596026 | |
| BD FACS Aria-II分选仪 | BD | -- | |
| Sony SH800分选仪 | Sony | -- | |
| 增殖实验 | Click-iT Plus EdU Alexa Fluor 594成像试剂盒 | Life Technologies | C10639 |
| 层粘连蛋白-111 | Invitrogen | 23017-015 | |
| 肌生成分化 | 抗S-肌球蛋白抗体(MF20) | DSHB | MF20 |
| Zeiss LSM 710共聚焦显微镜 | Zeiss | -- | |
| RNAseq分析 | RNeasy Plus Mini试剂盒 | Qiagen | 74134 |
| Agilent 2100生物分析仪 | Agilent | -- | |
| SMARTer超低输入RNA cDNA制备试剂盒 | Clontech | -- | |
| HiSeq 2500测序仪 | Illumina | -- | |
| RT-PCR | SuperScript III第一链合成系统 | Invitrogen | 18080-051 |
| 慢病毒包装 | TRC慢病毒shRNA构建体 | TRC | TRCN0000178358, TRCN0000178162, TRCN0000182215, TRCN0000177537 |
| psPAX2包装质粒 | Addgene | -- | |
| pMD2.G包膜质粒 | Addgene | -- | |
| HEK293T细胞 | ATCC | CRL-3216 | |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Life Technologies | -- | |
| pLenti-GIII-EF1α载体(LV172809) | Applied Biological Materials | LV172809 | |
| 慢病毒感染 | 聚凝胺 | -- | -- |
| 动物处理 | 心脏毒素 | -- | -- |
| 氯化钡 | -- | -- | |
| 免疫组化/免疫细胞化学 | 抗层粘连蛋白γ1抗体(AB3297) | Abcam | AB3297 |
| 抗层粘连蛋白γ1抗体(RT-795-P0) | NeoMarkers | RT-795-P0 | |
| 抗层粘连蛋白-111抗体 | Sigma | L9393 | |
| 抗CD3抗体 | eBioscience | 14-0032 | |
| 抗F4/80-生物素抗体 | eBioscience | 13-4801 | |
| 抗PDGFRα抗体 | eBioscience | 14-1401 | |
| 抗PEG3/PW1抗体 | Bioss | bs-1870R | |
| 抗裂解caspase-3抗体 | Cell Signaling | 9661 | |
| 抗CD13-FITC抗体 | BD Pharmingen | 558744 | |
| 抗CD31抗体 | BD Pharmingen | 553370 | |
| 抗CD31-FITC抗体 | BD Pharmingen | 553372 | |
| 抗CD45-FITC抗体 | eBioscience | 11-0451 | |
| 抗SMA-FITC抗体 | Sigma | F3777 | |
| 抗SM/C-2.6抗体 | Dr So-ichiro Fukada | -- | |
| 抗Pax7抗体 | DSHB | Pax7 | |
| 抗ALP抗体 | R&D | AF2910 | |
| 抗成纤维细胞抗体 | Acris Antibodies | BM4018 | |
| 抗PDGFRβ抗体 | eBioscience | 14-1402 | |
| 抗S-肌球蛋白抗体(MF-20) | DSHB | MF-20 | |
| 抗E-肌球蛋白抗体 | DSHB | GTX113561 | |
| 抗脂滴包被蛋白抗体 | Sigma | P1998 | |
| 抗Ki67抗体 | Millipore | AB9260 | |
| Axiovert 200显微镜 | Zeiss | -- | |
| 组织学 | 伊红 | Sigma | HT-110132 |
| 油红O | Sigma | O1391 | |
| VECTASHIELD封片剂 | Vector Lab | H-1000 | |
| 蛋白质印迹 | Bio-Rad蛋白定量试剂盒 | Bio-Rad | -- |
| Tris-甘氨酸微型蛋白凝胶 | Life Technologies | -- | |
| 聚偏二氟乙烯膜 | Millipore | -- | |
| 抗gpihbp1抗体 | Thermo Scientific | PA1-16976 | |
| 抗GAPDH抗体 | Abcam | ab9484 | |
| HRP标记二抗 | Jackson ImmunoResearch Lab | -- | |
| SuperSignal West Pico化学发光底物 | Pierce | -- | |
| TUNEL分析 | 细胞死亡原位检测试剂盒,TMR红色 | Roche | -- |
| 电镜分析 | Reichert-Jung Ultracut E超薄切片机 | Reichert-Jung | -- |
| JEOL100CXII透射电镜 | JEOL | -- | |
| 统计分析 | SPSS统计软件 | IBM | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型构建 | PDGFRβ+细胞特异性敲除Lamc1的验证:确认Cre重组酶特异性靶向周细胞和PICs,而非卫星细胞或FAPs。 阅读提示:见图2和Figure 2 legend,及Results“Loss of PDGFRβ+ cell-derived laminin leads to MD”部分。 |
| 增殖实验 | 体外增殖实验中laminin-111的浓度(5 μg/ml)和处理时间(3天);体内Edu注射剂量和时间(0.1 mg/ml, 100 μl, 24小时)。 阅读提示:见图4和Figure 4 legend,及Methods“Proliferation assays”部分。 |
| 肌生成分化实验 | 肌生成分化培养基成分(DMEM+2%马血清+1%青霉素/链霉素)及分化时间(15天);共培养实验中生长培养基和分化培养基的切换时间。 阅读提示:见图5和Figure 5 legend,及Methods“In vitro myogenic differentiation assays”部分。 |
| 脂肪生成分化实验 | 脂肪生成分化培养基成分(MesenCult Basal Medium+Adipogenic Stimulatory Supplement)及分化时间(20天);laminin-111浓度(5 μg/ml)。 阅读提示:见图6和Figure 6 legend,及Methods“In vitro adipogenic differentiation assay”部分。 |
| RNAseq分析 | 样本量:从15-20只小鼠(2-4月龄)分选PDGFRβ+细胞,三个独立分选合并为一个样本;筛选标准:FC>64且至少20 raw counts。 阅读提示:见图7和Figure 7 legend,及Methods“RNAseq analysis”部分。 |
| gpihbp1功能验证 | shRNA构体编号(TRCN0000178358等)和MOI(10);过表达载体(pLenti-GIII-EF1α)。 阅读提示:见图7和Figure 7 legend,及Methods“Gpihbp1 knockdown or overexpression”部分。 |
| 外源laminin治疗 | laminin-111浓度(100 μg/ml)和注射体积(50 μl),每日注射,持续14或60天;注射部位(后肢肌肉)。 阅读提示:见图8和Figure 8 legend,及Methods“Animal treatments”部分。 |
| 肌肉功能测试 | BMS评分系统和HLS测试的具体参数(悬挂时间、拉力次数、HLS评分)。 阅读提示:见图8和Figure 8 legend,及Methods“Hindlimb suspension test”和“BMS test”部分。 |