亚克隆建立与侵袭性评估
从亲本细胞系中筛选高侵袭性和低侵袭性亚克隆以研究SPARC与侵袭表型的关系。
通过有限稀释法从HeLa和SiHa细胞系中获得亚克隆,利用细胞电泳仪测量电泳迁移率,并通过MTT、软琼脂克隆形成、迁移和侵袭实验以及裸鼠移植瘤实验评估其侵袭性。
Targeting SPARC by lentivirus-mediated RNA interference inhibits cervical cancer cell growth and metastasis.
包含体外细胞系亚克隆分离、功能实验(增殖、凋亡、迁移侵袭)、体内裸鼠移植瘤和肺转移模型,并通过qRT-PCR、Western blot和流式细胞术验证机制。
HeLa-1高侵袭亚克隆 SiHa-1高侵袭亚克隆 HeLa-25低侵袭亚克隆 SiHa-23低侵袭亚克隆 BALB/C-nu/nu裸鼠异种移植和尾静脉转移模型
细胞系:HeLa和SiHa及其亚克隆 SPARC shRNA靶序列:5′-AACAAGACCTTCGACTCTTCC-3′ 慢病毒感染MOI=60,感染时间24小时 细胞周期分析中PI染色浓度50 μg/ml和RNase 250 μg/ml 体内实验中皮下接种5.0×10^6细胞,尾静脉注射每周一次连续3周 肿瘤体积计算公式:0.5 × length × width^2
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从亲本细胞系中筛选高侵袭性和低侵袭性亚克隆以研究SPARC与侵袭表型的关系。
通过有限稀释法从HeLa和SiHa细胞系中获得亚克隆,利用细胞电泳仪测量电泳迁移率,并通过MTT、软琼脂克隆形成、迁移和侵袭实验以及裸鼠移植瘤实验评估其侵袭性。
比较SPARC在高侵袭和低侵袭亚克隆中的表达差异。
通过qRT-PCR、Western blot和ICC检测SPARC mRNA和蛋白水平。
验证慢病毒介导的shRNA有效敲低SPARC表达。
构建SPARC shRNA慢病毒载体并感染HeLa-1和SiHa-1细胞,通过GFP荧光、qRT-PCR、Western blot和ICC验证敲低效率。
评估SPARC敲低对细胞增殖和细胞周期的影响。
通过MTT、软琼脂克隆形成和流式细胞术分析细胞增殖和周期分布。
评估SPARC敲低对细胞凋亡的影响。
使用Annexin V-PI染色和流式细胞术检测凋亡细胞比例。
评估SPARC敲低对细胞迁移和侵袭能力的影响。
使用Transwell实验,分别使用无Matrigel和有Matrigel的腔室检测迁移和侵袭。
在体内评估SPARC敲低对肿瘤生长和肺转移的影响。
将SPARC shRNA感染的HeLa-1细胞皮下注射或尾静脉注射裸鼠,监测肿瘤体积和肺转移。
探究SPARC调控增殖、凋亡和侵袭的分子机制。
通过qRT-PCR、Western blot和酶谱法检测相关基因和蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco BRL | -- |
| RPMI-1640培养基 | -- | -- | |
| RNA干扰 | 慢病毒载体 | GeneChem | -- |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| 实时荧光定量PCR | ABI PRISM 7500实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- |
| Power SYBR Green PCR预混液 | Applied Biosystems | -- | |
| Western blot | RIPA裂解缓冲液 | -- | -- |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| SPARC抗体 | R&D Systems | AF941 | |
| PCNA抗体 | BIOSS | bs-0754R | |
| 细胞周期蛋白D1抗体 | BIOSS | bs-0623R | |
| P53抗体 | BIOSS | bs-0033R | |
| P21抗体 | BIOSS | bs-0741R | |
| Bax抗体 | BIOSS | bs-0127R | |
| Bcl-2抗体 | BIOSS | bs-0032R | |
| 增强化学发光 | -- | -- | |
| 免疫细胞化学 | SPARC抗体 | R&D Systems | AF941 |
| 细胞增殖 | MTT试剂 | -- | -- |
| 二甲基亚砜 | -- | -- | |
| Sea Plague琼脂 | -- | -- | |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC | -- | -- |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| 细胞周期 | 碘化丙啶 | -- | -- |
| 核糖核酸酶 | -- | -- | |
| 细胞侵袭 | Transwell小室 | BD Biosciences | -- |
| Matrigel基质胶 | -- | -- | |
| 动物实验 | BALB/C-nu/nu裸鼠 | -- | -- |
| 流式分析 | FITC标记的单克隆抗体 | -- | -- |
| 酶谱法 | 明胶 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与亚克隆建立 | 细胞系来源(HeLa、SiHa购自上海生命科学研究院);培养条件(DMEM含10%胎牛血清);有限稀释法密度10 cells/ml,96孔板每孔0.1 ml;培养时间2-3周;亚克隆命名及筛选标准(电泳迁移率),详见Methods。 阅读提示:Methods 部分 'Cell lines' 和 'Isolation of HeLa and SiHa cell subclones' |
| RNA干扰 | SPARC shRNA靶序列(5′-AACAAGACCTTCGACTCTTCC-3′),对照序列(5′-TTCTCCGAACGTGTCACGT-3′);感染MOI=60,时间24小时;感染后培养4天;GFP阳性率>80%确认感染效率。 阅读提示:Methods 部分 'RNA interference' |
| 基因表达检测 | qRT-PCR引物序列(表1);Western blot上样量50 μg/孔,一抗稀释度1:1000;ICC抗体工作浓度15 μg/ml。 阅读提示:Methods 部分 'Real-time quantitative RT-PCR (q-RT-PCR)'、'Western blot'、'Immunocytochemistry (ICC)',以及表1 |
| 细胞功能实验 | MTT实验:加MTT 20 μl(5 mg/ml)37°C孵育4小时,DMSO溶解,测定570 nm;软琼脂克隆形成:底层1.2%琼脂,顶层0.7%琼脂,细胞密度5×10^3/ml,培养14天;凋亡检测:Annexin V-FITC 10 μl,PI 5 μl;周期分析:PI 50 μg/ml和RNase 250 μg/ml孵育30分钟;迁移侵袭实验:Matrigel稀释比例1:3,包被50 μl/孔,细胞数2×10^5,孵育12小时;每组至少三次重复。 阅读提示:Methods 部分 'Cell proliferation assays'、'Annexin V-PI assays for apoptosis'、'Analysis of cell cycle distribution'、'Cell invasion assay and migration assay' |
| 体内实验 | 裸鼠品系(BALB/C-nu/nu雌性5周龄);皮下注射5×10^6细胞(n=4);尾静脉注射每周一次连续3周(n=8);观察时间皮下2个月,尾静脉3个月;肿瘤体积计算0.5×长×宽^2;小鼠饲养条件。 阅读提示:Methods 部分 'Tumor xenografts in nude mice' |
| 机制探究 | 下游基因检测包括p53/p21、Bcl-2/Bax、MMP2/MMP9、E-cadherin等;酶谱法(zymography)上样量20 μg蛋白,凝胶中明胶浓度0.1 mg/ml。 阅读提示:Methods 部分 'Zymography' 和 Results 部分 'Downstream molecules of SPARC in cervical cancer cell' |
| 统计分析 | 两组间比较用双尾t检验,三组间用单因素方差分析(one-way ANOVA),P<0.05为显著;数据表示为mean±SE。 阅读提示:Methods 部分 'Statistical analysis' |