构建Srxn1敲低模型
验证shRNA对Srxn1的敲低效率,并确认在OGD或H2O2条件下敲低效果
利用慢病毒载体转染shRNA敲低原代大鼠皮层星形胶质细胞中的Srxn1,并通过Western blot和RT-qPCR检测敲低效率。
Sulfiredoxin-1 exerts anti-apoptotic and neuroprotective effects against oxidative stress-induced injury in rat cortical astrocytes following exposure to oxygen-glucose deprivation and hydrogen peroxide.
包含体外细胞模型、shRNA敲低功能验证、多种凋亡检测、线粒体通路蛋白分析及内质网通路排除实验。
原代大鼠皮层星形胶质细胞 OGD或H2O2处理模型
Srxn1 shRNA敲低效率(蛋白及mRNA水平) 细胞分组:对照、NC、sh-Srxn1,及各自OGD/H2O2处理 OGD暴露4小时,随后复氧24小时;H2O2浓度100 μM,处理6小时 细胞活力(MTS)、LDH释放、凋亡(Hoechst/流式)检测
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证shRNA对Srxn1的敲低效率,并确认在OGD或H2O2条件下敲低效果
利用慢病毒载体转染shRNA敲低原代大鼠皮层星形胶质细胞中的Srxn1,并通过Western blot和RT-qPCR检测敲低效率。
模拟脑缺血诱导的氧化应激损伤,用于后续功能研究
将转染后的细胞分别暴露于OGD 4小时和100 μM H2O2 6小时,诱导损伤。
评估Srxn1敲低对OGD或H2O2诱导的细胞活力和损伤的影响
使用MTS assay检测细胞活力,LDH assay检测细胞损伤。
评估Srxn1敲低对OGD或H2O2诱导的细胞凋亡的影响
使用Hoechst 33342染色和流式细胞术(Annexin V-FITC/PI双染)检测凋亡细胞比例。
探究Srxn1敲低是否激活线粒体凋亡途径
使用JC-1染色检测Δψm,Western blot检测Cyt.C、caspase-3、caspase-9、PARP、Bax、Bcl-2蛋白表达。
排除内质网应激途径参与Srxn1敲低效应
用Fluo-3 AM检测[Ca2+]i,Western blot检测caspase-12表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Gibco | -- |
| 无糖DMEM培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清(FBS) | Gibco | -- | |
| 多聚赖氨酸 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 药物处理 | 过氧化氢 | Sigma-Aldrich | -- |
| 凋亡检测 | JC-1染料 | Molecular Probes, Invitrogen | -- |
| 钙离子检测 | Fluo-3 AM | Molecular Probes, Invitrogen | -- |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC/碘化丙啶(PI) | Molecular Probes, Invitrogen | -- |
| 细胞活力检测 | MTS试剂 | Promega | -- |
| 细胞培养 | Hank's溶液 | HyClone | -- |
| 胰蛋白酶 | HyClone | -- | |
| 凋亡检测 | Hoechst 33342染料 | Beyotime | -- |
| 缓冲液 | 磷酸盐缓冲液(PBS) | Beyotime | -- |
| 细胞培养 | 青霉素/链霉素(Pen/Strep) | Beyotime | -- |
| 细胞损伤检测 | LDH检测试剂盒 | Roche | -- |
| 蛋白提取 | PRO-PREP™裂解液 | Beyotime | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | -- | |
| 蛋白定量 | BCA蛋白测定试剂盒 | Beyotime | -- |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | -- |
| 抗Srxn1抗体 | Bioss | bs-8329R | |
| 抗细胞色素c抗体 | Abcam | ab92509 | |
| 抗caspase-3抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-7148 | |
| 抗caspase-9抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-8355 | |
| 抗caspase-12抗体 | Bioss | bs-1105R | |
| 抗PARP抗体 | Abcam | ab6070 | |
| 抗Bax抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-6236 | |
| 抗Bcl-2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-492 | |
| 抗β-actin抗体 | Bioworld Technology | AP0060 | |
| HRP标记二抗 | Bioworld Technology | BS10350, | |
| 化学发光检测系统 | Bio-Rad | -- | |
| RNA提取 | RNAiso Plus试剂 | Takara | -- |
| RT-qPCR | PrimeScript™ RT试剂盒(Perfect Real-Time) | Takara | -- |
| SYBR® Premix Ex Taq™ | Takara | -- | |
| 细胞活力检测 | CellTiter 96 AQueous One Solution细胞增殖检测试剂 | Promega | -- |
| 仪器 | Thermo 3111培养箱 | Thermo Scientific | -- |
| 酶标仪 | Bio-Rad | -- | |
| 荧光显微镜(Olympus BX51) | Olympus | -- | |
| 流式细胞术 | 流式细胞仪 | 文中未明确说明 | -- |
| 共聚焦显微镜 | 激光共聚焦显微镜(Nikon TiE) | Nikon | -- |
| 统计分析 | SPSS 17.0软件 | SPSS, Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 原代大鼠皮层星形胶质细胞的培养条件,包括DMEM/F12培养基、10% FBS、1% Pen/Strep、多聚赖氨酸包被、37°C、5% CO2,细胞纯度>90% 阅读提示:参见Materials and methods部分'Primary culture of rat cortical astrocytes' |
| 基因敲低 | Srxn1 shRNA序列、转染条件(1 μl/1×10^4细胞,60-80%汇合度,感染约24h,转染约72h) 阅读提示:参见Materials and methods部分'Transfection with short hairpin RNA (shRNA) against Srxn1' |
| 损伤模型 | OGD暴露4小时,随后复氧/复糖24小时;H2O2浓度100 μM,处理6小时 阅读提示:参见Materials and methods部分'Cell groups and exposure to OGD or H2O2' |
| 细胞活力与损伤检测 | MTS assay、LDH assay的具体操作步骤和检测波长 阅读提示:参见Materials and methods部分'MTS assay'和'LDH assay' |
| 凋亡检测 | Hoechst 33342染色和Annexin V-FITC/PI双染流式细胞术的详细步骤,包括细胞数、孵育时间 阅读提示:参见Materials and methods部分'Hoechst staining'和'Flow cytometric analysis' |
| 线粒体功能检测 | JC-1染色浓度(10 μg/ml)和孵育时间(30分钟),用于检测Δψm 阅读提示:参见Materials and methods部分'Measurement of mitochondrial transmembrane potential (Δψm)' |